Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Gm43974-201ENSMUST00000205080 684 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Gm35326-201ENSMUST00000218234 1041 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 AC131677.1-201ENSMUST00000218721 535 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 AC125539.1-202ENSMUST00000226449 670 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 AC139758.1-201ENSMUST00000226573 930 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Olfr957-201ENSMUST00000051653 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Igf1-202ENSMUST00000095360 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Nfia-205ENSMUST00000107062 9239 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Gm44675-201ENSMUST00000208188 2927 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Gm44434-201ENSMUST00000203918 3745 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 BB287469-201ENSMUST00000110149 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Gm4027-201ENSMUST00000164838 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Gm37195-201ENSMUST00000192006 3018 ntBASIC5.21□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r39-207ENSMUST00000228862 2398 ntAPPRIS P2 BASIC5.21□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Il1rapl1-203ENSMUST00000113966 9133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Atg4aQ8C9S8 Igkv14-100-201ENSMUST00000103325 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Atg4aQ8C9S8 Ighv5-16-201ENSMUST00000103458 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Atg4aQ8C9S8 Gm15018-201ENSMUST00000117090 633 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Atg4aQ8C9S8 Gm11483-201ENSMUST00000119839 247 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Atg4aQ8C9S8 Gm14167-201ENSMUST00000148705 433 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Atg4aQ8C9S8 Gm15795-201ENSMUST00000160969 553 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Atg4aQ8C9S8 Gm16558-201ENSMUST00000163015 532 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Atg4aQ8C9S8 Gm44501-201ENSMUST00000167713 1229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Atg4aQ8C9S8 Rpl31-ps24-201ENSMUST00000181350 379 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Atg4aQ8C9S8 Gm28871-201ENSMUST00000186191 687 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Atg4aQ8C9S8 Gm38280-201ENSMUST00000192610 158 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Atg4aQ8C9S8 Gm18452-201ENSMUST00000202968 1111 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Atg4aQ8C9S8 Gm44145-201ENSMUST00000203711 172 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Atg4aQ8C9S8 Gm45435-201ENSMUST00000211147 475 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Atg4aQ8C9S8 Gm45878-201ENSMUST00000211839 241 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Atg4aQ8C9S8 Gm5655-201ENSMUST00000221078 901 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Atg4aQ8C9S8 AC119241.1-201ENSMUST00000223651 534 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Atg4aQ8C9S8 AC154184.2-201ENSMUST00000225335 349 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Atg4aQ8C9S8 AC132112.1-201ENSMUST00000226354 505 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Atg4aQ8C9S8 Gtpbp8-201ENSMUST00000023348 836 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Atg4aQ8C9S8 Stfa2-201ENSMUST00000023619 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Atg4aQ8C9S8 Olfr948-201ENSMUST00000076516 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Atg4aQ8C9S8 n-R5s160-201ENSMUST00000083096 120 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Atg4aQ8C9S8 Gm22350-201ENSMUST00000083924 156 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Atg4aQ8C9S8 2310003L06Rik-201ENSMUST00000007601 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Atg4aQ8C9S8 5830444F18Rik-201ENSMUST00000194009 1992 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Atg4aQ8C9S8 Olfr725-202ENSMUST00000206920 1519 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Atg4aQ8C9S8 Zfp300-201ENSMUST00000040667 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Atg4aQ8C9S8 Gm28168-201ENSMUST00000191265 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Atg4aQ8C9S8 AC154627.2-201ENSMUST00000227028 4669 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Atg4aQ8C9S8 Olfr753-ps1-203ENSMUST00000208970 2764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Atg4aQ8C9S8 B3galt1-202ENSMUST00000112346 4977 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
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Atg4aQ8C9S8 Gm29260-201ENSMUST00000186391 2759 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
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Atg4aQ8C9S8 Zfp950-204ENSMUST00000143264 4825 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
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Atg4aQ8C9S8 Matr3-201ENSMUST00000166793 6262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
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Atg4aQ8C9S8 Mir676-201ENSMUST00000102443 89 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
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Atg4aQ8C9S8 Gm15719-201ENSMUST00000120619 635 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Atg4aQ8C9S8 4930519F16Rik-202ENSMUST00000127012 685 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Atg4aQ8C9S8 Mllt3-207ENSMUST00000148059 422 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Atg4aQ8C9S8 4930441J16Rik-201ENSMUST00000153743 516 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r160-201ENSMUST00000171745 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Atg4aQ8C9S8 Gm22923-201ENSMUST00000174952 110 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
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