Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Mmp12-202ENSMUST00000065079 1185 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Irf5P56477 Olfr365-201ENSMUST00000074168 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Irf5P56477 Gm6177-201ENSMUST00000085589 465 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Irf5P56477 Csnk1g1-213ENSMUST00000206528 1740 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Irf5P56477 Crnn-201ENSMUST00000107300 1628 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Irf5P56477 Tom1l1-202ENSMUST00000107867 2439 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Irf5P56477 Cyp2j5-201ENSMUST00000030299 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Irf5P56477 Cd44-201ENSMUST00000005218 5614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Irf5P56477 Lypd6-205ENSMUST00000169232 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Irf5P56477 Papolg-201ENSMUST00000020513 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Irf5P56477 Gm43443-201ENSMUST00000202337 2393 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Irf5P56477 Gm37864-201ENSMUST00000195308 3075 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Irf5P56477 2610203C20Rik-206ENSMUST00000181814 2996 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Irf5P56477 Zfp935-204ENSMUST00000223247 1949 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Irf5P56477 F830112A20Rik-201ENSMUST00000194249 3552 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Irf5P56477 B530045E10Rik-204ENSMUST00000220146 3244 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Irf5P56477 Olfr137-202ENSMUST00000213505 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
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Irf5P56477 Akr1c14-201ENSMUST00000041768 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Irf5P56477 Tnfaip3-202ENSMUST00000105527 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Irf5P56477 Slc28a3-201ENSMUST00000022036 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Irf5P56477 Slc35a5-201ENSMUST00000023344 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Irf5P56477 Baz2b-201ENSMUST00000090925 7576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Irf5P56477 Thap6-201ENSMUST00000191860 3151 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Irf5P56477 Zmynd11-201ENSMUST00000062658 3796 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Irf5P56477 Ppip5k2-205ENSMUST00000171129 3425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Irf5P56477 Obox3-202ENSMUST00000095217 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Irf5P56477 Rfx3-201ENSMUST00000046898 4274 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Irf5P56477 Nsa2-201ENSMUST00000073456 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
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Irf5P56477 Snora47-201ENSMUST00000157483 138 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Irf5P56477 Gm23539-201ENSMUST00000157537 224 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Irf5P56477 Gm26037-201ENSMUST00000158150 311 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Irf5P56477 Gm23579-201ENSMUST00000158528 103 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Irf5P56477 Gm21560-202ENSMUST00000177670 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
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Irf5P56477 Igkv4-83-201ENSMUST00000196933 334 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Irf5P56477 1700019F05Rik-201ENSMUST00000202487 533 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
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Irf5P56477 1700007K09Rik-201ENSMUST00000033146 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Irf5P56477 Olfr895-201ENSMUST00000093864 951 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Irf5P56477 Chrnb3-203ENSMUST00000211104 3241 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Irf5P56477 Olfr571-203ENSMUST00000215773 5153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Irf5P56477 Med23-202ENSMUST00000092646 5098 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Irf5P56477 Gm43360-201ENSMUST00000197656 2887 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Irf5P56477 Rgs2-202ENSMUST00000127206 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Irf5P56477 Prg4-208ENSMUST00000164600 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Irf5P56477 Gbp4-201ENSMUST00000100962 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
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Irf5P56477 Rnf145-202ENSMUST00000101327 4214 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
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Irf5P56477 Gm10662-202ENSMUST00000186928 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Irf5P56477 Pcsk1-201ENSMUST00000022075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
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Irf5P56477 Elavl2-209ENSMUST00000107124 4127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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Irf5P56477 Vwc2l-201ENSMUST00000053922 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Irf5P56477 B020004J07Rik-201ENSMUST00000084386 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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Irf5P56477 Gm9602-202ENSMUST00000177973 615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
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Irf5P56477 AC156832.1-201ENSMUST00000217609 811 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Irf5P56477 AC154733.1-201ENSMUST00000221126 679 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
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Irf5P56477 AC165106.1-201ENSMUST00000227580 408 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Irf5P56477 Snord42a-201ENSMUST00000082606 65 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Irf5P56477 Gm44567-201ENSMUST00000205645 2631 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Irf5P56477 Impg2-204ENSMUST00000160116 3992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Irf5P56477 March1-208ENSMUST00000110259 3181 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Irf5P56477 Spp1-202ENSMUST00000086833 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Irf5P56477 Tbx22-204ENSMUST00000168403 1715 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Irf5P56477 Slc22a28-201ENSMUST00000065651 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Irf5P56477 Gm10309-201ENSMUST00000095186 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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