Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Ano5-201ENSMUST00000043944 7785 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Stk31-204ENSMUST00000172459 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 4921539E11Rik-202ENSMUST00000097944 1683 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Ddi1-201ENSMUST00000051706 7114 ntAPPRIS P1 BASIC4.17□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Cntn3-201ENSMUST00000032159 5183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Gm26019-201ENSMUST00000104407 119 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Gm22194-201ENSMUST00000116869 95 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Gm15385-201ENSMUST00000118725 667 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Gm14586-201ENSMUST00000119571 408 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 n-R5s45-201ENSMUST00000122592 110 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Rrm2b-203ENSMUST00000137636 900 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Gm17416-201ENSMUST00000163724 201 ntAPPRIS P1 BASIC4.17□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Gm3084-201ENSMUST00000169967 598 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 1700031A10Rik-201ENSMUST00000174380 656 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Gm28385-201ENSMUST00000185671 292 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 2610001A08Rik-201ENSMUST00000193315 867 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Gm37480-201ENSMUST00000194795 550 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Gm17954-201ENSMUST00000195893 607 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Gm42564-201ENSMUST00000196013 582 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Gm5660-201ENSMUST00000197453 1149 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Gm43084-201ENSMUST00000200696 947 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Gm18320-201ENSMUST00000211304 595 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Gm28710-202ENSMUST00000211738 2987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Olfr367-ps-203ENSMUST00000213819 541 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Olfr682-ps1-202ENSMUST00000214399 897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 CT030657.1-201ENSMUST00000222397 378 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 AC135377.1-201ENSMUST00000223692 463 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 AC117202.1-201ENSMUST00000227007 445 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Cd300ld2-201ENSMUST00000092463 381 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Chl1-201ENSMUST00000066905 7562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 AC126673.1-201ENSMUST00000223208 3856 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 March1-211ENSMUST00000178982 4012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Has2-201ENSMUST00000050544 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 2310003L06Rik-201ENSMUST00000007601 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Serpinb9f-201ENSMUST00000075515 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 4930467D21Rik-201ENSMUST00000180634 2530 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Olfr149-202ENSMUST00000215192 2806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r174-202ENSMUST00000228331 9058 ntAPPRIS P1 BASIC4.17□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Gm42717-201ENSMUST00000197309 3463 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Olfr916-203ENSMUST00000214093 3685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Aspn-201ENSMUST00000021820 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 BB287469-201ENSMUST00000110149 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Gm4027-201ENSMUST00000164838 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Trbv20-201ENSMUST00000103277 335 ntAPPRIS P1 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Gm15426-201ENSMUST00000117823 556 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Gm11698-201ENSMUST00000117948 455 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Gm14750-201ENSMUST00000118262 516 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Gm11262-201ENSMUST00000119326 833 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Gm14714-201ENSMUST00000119743 439 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Gm14916-201ENSMUST00000121904 204 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Gm15537-201ENSMUST00000126677 485 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Tmsb15l-201ENSMUST00000127404 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 4930441J16Rik-201ENSMUST00000153743 516 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Gm24690-201ENSMUST00000157759 97 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Gm22156-201ENSMUST00000158409 141 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Gm3191-201ENSMUST00000167139 346 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Gm17546-201ENSMUST00000168960 733 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Gm28190-201ENSMUST00000189766 722 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Gm42991-201ENSMUST00000196468 3837 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Olfr202-202ENSMUST00000201687 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Gm44176-201ENSMUST00000204336 276 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Gm44604-201ENSMUST00000205475 496 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 4930442G10Rik-202ENSMUST00000221968 1096 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 AC119241.1-201ENSMUST00000223651 534 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Gm5689-201ENSMUST00000041389 294 ntAPPRIS P1 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Gm6863-201ENSMUST00000052882 636 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Olfr430-201ENSMUST00000055873 954 ntAPPRIS P1 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Olfr1495-201ENSMUST00000061669 1089 ntAPPRIS P1 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Csn1s2b-201ENSMUST00000072539 810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Olfr493-201ENSMUST00000080106 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Gm22350-201ENSMUST00000083924 156 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 n-R5s151-201ENSMUST00000083959 119 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Olfr740-201ENSMUST00000089838 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Gm28154-201ENSMUST00000186267 4218 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Gm42927-201ENSMUST00000200624 3841 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Olfr107-205ENSMUST00000216844 4021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 1700017N19Rik-203ENSMUST00000187119 1524 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Olfr646-202ENSMUST00000214099 3778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Obox4-ps27-201ENSMUST00000179203 1362 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Olfr1308-202ENSMUST00000207560 2093 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Ccr2-201ENSMUST00000055918 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Gm38091-201ENSMUST00000192418 3871 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 AC168056.3-201ENSMUST00000225395 2540 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Cd84-205ENSMUST00000155802 3291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Igkv14-100-201ENSMUST00000103325 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Gm14288-202ENSMUST00000123863 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Gm24939-201ENSMUST00000158325 137 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Gm27222-201ENSMUST00000183398 427 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Gm37878-201ENSMUST00000192108 387 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Gm42912-201ENSMUST00000197195 716 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 AC174780.1-201ENSMUST00000199415 1107 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Dnajc5g-202ENSMUST00000201740 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Gm43449-201ENSMUST00000202955 371 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Gm3148-201ENSMUST00000203594 612 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Gm19908-201ENSMUST00000204684 391 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Gm44946-201ENSMUST00000208425 572 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Gm17766-201ENSMUST00000209223 442 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Gm32817-201ENSMUST00000210007 689 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 AC123944.2-201ENSMUST00000215290 382 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Cpne9Q1RLL3 Olfr44-203ENSMUST00000216316 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103 ms