Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Gm4912-201ENSMUST00000122212 1044 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Gm2165-201ENSMUST00000124609 1118 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Gm14553-201ENSMUST00000126711 1118 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Gm2101-204ENSMUST00000137421 1118 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Gm3669-205ENSMUST00000144018 1118 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Gm13411-201ENSMUST00000149429 414 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Gm23591-201ENSMUST00000157663 286 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Gm23554-201ENSMUST00000157818 110 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Il1rl1-205ENSMUST00000174335 1216 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Fam107b-206ENSMUST00000176254 300 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Gm7497-201ENSMUST00000183064 1003 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Mir7031-201ENSMUST00000183860 65 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Gm29479-201ENSMUST00000190352 455 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Mug-ps1-203ENSMUST00000190643 655 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Gm8823-201ENSMUST00000193158 433 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Gm8790-201ENSMUST00000194108 322 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Gm43370-201ENSMUST00000196437 284 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Mir7682-201ENSMUST00000198467 58 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Gm43028-201ENSMUST00000202561 481 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Gm8774-201ENSMUST00000203621 692 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rps29P62274 4930470O06Rik-201ENSMUST00000209438 662 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Gm45434-201ENSMUST00000210550 293 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rps29P62274 AC152062.1-201ENSMUST00000218129 386 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Gm31931-201ENSMUST00000219666 222 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rps29P62274 AC153370.1-201ENSMUST00000220296 635 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Rps29P62274 AC158523.1-201ENSMUST00000221398 328 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Gm46369-201ENSMUST00000221577 401 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rps29P62274 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Prl2a1-201ENSMUST00000023602 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Dynap-201ENSMUST00000025390 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Olfr1205-201ENSMUST00000076438 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Gm156-201ENSMUST00000095409 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
Rps29P62274 2210418O10Rik-203ENSMUST00000136719 2314 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Olfr1231-202ENSMUST00000216144 3961 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Macf1-206ENSMUST00000106224 23402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Akr1c14-201ENSMUST00000041768 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Gm43648-201ENSMUST00000197775 2485 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Gm44530-201ENSMUST00000207920 3559 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Gm7269-201ENSMUST00000210819 1373 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Gm14781-201ENSMUST00000078469 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Mageb5-201ENSMUST00000082048 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Gm43317-201ENSMUST00000197924 2544 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Btbd35f17-201ENSMUST00000105014 1960 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Ints12-201ENSMUST00000029650 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Vmn2r-ps129-201ENSMUST00000177509 2568 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Gm43426-201ENSMUST00000197287 2597 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Efhc2-201ENSMUST00000026014 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Sorbs2-203ENSMUST00000124544 3798 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Olfr685-203ENSMUST00000214712 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Gm44678-201ENSMUST00000207828 2775 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Olfr1438-ps1-201ENSMUST00000208398 4761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Plcb4-201ENSMUST00000035646 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Abca5-201ENSMUST00000043961 8231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Vmn2r-ps47-201ENSMUST00000174515 2557 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Vmn2r107-201ENSMUST00000042090 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Srek1-204ENSMUST00000210489 6330 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
Rps29P62274 AC153969.1-201ENSMUST00000214047 2605 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Rps29P62274 AC160130.1-201ENSMUST00000220734 2735 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Gm26869-201ENSMUST00000181241 3523 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Nlrp4f-201ENSMUST00000037372 3527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Xrn1-202ENSMUST00000185633 10256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Iigp1-202ENSMUST00000066912 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
Rps29P62274 9430018G01Rik-201ENSMUST00000203260 3758 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Igkv8-19-201ENSMUST00000103389 305 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Rps29P62274 2210407C18Rik-202ENSMUST00000108821 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Smpx-203ENSMUST00000112521 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Acbd7-201ENSMUST00000115089 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Gm15994-201ENSMUST00000118029 402 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Cyp2j7-ps2-201ENSMUST00000119189 179 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Gm5379-201ENSMUST00000120973 826 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Gm6027-201ENSMUST00000121467 756 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Rps29P62274 1810065E05Rik-201ENSMUST00000013797 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Gm13180-201ENSMUST00000141222 440 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Tarbp2-207ENSMUST00000142114 420 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Rps29P62274 4930548K13Rik-201ENSMUST00000154459 561 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Vmn1r175-201ENSMUST00000166141 915 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Vmn2r-ps74-201ENSMUST00000174705 917 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Gm23799-201ENSMUST00000175559 120 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Rpl31-ps18-201ENSMUST00000180885 377 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Snhg6-205ENSMUST00000182819 816 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Mir6960-201ENSMUST00000183449 61 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Mir7222-201ENSMUST00000183740 75 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Mir7074-201ENSMUST00000183884 63 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Obox8-201ENSMUST00000184356 1167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Mir6943-201ENSMUST00000185186 66 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Gm28304-201ENSMUST00000185977 312 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Gm5058-201ENSMUST00000187331 463 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Gm29256-201ENSMUST00000189094 312 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Gm28396-201ENSMUST00000190309 379 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Gm28484-201ENSMUST00000190606 312 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Gm18547-201ENSMUST00000192439 811 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Gm43853-201ENSMUST00000197162 301 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Gm42451-201ENSMUST00000197410 244 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Gstm2-ps1-201ENSMUST00000201478 657 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Gm42666-201ENSMUST00000201954 152 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Clec2f-202ENSMUST00000204981 657 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Gm45006-201ENSMUST00000206078 690 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Olfr1492-ps1-201ENSMUST00000207071 865 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Rps29P62274 AC153870.1-201ENSMUST00000219599 560 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Rps29P62274 AC159244.1-201ENSMUST00000220964 594 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83 ms