Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Klhl13-204ENSMUST00000115317 3216 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc9c1-201ENSMUST00000159945 3836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cybb-201ENSMUST00000015484 4752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr556-203ENSMUST00000217526 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plcb4-201ENSMUST00000035646 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn2r83-201ENSMUST00000167976 2610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Muc15-203ENSMUST00000111017 3095 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr556-202ENSMUST00000213485 3825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gpr174-203ENSMUST00000118820 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC122317.3-201ENSMUST00000219320 3524 ntBASIC2.53□□□□□ -2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kctd12b-202ENSMUST00000112572 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43327-201ENSMUST00000199285 4055 ntBASIC2.53□□□□□ -2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1377-203ENSMUST00000216101 1990 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adam34-201ENSMUST00000110411 2584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn2r26-201ENSMUST00000032238 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm24935-201ENSMUST00000103770 110 ntBASIC2.53□□□□□ -2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm23271-201ENSMUST00000104052 124 ntBASIC2.53□□□□□ -2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2210407C18Rik-202ENSMUST00000108821 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam122c-201ENSMUST00000114835 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11971-201ENSMUST00000117715 288 ntBASIC2.53□□□□□ -2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6071-201ENSMUST00000119561 440 ntBASIC2.53□□□□□ -2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13121-201ENSMUST00000120637 632 ntBASIC2.53□□□□□ -2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12340-201ENSMUST00000121617 462 ntBASIC2.53□□□□□ -2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12103-201ENSMUST00000121892 362 ntBASIC2.53□□□□□ -2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm25104-201ENSMUST00000122476 163 ntBASIC2.53□□□□□ -2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm21990-201ENSMUST00000124692 383 ntBASIC2.53□□□□□ -2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13092-201ENSMUST00000136346 260 ntBASIC2.53□□□□□ -2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm23496-201ENSMUST00000157741 248 ntBASIC2.53□□□□□ -2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm24850-201ENSMUST00000158029 119 ntBASIC2.53□□□□□ -2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm25713-201ENSMUST00000158625 109 ntBASIC2.53□□□□□ -2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Airn-203ENSMUST00000159791 485 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pagr1a-201ENSMUST00000162069 422 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm23816-201ENSMUST00000179617 132 ntBASIC2.53□□□□□ -2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28889-201ENSMUST00000185350 959 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29426-202ENSMUST00000186564 536 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm18342-201ENSMUST00000186987 694 ntBASIC2.53□□□□□ -2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Galntl6-205ENSMUST00000188531 1056 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29133-201ENSMUST00000189155 885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm19774-201ENSMUST00000190667 114 ntBASIC2.53□□□□□ -2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm4248-201ENSMUST00000196905 316 ntBASIC2.53□□□□□ -2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43853-201ENSMUST00000197162 301 ntBASIC2.53□□□□□ -2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43814-201ENSMUST00000197851 413 ntBASIC2.53□□□□□ -2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sult1c2-ps1-201ENSMUST00000200231 164 ntBASIC2.53□□□□□ -2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9245-201ENSMUST00000200528 983 ntBASIC2.53□□□□□ -2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8820-201ENSMUST00000204077 571 ntBASIC2.53□□□□□ -2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17811-201ENSMUST00000206193 387 ntBASIC2.53□□□□□ -2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1476-ps1-201ENSMUST00000208572 367 ntBASIC2.53□□□□□ -2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45259-201ENSMUST00000209217 1006 ntBASIC2.53□□□□□ -2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr663-201ENSMUST00000209914 959 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45498-201ENSMUST00000210346 283 ntBASIC2.53□□□□□ -2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm18997-201ENSMUST00000216353 822 ntBASIC2.53□□□□□ -2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC156639.1-201ENSMUST00000216503 660 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC153912.1-201ENSMUST00000217011 724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC168059.1-201ENSMUST00000225846 841 ntBASIC2.53□□□□□ -2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC102603.1-201ENSMUST00000227481 584 ntBASIC2.53□□□□□ -2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Resp18-201ENSMUST00000039534 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kap-201ENSMUST00000048032 707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr690-201ENSMUST00000061920 1062 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bcl2a1b-201ENSMUST00000068569 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6634-201ENSMUST00000180497 1804 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fbxw26-201ENSMUST00000071917 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam169a-202ENSMUST00000169863 6013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr639-202ENSMUST00000215653 6570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stk31-202ENSMUST00000163954 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm38259-201ENSMUST00000194602 3534 ntBASIC2.53□□□□□ -2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr372-202ENSMUST00000215324 3542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm38235-201ENSMUST00000194600 4952 ntBASIC2.53□□□□□ -2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr91-203ENSMUST00000217372 3809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trim30d-202ENSMUST00000071069 3282 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45378-201ENSMUST00000211063 2711 ntBASIC2.53□□□□□ -2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20342-201ENSMUST00000185480 9720 ntBASIC2.53□□□□□ -2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr376-203ENSMUST00000170592 3211 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Il1rapl1-203ENSMUST00000113966 9133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC124446.1-201ENSMUST00000221027 2644 ntBASIC2.53□□□□□ -2.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mybpc1-201ENSMUST00000119185 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7173-201ENSMUST00000101410 2832 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr112-204ENSMUST00000208832 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp980-201ENSMUST00000105738 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ints12-201ENSMUST00000029650 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8267-201ENSMUST00000165003 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37625-201ENSMUST00000194969 4872 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cngb3-201ENSMUST00000102999 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Btf3l4-202ENSMUST00000102740 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm24581-201ENSMUST00000103962 133 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7834-201ENSMUST00000117560 437 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12173-201ENSMUST00000117622 273 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15014-201ENSMUST00000120742 258 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14587-201ENSMUST00000121714 658 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm22792-201ENSMUST00000157225 133 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm24505-201ENSMUST00000157682 126 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8653-201ENSMUST00000163096 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Serpina3l-ps-201ENSMUST00000163975 1264 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr723-201ENSMUST00000164157 1006 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm3191-201ENSMUST00000167139 346 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17046-201ENSMUST00000168078 850 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6164-201ENSMUST00000169774 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20389-201ENSMUST00000174217 1006 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir5106-201ENSMUST00000174936 73 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8296-201ENSMUST00000185597 524 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28136-206ENSMUST00000189800 1104 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.4 ms