Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Gm23506-201ENSMUST00000083077 107 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
P10404 Gm3867-201ENSMUST00000086108 279 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
P10404 Olfr984-204ENSMUST00000217536 5114 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
P10404 Gm44209-201ENSMUST00000204556 4153 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
P10404 Vmn2r79-201ENSMUST00000164462 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
P10404 AC122769.3-201ENSMUST00000227739 3245 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
P10404 Zfp974-201ENSMUST00000098639 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
P10404 Mug2-201ENSMUST00000081777 4579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
P10404 Olfr1392-206ENSMUST00000215861 3670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
P10404 Mmp13-201ENSMUST00000015394 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
P10404 Gm44587-201ENSMUST00000207399 1685 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
P10404 B020004J07Rik-201ENSMUST00000084386 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
P10404 Vmn2r-ps104-201ENSMUST00000099416 1671 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
P10404 Gm17767-202ENSMUST00000190169 3049 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
P10404 Kmt2d-201ENSMUST00000023741 19823 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
P10404 AC132384.12-201ENSMUST00000219608 4227 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
P10404 Dtna-203ENSMUST00000220904 3860 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
P10404 Gm8297-202ENSMUST00000171964 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
P10404 Clk1-201ENSMUST00000034868 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
P10404 Ptprd-201ENSMUST00000050757 4698 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
P10404 Mecom-212ENSMUST00000173495 5066 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
P10404 A330076H08Rik-202ENSMUST00000207694 1836 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
P10404 Gm38126-201ENSMUST00000195297 4003 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
P10404 Pax6os1-202ENSMUST00000149133 1464 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
P10404 Gm14325-203ENSMUST00000188914 1494 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
P10404 Olfr1097-202ENSMUST00000217403 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
P10404 Sirpb1c-201ENSMUST00000050623 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
P10404 Hrh2-202ENSMUST00000209846 4074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
P10404 2610203C20Rik-206ENSMUST00000181814 2996 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
P10404 Parp4-201ENSMUST00000161553 6387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
P10404 Olfr1170-202ENSMUST00000214386 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
P10404 Tmc5-204ENSMUST00000121744 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
P10404 Olfr102-202ENSMUST00000217590 2783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
P10404 Vmn1r208-202ENSMUST00000227136 3156 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
P10404 Cntn4-201ENSMUST00000079416 2844 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
P10404 Tor1aip1-210ENSMUST00000169241 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
P10404 Olfr393-201ENSMUST00000102523 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
P10404 Gm11408-201ENSMUST00000117889 519 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
P10404 Gm8692-201ENSMUST00000118102 438 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
P10404 Gm14750-201ENSMUST00000118262 516 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
P10404 Gm13291-201ENSMUST00000143527 655 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
P10404 1700061H18Rik-202ENSMUST00000147221 564 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
P10404 Gm17196-201ENSMUST00000164074 345 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
P10404 Vmn1r181-201ENSMUST00000181796 1080 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
P10404 Gm27348-201ENSMUST00000184511 170 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
P10404 Gm9569-201ENSMUST00000187492 787 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
P10404 Gm29524-201ENSMUST00000190819 699 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
P10404 Gm28086-201ENSMUST00000191586 317 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
P10404 Gm43652-201ENSMUST00000196219 675 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
P10404 Gm31887-201ENSMUST00000197661 501 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
P10404 Gm43470-202ENSMUST00000198573 227 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
P10404 Gm45048-201ENSMUST00000207058 429 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
P10404 Gm45387-201ENSMUST00000209792 632 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
P10404 Gm45303-201ENSMUST00000211239 676 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
P10404 AC166352.1-201ENSMUST00000215483 1105 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
P10404 Olfr1070-ps1-201ENSMUST00000215939 388 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
P10404 Gm8863-201ENSMUST00000216630 926 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
P10404 Gm33728-201ENSMUST00000217285 546 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
P10404 Olfr962-ps1-201ENSMUST00000217332 442 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
P10404 AC154733.1-201ENSMUST00000221126 679 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
P10404 Gm17890-201ENSMUST00000221419 757 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
P10404 Gm18247-201ENSMUST00000222937 601 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
P10404 AC170999.2-201ENSMUST00000226223 264 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
P10404 Vmn1r26-201ENSMUST00000049694 1020 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
P10404 Olfr832-201ENSMUST00000060601 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
P10404 Gm26056-201ENSMUST00000083043 104 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
P10404 Mir194-1-201ENSMUST00000083647 67 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
P10404 Olfr1167-201ENSMUST00000099832 1100 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
P10404 CT009480.3-201ENSMUST00000224051 3032 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
P10404 Map9-201ENSMUST00000091014 6218 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
P10404 Gm38198-201ENSMUST00000191772 3581 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
P10404 Lgi1-207ENSMUST00000198518 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
P10404 Brs3-201ENSMUST00000033464 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
P10404 Gm10032-201ENSMUST00000071522 1887 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
P10404 Serpinb9g-201ENSMUST00000081927 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
P10404 Gm20750-201ENSMUST00000194274 3515 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
P10404 Dnah3-204ENSMUST00000209154 12265 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
P10404 Gm37212-201ENSMUST00000192582 3650 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
P10404 Olfr430-202ENSMUST00000213425 3873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
P10404 AC132852.2-201ENSMUST00000216052 2794 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
P10404 Gm43627-201ENSMUST00000197119 2299 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
P10404 Ccdc7a-205ENSMUST00000214889 5544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
P10404 Neto2-203ENSMUST00000209479 4936 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
P10404 Cav1-201ENSMUST00000007799 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
P10404 Gm24265-201ENSMUST00000101833 141 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
P10404 n-R5s82-201ENSMUST00000104213 109 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
P10404 Gm25795-201ENSMUST00000104421 132 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
P10404 Gm24069-201ENSMUST00000104512 127 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
P10404 Gm11271-201ENSMUST00000116054 440 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
P10404 Gm13650-201ENSMUST00000117729 433 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
P10404 Gm11256-201ENSMUST00000118109 829 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
P10404 Gm11262-201ENSMUST00000119326 833 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
P10404 Gm11890-201ENSMUST00000119585 417 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
P10404 Gm25784-201ENSMUST00000122524 81 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
P10404 Gm14640-201ENSMUST00000145800 437 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
P10404 Gm14325-202ENSMUST00000150650 310 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
P10404 Gm25902-201ENSMUST00000158493 318 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
P10404 Gm23473-201ENSMUST00000158883 116 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
P10404 Gm16269-201ENSMUST00000160532 409 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
P10404 Gm23047-201ENSMUST00000177661 94 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms