Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Igkv1-132-201ENSMUST00000103305 362 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Ceacam13-202ENSMUST00000108488 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm4342-201ENSMUST00000118982 367 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm13430-201ENSMUST00000121366 288 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm22514-201ENSMUST00000122547 308 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Platr3-201ENSMUST00000146980 412 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Trim30e-ps1-202ENSMUST00000151294 731 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm25332-201ENSMUST00000158038 105 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm24224-201ENSMUST00000158828 258 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Vmn1r175-201ENSMUST00000166141 915 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Olfr762-ps1-201ENSMUST00000172948 927 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Mir5110-201ENSMUST00000175537 87 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm26895-201ENSMUST00000181295 619 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm8604-201ENSMUST00000183150 965 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm27883-201ENSMUST00000183941 102 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm27899-201ENSMUST00000184715 64 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm21856-201ENSMUST00000187547 696 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm28835-202ENSMUST00000189206 543 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm21735-201ENSMUST00000190360 696 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm28060-201ENSMUST00000191554 189 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm37996-201ENSMUST00000191859 367 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm19057-201ENSMUST00000194329 1197 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Obox4-ps32-201ENSMUST00000196512 537 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm44145-201ENSMUST00000203711 172 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm44184-201ENSMUST00000204290 132 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm7807-201ENSMUST00000212475 578 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm29674-201ENSMUST00000218791 1139 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 AC119573.1-201ENSMUST00000227960 757 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 CT030662.3-201ENSMUST00000228751 476 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Resp18-201ENSMUST00000039534 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Olfr957-201ENSMUST00000051653 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Olfr944-201ENSMUST00000079650 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Ptprz1-201ENSMUST00000090568 8068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Atad1-201ENSMUST00000070210 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Olfr104-ps-201ENSMUST00000178766 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm12586-201ENSMUST00000117328 1316 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 A530030E21Rik-201ENSMUST00000199551 1310 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm42658-201ENSMUST00000197199 1575 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Olfr665-203ENSMUST00000216257 2298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm42968-201ENSMUST00000198578 1372 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Olfr1000-202ENSMUST00000213837 1915 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Zfp708-201ENSMUST00000109742 2416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Pate2-202ENSMUST00000118254 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 B830012L14Rik-201ENSMUST00000182785 4505 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm10377-201ENSMUST00000100695 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Fbxo48-202ENSMUST00000109635 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm3676-201ENSMUST00000111869 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm3543-201ENSMUST00000111870 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm10241-201ENSMUST00000117664 286 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm15426-201ENSMUST00000117823 556 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm15021-201ENSMUST00000117832 742 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm14512-201ENSMUST00000117924 230 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm14908-201ENSMUST00000120930 1286 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm14916-201ENSMUST00000121904 204 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Llph-ps2-201ENSMUST00000122000 393 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm23467-201ENSMUST00000157127 159 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm25669-201ENSMUST00000157699 112 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm25432-201ENSMUST00000158284 66 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm22135-201ENSMUST00000158752 108 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm21999-201ENSMUST00000165985 387 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm3573-201ENSMUST00000168673 898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm10376-202ENSMUST00000169756 900 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm17086-201ENSMUST00000171346 484 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm27190-201ENSMUST00000184890 542 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm29588-201ENSMUST00000185738 298 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm28763-201ENSMUST00000188870 166 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm29579-201ENSMUST00000190820 166 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm44376-201ENSMUST00000197570 128 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Olfr8-202ENSMUST00000203851 1009 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Olfr1480-203ENSMUST00000207904 1209 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Olfr1311-201ENSMUST00000208536 943 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 CT009711.3-201ENSMUST00000225882 250 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Spata19-201ENSMUST00000034473 697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Olfr1480-201ENSMUST00000072219 948 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Olfr310-201ENSMUST00000081918 1082 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 1700010D01Rik-201ENSMUST00000096366 507 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Bcl2a1a-201ENSMUST00000098485 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gprc6a-203ENSMUST00000219286 2574 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Has2-201ENSMUST00000050544 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Olfr726-205ENSMUST00000215278 1324 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 AC091683.1-201ENSMUST00000222307 2446 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Olfr1283-202ENSMUST00000204064 1625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Olfr1368-202ENSMUST00000216039 1389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 AC154329.1-201ENSMUST00000224408 3129 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Olfr1049-202ENSMUST00000216185 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Glmn-203ENSMUST00000100949 1759 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm28154-201ENSMUST00000186267 4218 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Nap1l1-202ENSMUST00000171797 3926 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Nap1l1-204ENSMUST00000218828 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Olfr711-201ENSMUST00000051715 3035 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Ankar-201ENSMUST00000053499 4571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Olfr418-202ENSMUST00000213420 4388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Olfr112-204ENSMUST00000208832 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Defb47-201ENSMUST00000100492 359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Trav12d-2-201ENSMUST00000103593 341 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Trav12n-2-201ENSMUST00000103619 341 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm15916-201ENSMUST00000118355 736 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm11366-201ENSMUST00000119279 429 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm9435-201ENSMUST00000120379 877 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm13808-201ENSMUST00000121353 184 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.7 ms