Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 AC166263.1-201ENSMUST00000218586 238 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Gm4036-201ENSMUST00000220842 626 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Gm10037-202ENSMUST00000221266 549 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Cst12-201ENSMUST00000028932 644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Vaultrc5-201ENSMUST00000083211 143 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Ms4a7-201ENSMUST00000025574 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Cftr-204ENSMUST00000129452 2835 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Tet1-206ENSMUST00000174189 14369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Abcc9-204ENSMUST00000111771 7499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Mrgprc2-ps-201ENSMUST00000188039 1516 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Pign-201ENSMUST00000070699 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Olfr394-203ENSMUST00000216608 5628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Fat1-206ENSMUST00000215588 13938 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Gm44847-201ENSMUST00000207104 1991 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Nop58-215ENSMUST00000191142 9507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Lrrc39-201ENSMUST00000029573 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Parp4-201ENSMUST00000161553 6387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Olfr736-203ENSMUST00000213755 2338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Ighv3-3-201ENSMUST00000103476 296 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Gm11656-201ENSMUST00000137462 395 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Gm20538-201ENSMUST00000166808 225 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Gm23365-201ENSMUST00000175019 125 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Gm25960-201ENSMUST00000175110 125 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Gm44453-201ENSMUST00000175161 126 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Gm25195-201ENSMUST00000177656 126 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 2610001A08Rik-201ENSMUST00000193315 867 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Gm42983-201ENSMUST00000199879 815 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Olfr747-202ENSMUST00000205373 1132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Gm44543-201ENSMUST00000209136 396 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 AC155923.1-201ENSMUST00000215676 356 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 AC113291.1-201ENSMUST00000217557 403 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Zfp825-201ENSMUST00000074369 822 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Olfr507-201ENSMUST00000080014 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Olfr206-201ENSMUST00000084791 1005 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Ehf-201ENSMUST00000090475 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 March1-202ENSMUST00000072482 3953 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Gm16794-201ENSMUST00000180727 2100 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Iqcm-202ENSMUST00000121983 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r206-202ENSMUST00000227244 3970 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 4921515E04Rik-203ENSMUST00000227364 2309 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Zfp935-201ENSMUST00000076195 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Sri-202ENSMUST00000088786 2504 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Gm4070-202ENSMUST00000176467 9007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Mtx3-201ENSMUST00000076169 6275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Slfn8-201ENSMUST00000038141 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Gm33609-201ENSMUST00000198559 2694 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Rfx3-202ENSMUST00000165566 9146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r171-206ENSMUST00000227386 2570 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Naalad2-207ENSMUST00000172171 4066 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Ctps2-203ENSMUST00000112300 741 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Nectin3-204ENSMUST00000119941 529 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Gm15014-201ENSMUST00000120742 258 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 AI838599-201ENSMUST00000133960 2953 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Gm22398-201ENSMUST00000174941 125 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Gm25731-201ENSMUST00000175167 125 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Gm6712-202ENSMUST00000186431 526 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Gm22897-202ENSMUST00000197782 127 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Gm43005-201ENSMUST00000199015 648 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Gm43730-201ENSMUST00000199863 372 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
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Col5a3Q9JLI2 AC158686.2-201ENSMUST00000218599 976 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
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Col5a3Q9JLI2 AC131677.1-201ENSMUST00000218721 535 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Gm29774-201ENSMUST00000219270 436 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 AC153532.2-201ENSMUST00000219753 3844 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 AC159244.1-201ENSMUST00000220964 594 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
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Col5a3Q9JLI2 Gm21854-202ENSMUST00000190391 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
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Col5a3Q9JLI2 Mrc1-201ENSMUST00000028045 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Mug1-201ENSMUST00000032228 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
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Col5a3Q9JLI2 Gm5946-202ENSMUST00000182652 2724 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r90-209ENSMUST00000227855 7362 ntAPPRIS P2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 AC126673.1-201ENSMUST00000223208 3856 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r52-205ENSMUST00000227893 3108 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Gm25765-201ENSMUST00000104100 132 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Bsph2-201ENSMUST00000108526 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Gm11719-201ENSMUST00000119399 351 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Gm7618-201ENSMUST00000121643 171 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Gm23112-201ENSMUST00000158606 125 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Gm14419-204ENSMUST00000178182 192 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Gm2004-202ENSMUST00000178872 192 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Gm14295-203ENSMUST00000179435 192 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 4831440E17Rik-201ENSMUST00000181942 1028 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Mir6914-201ENSMUST00000184999 69 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Gm7634-201ENSMUST00000185778 553 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 C530043A13Rik-201ENSMUST00000186453 550 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Gm29634-201ENSMUST00000188467 696 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Gm28699-201ENSMUST00000189193 696 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Gm17781-201ENSMUST00000195232 649 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Cycs-ps2-201ENSMUST00000197114 292 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Gm45553-201ENSMUST00000209929 507 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Gm6929-201ENSMUST00000210930 468 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Gm45826-201ENSMUST00000212226 265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Gm45829-201ENSMUST00000212466 334 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Olfr91-202ENSMUST00000216376 3832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
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