Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 AC133283.1-201ENSMUST00000228443 859 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Vps8Q0P5W1 AC127371.1-201ENSMUST00000228516 312 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Vps8Q0P5W1 Mir132-201ENSMUST00000083603 66 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Vps8Q0P5W1 Gm281-201ENSMUST00000144914 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Vps8Q0P5W1 Nlrp4e-201ENSMUST00000076470 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Vps8Q0P5W1 Olfr617-203ENSMUST00000216516 3083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Vps8Q0P5W1 Skint5-204ENSMUST00000171627 1611 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Vps8Q0P5W1 Gprc6a-201ENSMUST00000020062 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Vps8Q0P5W1 4930525G20Rik-201ENSMUST00000181912 2987 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Vps8Q0P5W1 Lpp-202ENSMUST00000078988 15440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Vps8Q0P5W1 Malrd1-201ENSMUST00000146205 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Vps8Q0P5W1 Rptn-201ENSMUST00000045912 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Vps8Q0P5W1 Gm37195-201ENSMUST00000192006 3018 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Vps8Q0P5W1 Gm23365-201ENSMUST00000175019 125 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Vps8Q0P5W1 Gm25960-201ENSMUST00000175110 125 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Vps8Q0P5W1 Gm44453-201ENSMUST00000175161 126 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Vps8Q0P5W1 Gm25195-201ENSMUST00000177656 126 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Vps8Q0P5W1 Gm5974-201ENSMUST00000181607 986 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Vps8Q0P5W1 Trdv1-202ENSMUST00000187163 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Vps8Q0P5W1 Gm44099-201ENSMUST00000203299 112 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Vps8Q0P5W1 n-R5s54-201ENSMUST00000083837 112 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Vps8Q0P5W1 Cnot6l-210ENSMUST00000155901 8564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Vps8Q0P5W1 Tmem45a-201ENSMUST00000023435 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Vps8Q0P5W1 Stap1-206ENSMUST00000198435 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Vps8Q0P5W1 Gm8297-202ENSMUST00000171964 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Vps8Q0P5W1 Abca12-201ENSMUST00000087268 9137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Vps8Q0P5W1 Olfr843-203ENSMUST00000214267 7071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Vps8Q0P5W1 Gm37902-201ENSMUST00000192839 1683 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Vps8Q0P5W1 Gm43317-201ENSMUST00000197924 2544 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Vps8Q0P5W1 Cnot1-202ENSMUST00000098473 8390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Vps8Q0P5W1 Gm14806-201ENSMUST00000116606 2110 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Vps8Q0P5W1 1700034E13Rik-202ENSMUST00000118724 490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Vps8Q0P5W1 Cyp4b1-ps2-201ENSMUST00000119563 333 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Vps8Q0P5W1 Gm23499-201ENSMUST00000157736 268 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Vps8Q0P5W1 Gm10357-201ENSMUST00000159886 264 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Vps8Q0P5W1 Il1rl1-205ENSMUST00000174335 1216 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Vps8Q0P5W1 Gm4644-201ENSMUST00000197587 400 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Vps8Q0P5W1 Nasp-ps1-201ENSMUST00000205050 691 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Vps8Q0P5W1 AL590503.1-201ENSMUST00000222053 321 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Vps8Q0P5W1 Rpl32-ps-201ENSMUST00000091052 506 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Vps8Q0P5W1 Gm12888-201ENSMUST00000097905 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Vps8Q0P5W1 Gm26791-201ENSMUST00000180942 1605 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Vps8Q0P5W1 Zfp72-201ENSMUST00000091481 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Vps8Q0P5W1 Ankrd34c-201ENSMUST00000060700 5457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Vps8Q0P5W1 Olfr947-ps1-201ENSMUST00000214075 2165 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Vps8Q0P5W1 BB287469-201ENSMUST00000110149 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Vps8Q0P5W1 Gm4027-201ENSMUST00000164838 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Vps8Q0P5W1 Gm7618-201ENSMUST00000121643 171 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Vps8Q0P5W1 Gm15848-202ENSMUST00000125056 832 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Vps8Q0P5W1 Gm24505-201ENSMUST00000157682 126 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Vps8Q0P5W1 