Protein–RNA interactions for Protein: Q07968

F13b, Coagulation factor XIII B chain, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13bQ07968 Trbv8-201ENSMUST00000194020 285 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
F13bQ07968 Gm30175-201ENSMUST00000194173 615 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
F13bQ07968 Gm9227-201ENSMUST00000194733 566 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
F13bQ07968 Gm30858-201ENSMUST00000195516 615 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
F13bQ07968 Gm7626-201ENSMUST00000195801 353 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
F13bQ07968 4930539C22Rik-201ENSMUST00000198231 970 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
F13bQ07968 Igkv13-56-1-201ENSMUST00000198481 209 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
F13bQ07968 Gm42750-201ENSMUST00000199745 353 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
F13bQ07968 Gm42799-201ENSMUST00000201331 328 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
F13bQ07968 Gm6009-201ENSMUST00000210848 280 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
F13bQ07968 Gm2829-201ENSMUST00000213121 499 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
F13bQ07968 Tmem45b-204ENSMUST00000217007 783 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
F13bQ07968 Gm5176-202ENSMUST00000220267 583 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
F13bQ07968 CR974592.1-201ENSMUST00000220422 574 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
F13bQ07968 AC123705.4-203ENSMUST00000221566 380 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
F13bQ07968 AC167013.2-202ENSMUST00000227035 333 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
F13bQ07968 AC144628.2-201ENSMUST00000227374 352 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
F13bQ07968 Cetn2-201ENSMUST00000033713 1026 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
F13bQ07968 Olfr1336-201ENSMUST00000056120 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
F13bQ07968 Gm23927-201ENSMUST00000082466 215 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
F13bQ07968 Gm7676-201ENSMUST00000084055 319 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
F13bQ07968 Rpl26-ps2-201ENSMUST00000085379 435 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
F13bQ07968 Gm11808-201ENSMUST00000089430 504 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
F13bQ07968 Defa-ps18-201ENSMUST00000098889 371 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
F13bQ07968 Serpinb5-202ENSMUST00000112729 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
F13bQ07968 Olfr668-202ENSMUST00000215359 3613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
F13bQ07968 Zranb3-201ENSMUST00000086614 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
F13bQ07968 Gm13544-201ENSMUST00000131189 2940 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
F13bQ07968 Ddx4-201ENSMUST00000075748 2762 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
F13bQ07968 Vmn1r90-206ENSMUST00000227566 6901 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.09□□□□□ -1.6
F13bQ07968 Sis-202ENSMUST00000167334 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
F13bQ07968 Rad21l-201ENSMUST00000096439 1650 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
F13bQ07968 Gm4924-203ENSMUST00000210381 3330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
F13bQ07968 Pias1-202ENSMUST00000214830 2492 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
F13bQ07968 Gm5832-201ENSMUST00000121704 1582 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
F13bQ07968 Naip2-201ENSMUST00000067975 4709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
F13bQ07968 Mbnl1-214ENSMUST00000193517 5151 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
F13bQ07968 Macf1-204ENSMUST00000106213 18957 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
F13bQ07968 Gm35066-201ENSMUST00000198898 2074 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
F13bQ07968 Pnpla8-202ENSMUST00000122902 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
F13bQ07968 Spam1-201ENSMUST00000031693 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
F13bQ07968 Fam205a3-201ENSMUST00000178192 3927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
F13bQ07968 Fam205a2-202ENSMUST00000180201 3927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
F13bQ07968 Sspn-202ENSMUST00000111701 4512 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
F13bQ07968 Psg28-201ENSMUST00000019291 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
F13bQ07968 Gm15399-201ENSMUST00000118055 724 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
F13bQ07968 Gm12607-201ENSMUST00000120724 493 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
F13bQ07968 Gm15142-201ENSMUST00000121013 856 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
F13bQ07968 Rhox11-ps1-201ENSMUST00000121945 387 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
F13bQ07968 Rab7b-203ENSMUST00000129905 476 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
