Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Gm15638-201ENSMUST00000128159 2062 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Gm340F6RGI3 Olfr998-202ENSMUST00000215083 1399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Gm340F6RGI3 Cwf19l2-201ENSMUST00000027027 4446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Gm340F6RGI3 Gm3675-201ENSMUST00000175904 1653 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Gm340F6RGI3 AC120153.1-201ENSMUST00000226502 1311 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Gm340F6RGI3 Kcnj1-201ENSMUST00000047334 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Gm340F6RGI3 Gm37393-201ENSMUST00000195118 3870 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Gm340F6RGI3 Ssxb9-201ENSMUST00000115584 879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Gm340F6RGI3 Gm14706-201ENSMUST00000117744 255 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Gm340F6RGI3 Gm12760-201ENSMUST00000117861 482 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Gm340F6RGI3 Gm11877-201ENSMUST00000118921 852 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Gm340F6RGI3 Gm9085-201ENSMUST00000119994 1072 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Gm340F6RGI3 Gm13000-201ENSMUST00000120937 496 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Gm340F6RGI3 Gm25103-201ENSMUST00000122671 318 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Gm340F6RGI3 Gm25806-201ENSMUST00000122782 122 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Gm340F6RGI3 Gm15640-201ENSMUST00000152070 527 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Gm340F6RGI3 Gm23046-201ENSMUST00000158369 284 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Gm340F6RGI3 4930570N18Rik-201ENSMUST00000159273 332 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Gm340F6RGI3 Gm3531-201ENSMUST00000162698 489 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Gm340F6RGI3 Adgrg4-206ENSMUST00000168724 531 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Gm340F6RGI3 Olfr772-201ENSMUST00000169800 1004 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Gm340F6RGI3 Vmn1r170-201ENSMUST00000170166 915 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Gm340F6RGI3 1110015O18Rik-201ENSMUST00000183632 570 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Gm340F6RGI3 Gm27864-201ENSMUST00000183704 190 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Gm340F6RGI3 Olfr576-202ENSMUST00000185326 927 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Gm340F6RGI3 Gm37021-201ENSMUST00000195835 663 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Gm340F6RGI3 Klk1b23-ps-201ENSMUST00000206347 345 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Gm340F6RGI3 Gm45034-201ENSMUST00000206831 482 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Gm340F6RGI3 Gm32916-203ENSMUST00000208033 789 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Gm340F6RGI3 AC132104.1-201ENSMUST00000213615 260 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Gm340F6RGI3 AC155921.1-201ENSMUST00000216568 3841 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Gm340F6RGI3 CR974592.1-201ENSMUST00000220422 574 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Gm340F6RGI3 AC155236.1-201ENSMUST00000220591 923 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Gm340F6RGI3 Rpl29-ps2-203ENSMUST00000222043 1036 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Gm340F6RGI3 Ly6e-ps1-201ENSMUST00000222501 367 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Gm340F6RGI3 AC156560.3-201ENSMUST00000222978 3841 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Gm340F6RGI3 AC125399.1-201ENSMUST00000224236 595 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Gm340F6RGI3 AC159242.1-201ENSMUST00000225832 194 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Gm340F6RGI3 Olfr952-201ENSMUST00000073895 1056 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Gm340F6RGI3 Vmn1r80-201ENSMUST00000075053 927 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Gm340F6RGI3 Olfr611-201ENSMUST00000078108 972 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Gm340F6RGI3 Gm16415-201ENSMUST00000080097 489 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Gm340F6RGI3 Gm10916-201ENSMUST00000080330 483 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Gm340F6RGI3 Snora52-201ENSMUST00000082732 137 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Gm340F6RGI3 Olfr1170-201ENSMUST00000099831 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Gm340F6RGI3 Gm43843-201ENSMUST00000202396 1587 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Gm340F6RGI3 4932411N23Rik-201ENSMUST00000081074 3407 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Gm340F6RGI3 AC149588.1-201ENSMUST00000228274 3745 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Gm340F6RGI3 Gm13084-201ENSMUST00000075045 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Gm340F6RGI3 Olfr536-205ENSMUST00000215768 