Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Amz2-201ENSMUST00000020929 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
NfiaQ02780 Cyp2c65-201ENSMUST00000087236 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
NfiaQ02780 Tet2-204ENSMUST00000196398 9021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
NfiaQ02780 Osbpl9-213ENSMUST00000160271 2604 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
NfiaQ02780 Prox1-202ENSMUST00000175916 7913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
NfiaQ02780 Toporsl-201ENSMUST00000029995 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
NfiaQ02780 Homez-201ENSMUST00000081162 5609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
NfiaQ02780 Vmn2r85-201ENSMUST00000171811 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
NfiaQ02780 Rpgrip1l-201ENSMUST00000047783 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
NfiaQ02780 Mug4-ps-201ENSMUST00000203118 3578 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
NfiaQ02780 Izumo3-201ENSMUST00000107108 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
NfiaQ02780 Gm16106-201ENSMUST00000119187 294 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
NfiaQ02780 Gm6067-201ENSMUST00000121648 491 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
NfiaQ02780 Gm15141-201ENSMUST00000121860 729 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
NfiaQ02780 Gm12293-201ENSMUST00000121898 590 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
NfiaQ02780 Noct-202ENSMUST00000144826 9797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
NfiaQ02780 Gm26349-201ENSMUST00000157530 130 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
NfiaQ02780 Gm24584-201ENSMUST00000157972 107 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
NfiaQ02780 Gm24767-201ENSMUST00000158509 95 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
NfiaQ02780 Gm16038-201ENSMUST00000159317 193 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
NfiaQ02780 Gm3159-201ENSMUST00000164038 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
NfiaQ02780 Gm7335-201ENSMUST00000172475 373 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
NfiaQ02780 4933402E13Rik-202ENSMUST00000178085 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
NfiaQ02780 Gm22286-201ENSMUST00000179708 107 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
NfiaQ02780 Gm28149-201ENSMUST00000187102 378 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
NfiaQ02780 Gm28768-201ENSMUST00000189034 378 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
NfiaQ02780 D830032E09Rik-202ENSMUST00000189497 1632 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
NfiaQ02780 Gm37501-201ENSMUST00000192830 691 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
NfiaQ02780 Gm37838-201ENSMUST00000194464 312 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
NfiaQ02780 Igsf10-203ENSMUST00000194546 8393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
NfiaQ02780 Gm36947-201ENSMUST00000194709 2249 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
NfiaQ02780 Gm43724-201ENSMUST00000197516 226 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
NfiaQ02780 Gm43494-201ENSMUST00000197672 388 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
NfiaQ02780 Gm44209-201ENSMUST00000204556 4153 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
NfiaQ02780 Gm21885-202ENSMUST00000208510 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
NfiaQ02780 Gm45474-201ENSMUST00000209471 408 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
NfiaQ02780 Gm45322-201ENSMUST00000211642 1361 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
NfiaQ02780 Gm45820-201ENSMUST00000212068 362 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
NfiaQ02780 Gm45777-201ENSMUST00000213009 301 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
NfiaQ02780 Olfr441-202ENSMUST00000213649 2402 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
NfiaQ02780 Olfr682-ps1-202ENSMUST00000214399 897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
NfiaQ02780 Gm36367-201ENSMUST00000217623 1158 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
NfiaQ02780 Olfr1026-203ENSMUST00000219615 1465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
NfiaQ02780 AC134468.1-201ENSMUST00000220869 299 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
NfiaQ02780 9130015A21Rik-201ENSMUST00000221491 651 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
NfiaQ02780 Cfap70-201ENSMUST00000022348 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
NfiaQ02780 AC131745.2-201ENSMUST00000225736 565 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
NfiaQ02780 Vmn1r87-204ENSMUST00000228800 1993 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
NfiaQ02780 Tshb-201ENSMUST00000029450 605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
NfiaQ02780 H2al3-201ENSMUST00000057113 553 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