F13bQ07968 Gm7855-201ENSMUST00000137737 687 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
F13bQ07968 C030037F17Rik-201ENSMUST00000155211 406 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
F13bQ07968 Calml4-202ENSMUST00000163820 699 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
F13bQ07968 Wfdc15b-203ENSMUST00000164567 497 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
F13bQ07968 4930555M17Rik-201ENSMUST00000176666 402 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
F13bQ07968 Gm23568-201ENSMUST00000177960 92 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
F13bQ07968 Gm24829-201ENSMUST00000179245 92 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
F13bQ07968 Mir6367-201ENSMUST00000183385 102 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
F13bQ07968 Gm10193-201ENSMUST00000188288 231 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
F13bQ07968 Gm37313-201ENSMUST00000191673 290 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
F13bQ07968 2900037B21Rik-201ENSMUST00000194352 337 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
F13bQ07968 Igkv4-56-201ENSMUST00000198436 349 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
F13bQ07968 Gm32158-201ENSMUST00000200135 404 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
F13bQ07968 Gm26691-203ENSMUST00000200444 479 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
F13bQ07968 Gm29778-201ENSMUST00000201667 466 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
F13bQ07968 Gm44278-201ENSMUST00000204082 312 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
F13bQ07968 Olfr277-ps1-201ENSMUST00000205749 285 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
F13bQ07968 Gm18903-201ENSMUST00000215343 480 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
F13bQ07968 Gm9237-201ENSMUST00000221499 548 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
F13bQ07968 AC107711.2-203ENSMUST00000227827 762 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
F13bQ07968 Tshb-201ENSMUST00000029450 605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
F13bQ07968 Uqcrh-ps1-201ENSMUST00000038391 270 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
F13bQ07968 Olfr1302-201ENSMUST00000054004 948 ntAPPRIS P2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
F13bQ07968 Olfr919-201ENSMUST00000071425 948 ntAPPRIS P2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
F13bQ07968 Gm8724-201ENSMUST00000081668 483 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
F13bQ07968 Gm23330-201ENSMUST00000082660 164 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
F13bQ07968 Nckap5-203ENSMUST00000094610 739 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
F13bQ07968 Scn1a-204ENSMUST00000112371 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
F13bQ07968 Ppm1k-201ENSMUST00000042766 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
F13bQ07968 AC165273.1-201ENSMUST00000222780 2452 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
F13bQ07968 Vmn1r34-206ENSMUST00000228498 3078 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
F13bQ07968 Ceacam2-202ENSMUST00000064862 3087 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
F13bQ07968 Jade3-202ENSMUST00000115384 4866 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
F13bQ07968 Gm18954-201ENSMUST00000222200 1792 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
F13bQ07968 Chrm3-201ENSMUST00000063093 1770 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
F13bQ07968 Nlrp5-202ENSMUST00000086341 3471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
F13bQ07968 Speer5-ps1-203ENSMUST00000217649 7431 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
F13bQ07968 Cftr-204ENSMUST00000129452 2835 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
F13bQ07968 Rabgap1-201ENSMUST00000061179 4967 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
F13bQ07968 Olfr57-202ENSMUST00000203906 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
F13bQ07968 Stx17-202ENSMUST00000107720 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
F13bQ07968 AC122355.1-201ENSMUST00000228155 4184 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
F13bQ07968 1700030N03Rik-203ENSMUST00000190575 3146 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
F13bQ07968 Clca3a1-202ENSMUST00000059091 3524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
F13bQ07968 Cd200r3-208ENSMUST00000164007 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
F13bQ07968 A530064N14Rik-201ENSMUST00000195338 1492 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
F13bQ07968 Zfp994-201ENSMUST00000179996 4880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
F13bQ07968 Mpeg1-201ENSMUST00000081035 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
F13bQ07968 CT009733.2-202ENSMUST00000224171 4748 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
F13bQ07968 Olfr1338-203ENSMUST00000216559 2829 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.6 ms