4231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Gm340F6RGI3 Ddi1-201ENSMUST00000051706 7114 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Gm340F6RGI3 Gm5925-201ENSMUST00000105016 1497 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Gm340F6RGI3 1700017N19Rik-204ENSMUST00000188736 1709 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Gm340F6RGI3 Slfn8-201ENSMUST00000038141 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Gm340F6RGI3 Gm18300-201ENSMUST00000192792 1406 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Gm340F6RGI3 Gm7903-201ENSMUST00000113172 3677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Gm340F6RGI3 Gm5128-201ENSMUST00000113173 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Gm340F6RGI3 Erv3-201ENSMUST00000040941 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Gm340F6RGI3 Mlip-205ENSMUST00000183955 3069 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Gm340F6RGI3 Olfr205-202ENSMUST00000213910 1650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Gm340F6RGI3 Olfr959-202ENSMUST00000215194 4339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Gm340F6RGI3 Rps6ka3-204ENSMUST00000112493 3671 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Gm340F6RGI3 Acsm3-203ENSMUST00000106527 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Gm340F6RGI3 Trav6n-6-201ENSMUST00000103613 287 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Gm340F6RGI3 Gm13250-201ENSMUST00000117209 753 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Gm340F6RGI3 Gm15670-201ENSMUST00000117740 447 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Gm340F6RGI3 Gm15297-201ENSMUST00000117795 290 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Gm340F6RGI3 Olfr1149-ps1-201ENSMUST00000118232 691 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Gm340F6RGI3 Gm16179-201ENSMUST00000120685 373 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Gm340F6RGI3 Gm13007-201ENSMUST00000121866 365 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Gm340F6RGI3 Gm14713-201ENSMUST00000122362 686 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Gm340F6RGI3 Gm24217-201ENSMUST00000158260 133 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Gm340F6RGI3 Gm3173-203ENSMUST00000166848 396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Gm340F6RGI3 Vmn1r-ps57-201ENSMUST00000174879 288 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Gm340F6RGI3 Gm22392-201ENSMUST00000177971 107 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Gm340F6RGI3 Skint2-204ENSMUST00000186969 1258 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Gm340F6RGI3 Gm29097-201ENSMUST00000190273 422 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Gm340F6RGI3 Gm29478-201ENSMUST00000191272 688 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Gm340F6RGI3 Ly6e-215ENSMUST00000191436 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Gm340F6RGI3 4930539C22Rik-201ENSMUST00000198231 970 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Gm340F6RGI3 2400006E01Rik-203ENSMUST00000199633 643 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Gm340F6RGI3 Gm43631-201ENSMUST00000202011 369 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Gm340F6RGI3 Kap-202ENSMUST00000203168 464 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Gm340F6RGI3 Gm44402-201ENSMUST00000203677 238 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Gm340F6RGI3 Gm2607-201ENSMUST00000212389 627 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Gm340F6RGI3 Scoc-209ENSMUST00000212905 798 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Gm340F6RGI3 AC167013.2-202ENSMUST00000227035 333 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Gm340F6RGI3 CT025525.3-201ENSMUST00000228858 366 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Gm340F6RGI3 Fam183b-201ENSMUST00000060581 493 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Gm340F6RGI3 Olfr813-201ENSMUST00000064893 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Gm340F6RGI3 Olfr1484-201ENSMUST00000074180 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Gm340F6RGI3 n-R5s167-201ENSMUST00000083227 121 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Gm340F6RGI3 Mir17-201ENSMUST00000083574 84 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Gm340F6RGI3 Gm6177-201ENSMUST00000085589 465 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Gm340F6RGI3 Gm10801-201ENSMUST00000099684 504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Gm340F6RGI3 Gm9495-201ENSMUST00000200846 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Gm340F6RGI3 5930435M05Rik-201ENSMUST00000207572 3712 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Gm340F6RGI3 Fgf7-201ENSMUST00000064794 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Gm340F6RGI3 Gm26814-201ENSMUST00000181178 4149 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Gm340F6RGI3 Olfr235-202ENSMUST00000207969 2447 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.6 ms