Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Vmn1r200-202ENSMUST00000226157 5505 ntAPPRIS P2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 3222401L13Rik-202ENSMUST00000192137 6292 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm43329-201ENSMUST00000200120 3232 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Olfr689-202ENSMUST00000215413 5819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 9630002D21Rik-202ENSMUST00000222033 2345 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Kcnh8-201ENSMUST00000039366 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Zfp65-201ENSMUST00000073157 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Tcrg-V3-201ENSMUST00000103559 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Hbb-bh2-201ENSMUST00000106866 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm26474-201ENSMUST00000116762 122 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm12760-201ENSMUST00000117861 482 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm15766-201ENSMUST00000118025 813 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Vmn1r-ps107-201ENSMUST00000121458 581 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm13868-201ENSMUST00000122411 294 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm15584-201ENSMUST00000123231 759 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Ccdc34os-201ENSMUST00000123633 979 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm5699-201ENSMUST00000152491 723 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm11339-201ENSMUST00000154766 490 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm23993-201ENSMUST00000157478 144 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm26187-201ENSMUST00000157693 101 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm25383-201ENSMUST00000157810 144 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm24675-201ENSMUST00000158757 259 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm25971-201ENSMUST00000158953 286 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm16300-201ENSMUST00000160031 1279 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 1700116B05Rik-201ENSMUST00000173461 414 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Cox6b2-209ENSMUST00000184143 435 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm29525-201ENSMUST00000189844 699 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm29523-201ENSMUST00000191415 699 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 9430083B18Rik-201ENSMUST00000191908 863 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm30097-201ENSMUST00000193581 447 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 A330074H02Rik-201ENSMUST00000194667 1039 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm21006-201ENSMUST00000196930 667 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Snhg1-211ENSMUST00000206155 605 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm44893-201ENSMUST00000207259 443 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Olfr153-201ENSMUST00000217113 1258 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 CAAA01052029.1-201ENSMUST00000218410 271 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 AC118006.2-201ENSMUST00000224167 962 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 AC121599.1-201ENSMUST00000224276 449 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Olfr808-201ENSMUST00000060636 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Olfr851-201ENSMUST00000064582 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm16415-201ENSMUST00000080097 489 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm10916-201ENSMUST00000080330 483 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Mir350-201ENSMUST00000083639 99 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm28394-201ENSMUST00000186805 1495 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm28570-201ENSMUST00000188300 1495 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm21854-202ENSMUST00000190391 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Npat-201ENSMUST00000035850 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Olfr111-203ENSMUST00000215424 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm37890-201ENSMUST00000195610 3992 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Cfh-206ENSMUST00000192880 3746 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm2824-202ENSMUST00000180955 3522 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm22468-201ENSMUST00000116680 120 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm26248-201ENSMUST00000116700 121 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm26137-201ENSMUST00000116701 121 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm26190-201ENSMUST00000116704 121 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm24617-201ENSMUST00000116705 121 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm25778-201ENSMUST00000116713 121 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm25774-201ENSMUST00000116717 121 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm22102-201ENSMUST00000116730 121 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm23177-201ENSMUST00000116784 121 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm24193-201ENSMUST00000116801 121 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm24744-201ENSMUST00000116833 121 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm22709-201ENSMUST00000116893 111 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm24427-201ENSMUST00000116896 121 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm22346-201ENSMUST00000116918 121 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm23606-201ENSMUST00000116938 121 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm22029-201ENSMUST00000116940 121 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm26298-201ENSMUST00000116956 121 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm23844-201ENSMUST00000116959 121 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm24484-201ENSMUST00000117009 121 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm25347-201ENSMUST00000117026 121 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm22112-201ENSMUST00000117032 121 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm12577-201ENSMUST00000119701 574 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm15791-201ENSMUST00000120365 319 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Klra11-ps-201ENSMUST00000122033 810 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm25293-201ENSMUST00000122792 285 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 4933416I08Rik-201ENSMUST00000125315 703 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm11714-201ENSMUST00000136927 876 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm14041-201ENSMUST00000150181 276 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm11846-201ENSMUST00000155156 515 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm25603-201ENSMUST00000158361 105 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm24002-201ENSMUST00000158456 104 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm23702-201ENSMUST00000158840 130 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 B230216N24Rik-204ENSMUST00000161661 719 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm22355-201ENSMUST00000175531 96 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm22991-201ENSMUST00000178126 121 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm25754-201ENSMUST00000178653 121 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm22419-201ENSMUST00000178780 121 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm24802-201ENSMUST00000178897 121 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm25208-201ENSMUST00000178964 121 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm24567-201ENSMUST00000179294 121 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm23943-201ENSMUST00000179712 121 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm25228-201ENSMUST00000180121 121 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm23304-201ENSMUST00000180209 121 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm26925-201ENSMUST00000182470 957 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 1110015O18Rik-201ENSMUST00000183632 570 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm37768-201ENSMUST00000192748 887 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm44776-201ENSMUST00000207212 381 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm45498-201ENSMUST00000210346 283 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Olfr528-ps1-201ENSMUST00000211655 728 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.5 ms