Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

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Length 803 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 n-R5s93-201ENSMUST00000180091 119 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
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Tsr1Q5SWD9 Gm11394-201ENSMUST00000181421 517 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
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Tsr1Q5SWD9 Gm29345-201ENSMUST00000189213 399 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Tsr1Q5SWD9 Gm29522-201ENSMUST00000191530 621 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Tsr1Q5SWD9 Gm8182-201ENSMUST00000197863 769 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Tsr1Q5SWD9 Tprkb-208ENSMUST00000200680 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Tsr1Q5SWD9 Gm45005-201ENSMUST00000206640 157 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Tsr1Q5SWD9 Gm9652-201ENSMUST00000209345 163 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Tsr1Q5SWD9 Gm29785-201ENSMUST00000217033 383 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Tsr1Q5SWD9 CT025616.1-201ENSMUST00000221158 412 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Tsr1Q5SWD9 AC150661.1-201ENSMUST00000222563 495 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Tsr1Q5SWD9 Gm33489-201ENSMUST00000223171 673 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Tsr1Q5SWD9 CT025667.1-201ENSMUST00000225872 382 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Tsr1Q5SWD9 Gm25202-201ENSMUST00000082838 191 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Tsr1Q5SWD9 n-R5s89-201ENSMUST00000083532 104 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Tsr1Q5SWD9 Mir138-2-201ENSMUST00000083578 71 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Tsr1Q5SWD9 AC165260.6-206ENSMUST00000223884 3698 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Tsr1Q5SWD9 Gm37238-201ENSMUST00000195552 2390 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Tsr1Q5SWD9 Ccp110-201ENSMUST00000038650 4716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Tsr1Q5SWD9 Olfr1242-202ENSMUST00000111540 2189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Tsr1Q5SWD9 Gm21663-201ENSMUST00000196214 2864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Tsr1Q5SWD9 Ddr2-205ENSMUST00000194690 8590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Tsr1Q5SWD9 Tnr-202ENSMUST00000192069 12202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Tsr1Q5SWD9 Rapgef6-204ENSMUST00000108894 3475 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Tsr1Q5SWD9 Ms4a4c-201ENSMUST00000072729 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Tsr1Q5SWD9 Atf2-205ENSMUST00000112010 4037 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Tsr1Q5SWD9 Atf2-202ENSMUST00000090802 4016 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Tsr1Q5SWD9 Gm6614-202ENSMUST00000181628 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Tsr1Q5SWD9 Ifi208-201ENSMUST00000085876 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Tsr1Q5SWD9 Btbd35f22-201ENSMUST00000178747 1497 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Tsr1Q5SWD9 Tceal1-201ENSMUST00000055104 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Tsr1Q5SWD9 Nlrp5-201ENSMUST00000015866 3508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Tsr1Q5SWD9 Vmn1r81-202ENSMUST00000227080 13256 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
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Tsr1Q5SWD9 Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 9405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
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Tsr1Q5SWD9 Ptprc-204ENSMUST00000182755 4611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
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Tsr1Q5SWD9 Gm28472-202ENSMUST00000190133 1499 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Tsr1Q5SWD9 Kif2a-201ENSMUST00000022204 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Tsr1Q5SWD9 Zmynd11-201ENSMUST00000062658 3796 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Tsr1Q5SWD9 Virma-203ENSMUST00000108307 6571 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Tsr1Q5SWD9 Adipor2-201ENSMUST00000032272 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Tsr1Q5SWD9 Dock10-209ENSMUST00000190983 6672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
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