Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Olfr270-204ENSMUST00000215127 3145 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Olfr1279-203ENSMUST00000216697 3385 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Kera-201ENSMUST00000105286 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Zfp989-202ENSMUST00000146688 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Pof1b-201ENSMUST00000039887 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 AC149294.7-201ENSMUST00000227475 1432 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm6162-201ENSMUST00000194870 2930 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm15394-201ENSMUST00000119656 1308 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Rapgef4-201ENSMUST00000028525 4109 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 A530064N14Rik-201ENSMUST00000195338 1492 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Olfr410-203ENSMUST00000214490 5075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Olfr1226-203ENSMUST00000215562 2669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Zfp874b-201ENSMUST00000019572 3744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Vmn2r112-201ENSMUST00000097381 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm45324-201ENSMUST00000211193 5638 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 5330434G04Rik-202ENSMUST00000136406 3545 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm13250-201ENSMUST00000117209 753 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm14878-201ENSMUST00000118167 293 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm15333-201ENSMUST00000118825 364 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm11387-201ENSMUST00000120266 772 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm13470-201ENSMUST00000123911 421 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm25525-201ENSMUST00000177701 107 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm26178-201ENSMUST00000177706 107 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm16434-202ENSMUST00000177712 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm3453-202ENSMUST00000178308 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm6676-202ENSMUST00000178376 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm3127-203ENSMUST00000178386 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm26465-201ENSMUST00000178517 107 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm24317-201ENSMUST00000178536 107 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm25021-201ENSMUST00000179184 107 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm3685-202ENSMUST00000179199 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm22995-201ENSMUST00000179670 107 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm24424-201ENSMUST00000179714 107 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm24389-201ENSMUST00000179962 107 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm25672-201ENSMUST00000180111 107 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm29163-201ENSMUST00000188029 107 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 2810429I04Rik-209ENSMUST00000188642 674 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 1700015G11Rik-204ENSMUST00000190307 255 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm7967-201ENSMUST00000190991 399 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm29020-201ENSMUST00000191166 290 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm37878-201ENSMUST00000192108 387 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm9931-201ENSMUST00000193584 1185 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm37167-201ENSMUST00000194946 396 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm45029-201ENSMUST00000208702 391 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm36371-201ENSMUST00000209043 1103 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 AC138284.2-201ENSMUST00000213982 567 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 AC122301.1-201ENSMUST00000219625 507 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Nsa2-203ENSMUST00000225410 974 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 AC131068.1-201ENSMUST00000226891 482 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Olfr907-201ENSMUST00000052901 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm23815-201ENSMUST00000083231 107 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm24319-201ENSMUST00000083389 107 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Mir338-201ENSMUST00000083666 98 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm23520-201ENSMUST00000093736 107 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Defb26-201ENSMUST00000099205 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm37964-201ENSMUST00000192459 4905 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Vsig4-201ENSMUST00000050707 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Olfr1178-202ENSMUST00000214040 6480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Olfr124-202ENSMUST00000215168 4497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Elavl4-204ENSMUST00000106598 3997 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm37041-201ENSMUST00000195873 3853 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Oxr1-202ENSMUST00000090095 4156 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 5830405F06Rik-201ENSMUST00000192753 1755 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Prkdc-201ENSMUST00000023352 12647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm15624-203ENSMUST00000204811 3402 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Mid2-203ENSMUST00000112993 5916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Rps11-ps5-201ENSMUST00000117302 472 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm14082-201ENSMUST00000118582 801 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm15090-201ENSMUST00000118787 1196 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm15089-201ENSMUST00000122332 1196 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm12122-201ENSMUST00000124503 454 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm24960-201ENSMUST00000157923 90 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Obox4-ps26-201ENSMUST00000176368 724 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm20594-201ENSMUST00000179797 449 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm4842-201ENSMUST00000183237 835 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm19206-201ENSMUST00000186401 827 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm29443-202ENSMUST00000190297 410 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm37740-202ENSMUST00000194757 621 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm37989-201ENSMUST00000195202 803 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm37836-201ENSMUST00000195875 175 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm44300-201ENSMUST00000196792 121 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm43315-201ENSMUST00000198120 313 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 AC120011.1-201ENSMUST00000202147 744 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm40293-201ENSMUST00000202596 485 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm44077-201ENSMUST00000203453 435 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm38825-201ENSMUST00000204022 648 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Snhg1-207ENSMUST00000205909 709 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm45037-201ENSMUST00000207475 673 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 AC166902.1-201ENSMUST00000216653 517 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Olfr685-204ENSMUST00000217432 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 AC129935.1-201ENSMUST00000226302 873 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 CT030662.2-201ENSMUST00000226942 805 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Tas2r103-201ENSMUST00000032317 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Ttc33-202ENSMUST00000081640 1583 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Ccl26-201ENSMUST00000094226 282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Olfr1277-201ENSMUST00000099619 962 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Fastkd2-201ENSMUST00000027103 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm35755-201ENSMUST00000222392 2077 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Arrdc3-205ENSMUST00000161441 1908 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Pax6os1-202ENSMUST00000149133 1464 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
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