Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Gm25578-201ENSMUST00000083406 104 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Olfr1181-201ENSMUST00000099823 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Olfr988-203ENSMUST00000215511 1906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Abcb5-201ENSMUST00000035515 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Pum2-209ENSMUST00000168361 6226 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Gm37779-201ENSMUST00000194221 3380 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Mocs2-213ENSMUST00000184245 4559 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Gm6288-201ENSMUST00000100778 1590 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Olfr362-202ENSMUST00000213817 4059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Gm11674-201ENSMUST00000124855 3005 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Olfr552-202ENSMUST00000215712 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Gm11823-201ENSMUST00000130582 2278 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Zfp935-201ENSMUST00000076195 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Zfp101-201ENSMUST00000167107 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Cyp2j5-201ENSMUST00000030299 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Dctn4-201ENSMUST00000025505 3738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Olfr427-202ENSMUST00000213832 3866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Gm11032-201ENSMUST00000109941 102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Gm15073-201ENSMUST00000117432 634 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Vmn1r-ps112-201ENSMUST00000117475 544 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Olfr1171-ps1-201ENSMUST00000118079 837 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Gm11859-201ENSMUST00000118099 455 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Gm12268-201ENSMUST00000118398 442 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Gm11737-201ENSMUST00000118713 468 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Gm14106-201ENSMUST00000119382 438 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Gm12303-201ENSMUST00000119506 673 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Gm14883-201ENSMUST00000120179 157 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Gm8061-201ENSMUST00000122380 350 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Ftx-201ENSMUST00000123841 673 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Gm23669-201ENSMUST00000157470 128 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Gm24402-201ENSMUST00000157873 91 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Gm24767-201ENSMUST00000158509 95 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Gm16566-201ENSMUST00000160387 910 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Hmgb3-ps-201ENSMUST00000162465 601 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Gm6395-201ENSMUST00000167639 691 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Gm3727-201ENSMUST00000168458 995 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Gm18343-201ENSMUST00000172802 604 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Gm20647-201ENSMUST00000176396 857 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Gm9892-201ENSMUST00000182415 992 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Gm26993-201ENSMUST00000182766 789 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Gm27679-201ENSMUST00000184612 84 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Gm21095-202ENSMUST00000185776 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Gm28700-201ENSMUST00000187614 579 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 1700084F23Rik-205ENSMUST00000191362 743 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Gm20770-201ENSMUST00000193474 694 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Gm36953-201ENSMUST00000195295 268 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Gm7181-201ENSMUST00000202197 434 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Gm43456-201ENSMUST00000202519 457 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 4930404I20Rik-201ENSMUST00000203246 498 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Gm44058-201ENSMUST00000204335 467 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Gm30717-201ENSMUST00000206549 494 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Gm33248-202ENSMUST00000206954 486 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Gm44910-201ENSMUST00000208451 396 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Olfr566-202ENSMUST00000209952 1066 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Gm8523-201ENSMUST00000211386 552 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 AC153845.2-203ENSMUST00000215889 617 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Olfr603-202ENSMUST00000218246 1021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 AC192333.6-201ENSMUST00000224565 725 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Ing3-201ENSMUST00000031680 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Olfr566-201ENSMUST00000071393 951 ntAPPRIS P2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Olfr8-201ENSMUST00000081571 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Gm23302-201ENSMUST00000082710 100 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 n-R5s204-201ENSMUST00000082972 119 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Mir7-2-201ENSMUST00000083675 97 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Olfr1046-201ENSMUST00000099902 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Gm7970-201ENSMUST00000167615 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Esp34-201ENSMUST00000173055 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Esp34-202ENSMUST00000178654 1413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Ccdc7b-201ENSMUST00000026912 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Capn6-201ENSMUST00000087316 3561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Gm37661-201ENSMUST00000191863 1550 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Pcdh9-207ENSMUST00000195376 5096 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Gm15581-201ENSMUST00000131334 5640 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Olfr821-202ENSMUST00000205181 1993 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Wrn-201ENSMUST00000033990 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Ttc37-205ENSMUST00000224386 6976 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Nfia-201ENSMUST00000052018 9249 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Gm37569-201ENSMUST00000192111 1722 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Gm20756-202ENSMUST00000201324 1565 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Olfr109-202ENSMUST00000214668 5861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Gm43359-201ENSMUST00000197944 2200 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Gm26078-201ENSMUST00000104067 128 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Gm12887-201ENSMUST00000106265 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Slamf7-201ENSMUST00000111276 1082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Gm5383-201ENSMUST00000121177 617 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Gm15885-201ENSMUST00000122114 388 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Gm12488-201ENSMUST00000122449 499 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Gm22199-201ENSMUST00000122660 126 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Gm14808-201ENSMUST00000129259 361 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Smyd1-204ENSMUST00000129630 376 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Gm12147-201ENSMUST00000144024 182 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Gm16085-201ENSMUST00000144575 453 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 5330429C05Rik-201ENSMUST00000154615 487 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Gm24444-201ENSMUST00000157244 308 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Gm23121-201ENSMUST00000157653 173 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Esp1-201ENSMUST00000161110 1049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Pfdn5-208ENSMUST00000170627 330 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 5730522E02Rik-208ENSMUST00000179180 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Gm26554-201ENSMUST00000180801 845 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 S100a11-ps-201ENSMUST00000181735 306 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.8 ms