Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 RMST_1.1-205ENSMUST00000218060 997 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 AC127279.1-201ENSMUST00000220140 637 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 CT030242.3-201ENSMUST00000221231 581 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Tmem209-211ENSMUST00000222934 1212 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Gm7040-201ENSMUST00000223271 443 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 AC129935.1-201ENSMUST00000226302 873 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Cst12-201ENSMUST00000028932 644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Olfr670-201ENSMUST00000050482 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Gm5215-201ENSMUST00000054380 405 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Ear6-201ENSMUST00000074477 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Olfr136-201ENSMUST00000077203 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Gm23628-201ENSMUST00000082464 173 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Gm23815-201ENSMUST00000083231 107 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Gm24254-201ENSMUST00000083702 104 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Gm23520-201ENSMUST00000093736 107 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Olfr570-201ENSMUST00000098215 1045 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Olfr1321-202ENSMUST00000215373 4482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Postn-202ENSMUST00000081564 2670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Zfp455-201ENSMUST00000117110 2556 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Mpp5-201ENSMUST00000082024 5470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Zfp975-201ENSMUST00000107992 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 4930402H24Rik-203ENSMUST00000119422 3815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Btbd35f19-201ENSMUST00000178444 1960 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Btbd35f20-201ENSMUST00000179325 1960 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Wnk3-206ENSMUST00000184730 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Fat1-201ENSMUST00000098796 14627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Olfr221-202ENSMUST00000214071 3044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Gm16513-201ENSMUST00000101023 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Olfr516-202ENSMUST00000216092 1493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Tubal3-201ENSMUST00000021639 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Hsfy2-201ENSMUST00000062085 1392 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Trbv12-1-201ENSMUST00000103267 389 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Gm24578-201ENSMUST00000103970 129 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Gm24160-201ENSMUST00000104594 126 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Mir190b-201ENSMUST00000104803 80 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Spata17-202ENSMUST00000110945 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Gm15670-201ENSMUST00000117740 447 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Gm14930-201ENSMUST00000118864 652 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Cabyr-203ENSMUST00000119108 818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Gm14607-201ENSMUST00000119119 491 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Xlr3e-ps-201ENSMUST00000119644 682 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Gm16463-201ENSMUST00000120527 721 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Olfr1379-ps1-201ENSMUST00000120726 1001 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Dnajc19-ps-201ENSMUST00000120890 351 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Gm13508-201ENSMUST00000121639 775 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Xlr3d-ps-201ENSMUST00000121687 658 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Gm12602-202ENSMUST00000154352 707 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Snora81-201ENSMUST00000157310 178 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Mir1946b-201ENSMUST00000157853 133 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 0610040B10Rik-201ENSMUST00000160231 501 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Gm27964-201ENSMUST00000185195 62 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Gm28097-201ENSMUST00000187333 366 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Gm28414-201ENSMUST00000190111 294 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Gm28655-201ENSMUST00000191538 692 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Gm37491-201ENSMUST00000192552 1111 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Gm38011-201ENSMUST00000193312 279 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Gm43096-201ENSMUST00000196173 421 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 AL645522.1-201ENSMUST00000197692 104 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Gm42438-201ENSMUST00000197832 974 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Gm6261-201ENSMUST00000204707 760 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 AC142273.1-201ENSMUST00000213723 673 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Gm6906-201ENSMUST00000218014 569 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 AC152979.4-201ENSMUST00000219893 379 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 AC164116.1-201ENSMUST00000225810 622 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 AC137117.1-201ENSMUST00000226912 441 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 AC125539.2-202ENSMUST00000227983 587 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 AC125539.2-201ENSMUST00000228339 753 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Olfr1123-201ENSMUST00000054974 972 ntAPPRIS P2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Gm4894-201ENSMUST00000067007 357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Olfr805-201ENSMUST00000078876 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Gm35256-201ENSMUST00000212780 3269 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Ros1-202ENSMUST00000218452 6960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Scn1a-203ENSMUST00000112366 8386 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Olfr716-206ENSMUST00000215284 3515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Kcnrg-202ENSMUST00000225582 1821 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.71□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Zfp605-201ENSMUST00000086686 2085 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Rgs7-207ENSMUST00000195324 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Vmn1r39-204ENSMUST00000227555 2297 ntAPPRIS P2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Gm19084-201ENSMUST00000222939 1762 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Olfr893-202ENSMUST00000211975 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Psmb6-ps-201ENSMUST00000117520 713 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Gm11346-201ENSMUST00000118346 704 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Vmn1r-ps2-201ENSMUST00000118464 834 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Gm11790-201ENSMUST00000119569 455 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Gm13339-201ENSMUST00000120651 510 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Xlr5e-ps-201ENSMUST00000122043 711 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Vmn2r-ps77-201ENSMUST00000174505 320 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Gm20648-201ENSMUST00000175815 328 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Rpl23a-ps12-201ENSMUST00000179178 468 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Otx2os1-201ENSMUST00000183522 866 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Ranbp2-ps8-201ENSMUST00000183723 345 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Gm27538-201ENSMUST00000185065 294 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Gm2950-201ENSMUST00000185530 520 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Gm18728-201ENSMUST00000186155 753 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Gm29281-201ENSMUST00000188077 381 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Gm18698-201ENSMUST00000192327 668 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Gm37550-201ENSMUST00000193230 463 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Gm9236-201ENSMUST00000196892 587 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Igkv12-47-201ENSMUST00000196961 356 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Gm43578-201ENSMUST00000201250 459 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.2 ms