Gm23198-201ENSMUST00000158811 91 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Vps8Q0P5W1 Gm7241-201ENSMUST00000159853 357 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Vps8Q0P5W1 Gm22398-201ENSMUST00000174941 125 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Vps8Q0P5W1 Gm25731-201ENSMUST00000175167 125 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Vps8Q0P5W1 Gm21045-201ENSMUST00000183058 1020 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Vps8Q0P5W1 Gm27033-201ENSMUST00000183226 544 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Vps8Q0P5W1 Gm28660-201ENSMUST00000186496 253 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Vps8Q0P5W1 Gm37791-201ENSMUST00000195081 286 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Vps8Q0P5W1 Gm34779-201ENSMUST00000210036 263 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Vps8Q0P5W1 Olfr682-ps1-202ENSMUST00000214399 897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Vps8Q0P5W1 CT030184.2-201ENSMUST00000223064 263 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Vps8Q0P5W1 Olfr1495-201ENSMUST00000061669 1089 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Vps8Q0P5W1 Olfr1505-201ENSMUST00000081520 1103 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Vps8Q0P5W1 Olfr594-201ENSMUST00000098205 1087 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Vps8Q0P5W1 Gm37930-201ENSMUST00000194308 1886 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Vps8Q0P5W1 Olfr330-202ENSMUST00000213188 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Vps8Q0P5W1 Fastkd2-201ENSMUST00000027103 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Vps8Q0P5W1 Olfr351-203ENSMUST00000215137 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Vps8Q0P5W1 Olfr1184-202ENSMUST00000216675 3164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Vps8Q0P5W1 Vmn1r213-203ENSMUST00000228031 3367 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Vps8Q0P5W1 Gm42729-201ENSMUST00000201770 2930 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Vps8Q0P5W1 Olfr741-203ENSMUST00000213903 3305 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Vps8Q0P5W1 Gm15313-201ENSMUST00000119179 282 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Vps8Q0P5W1 Gm23121-201ENSMUST00000157653 173 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Vps8Q0P5W1 Ighv6-5-201ENSMUST00000179796 297 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Vps8Q0P5W1 Obox8-201ENSMUST00000184356 1167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Vps8Q0P5W1 Gm29193-201ENSMUST00000187129 830 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Vps8Q0P5W1 Gm43735-201ENSMUST00000198245 809 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Vps8Q0P5W1 Fbxw15-203ENSMUST00000198397 927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Vps8Q0P5W1 Gm42453-201ENSMUST00000200477 409 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Vps8Q0P5W1 4930598N05Rik-201ENSMUST00000207048 550 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Vps8Q0P5W1 Gm44733-201ENSMUST00000208067 543 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Vps8Q0P5W1 Gm45553-201ENSMUST00000209929 507 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Vps8Q0P5W1 Gm39197-201ENSMUST00000212069 457 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Vps8Q0P5W1 Ang6-201ENSMUST00000096869 444 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Vps8Q0P5W1 Nxf7-201ENSMUST00000033784 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Vps8Q0P5W1 Olfr1034-201ENSMUST00000213496 4882 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Vps8Q0P5W1 Olfr1307-201ENSMUST00000099604 15582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Vps8Q0P5W1 Vmn1r71-204ENSMUST00000227702 5034 ntAPPRIS P2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Vps8Q0P5W1 Olfr38-202ENSMUST00000215796 2782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Vps8Q0P5W1 Abcg3-201ENSMUST00000031239 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Vps8Q0P5W1 Gm5798-201ENSMUST00000164613 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Vps8Q0P5W1 Ifi208-202ENSMUST00000169857 1767 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Vps8Q0P5W1 Gm14308-203ENSMUST00000119149 1458 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Vps8Q0P5W1 Gm14434-202ENSMUST00000120959 1458 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Vps8Q0P5W1 1700017N19Rik-206ENSMUST00000190386 1483 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Vps8Q0P5W1 Cyp3a11-201ENSMUST00000035918 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Vps8Q0P5W1 Gm10330-201ENSMUST00000072014 1354 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Vps8Q0P5W1 Gm20663-201ENSMUST00000176647 474 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Vps8Q0P5W1 Gm37241-201ENSMUST00000191736 523 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.8 ms