Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 1700110C19Rik-202ENSMUST00000188715 717 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
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Sh3bp2Q06649 Gm42716-201ENSMUST00000196003 680 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Sh3bp2Q06649 Gm15754-202ENSMUST00000202846 758 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Sh3bp2Q06649 Gm19921-201ENSMUST00000210505 703 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Sh3bp2Q06649 Gm38574-201ENSMUST00000211855 640 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
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Sh3bp2Q06649 Trps1-207ENSMUST00000184885 3492 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
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Sh3bp2Q06649 9330111N05Rik-201ENSMUST00000180409 1407 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Sh3bp2Q06649 Smarca2-203ENSMUST00000112637 1962 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
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Sh3bp2Q06649 4932435O22Rik-202ENSMUST00000148405 3406 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Sh3bp2Q06649 Nmd3-201ENSMUST00000029358 9135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
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Sh3bp2Q06649 Cyp2c65-201ENSMUST00000087236 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
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Sh3bp2Q06649 Tom1l1-202ENSMUST00000107867 2439 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
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Sh3bp2Q06649 Gm10165-201ENSMUST00000217666 2380 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Sh3bp2Q06649 F13b-201ENSMUST00000027615 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Sh3bp2Q06649 Mir700-201ENSMUST00000102169 79 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Sh3bp2Q06649 Gm23739-201ENSMUST00000102295 108 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Sh3bp2Q06649 Gm14750-201ENSMUST00000118262 516 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Sh3bp2Q06649 Gm15490-201ENSMUST00000119894 387 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Sh3bp2Q06649 Fam229b-202ENSMUST00000124941 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Sh3bp2Q06649 Gm12569-202ENSMUST00000126189 796 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Sh3bp2Q06649 Fam229b-205ENSMUST00000135785 674 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Sh3bp2Q06649 Med9os-202ENSMUST00000139794 446 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Sh3bp2Q06649 1700109G15Rik-201ENSMUST00000150735 384 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
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