NfiaQ02780 Olfr1136-201ENSMUST00000077471 1067 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
NfiaQ02780 Gm22749-201ENSMUST00000082490 107 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
NfiaQ02780 Gm24856-201ENSMUST00000082809 107 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
NfiaQ02780 Gm25258-201ENSMUST00000083049 107 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
NfiaQ02780 Gm24535-201ENSMUST00000083140 107 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
NfiaQ02780 Gm22352-201ENSMUST00000083917 107 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
NfiaQ02780 Olfr9-201ENSMUST00000091996 2672 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
NfiaQ02780 Defa36-201ENSMUST00000095424 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
NfiaQ02780 Olfr678-201ENSMUST00000098160 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
NfiaQ02780 Gcnt2-203ENSMUST00000110191 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
NfiaQ02780 Olfr1115-202ENSMUST00000213513 3604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
NfiaQ02780 Rfx4-205ENSMUST00000166696 3332 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
NfiaQ02780 Cab39l-201ENSMUST00000022553 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
NfiaQ02780 Ccdc186-201ENSMUST00000076085 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
NfiaQ02780 Gm43502-201ENSMUST00000200263 2596 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
NfiaQ02780 Adam4-201ENSMUST00000085319 2504 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
NfiaQ02780 Ptprz1-204ENSMUST00000202102 4947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
NfiaQ02780 Gm38096-201ENSMUST00000193692 2389 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
NfiaQ02780 Samd8-202ENSMUST00000119430 6801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
NfiaQ02780 Gm42440-201ENSMUST00000197906 2284 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
NfiaQ02780 Zfp473-203ENSMUST00000120074 3624 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
NfiaQ02780 Olfr1305-203ENSMUST00000213737 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
NfiaQ02780 Mir99ahg-214ENSMUST00000183333 3422 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
NfiaQ02780 Gm9496-201ENSMUST00000191295 1601 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
NfiaQ02780 Nlrp10-201ENSMUST00000055745 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
NfiaQ02780 Tcp1-ps1-201ENSMUST00000120941 1466 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
NfiaQ02780 St18-208ENSMUST00000140079 5892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
NfiaQ02780 AC159326.1-201ENSMUST00000219989 1302 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
NfiaQ02780 C230038L03Rik-201ENSMUST00000129409 2632 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
NfiaQ02780 Igkv8-18-201ENSMUST00000103390 395 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
NfiaQ02780 Smyd1-204ENSMUST00000129630 376 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
NfiaQ02780 Gm16212-202ENSMUST00000143555 420 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
NfiaQ02780 Gm25669-201ENSMUST00000157699 112 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
NfiaQ02780 Olfr1187-ps1-201ENSMUST00000177576 334 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
NfiaQ02780 Gm23864-201ENSMUST00000177607 107 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
NfiaQ02780 Gm21244-201ENSMUST00000178447 684 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
NfiaQ02780 Gm22420-201ENSMUST00000178795 126 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
NfiaQ02780 Gm28017-201ENSMUST00000183434 126 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
NfiaQ02780 Mir7685-201ENSMUST00000183555 62 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
NfiaQ02780 Spata17-208ENSMUST00000184543 667 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
NfiaQ02780 Gm21856-201ENSMUST00000187547 696 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
NfiaQ02780 Gm21735-201ENSMUST00000190360 696 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
NfiaQ02780 Gm37746-201ENSMUST00000193249 198 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
NfiaQ02780 Rpl26-ps3-201ENSMUST00000195115 435 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
NfiaQ02780 Gm38008-201ENSMUST00000195333 518 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
NfiaQ02780 Gm42832-201ENSMUST00000196361 745 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
NfiaQ02780 Gm43109-201ENSMUST00000198269 753 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
NfiaQ02780 Gm44923-201ENSMUST00000206673 85 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
NfiaQ02780 Gm45249-201ENSMUST00000211021 348 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
NfiaQ02780 Olfr927-ps1-201ENSMUST00000216759 782 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.7 ms