Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Olfr655-201ENSMUST00000057385 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm24763-201ENSMUST00000083688 190 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm45129-201ENSMUST00000208444 2224 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm44288-201ENSMUST00000205061 2795 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm13919-202ENSMUST00000140238 1552 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Stag2-202ENSMUST00000115072 5955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 4930532I03Rik-201ENSMUST00000218463 1724 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 AC132336.1-201ENSMUST00000222844 1740 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Ceacam5-201ENSMUST00000081907 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Olfr123-203ENSMUST00000216051 2716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Olfr351-202ENSMUST00000213676 3426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Olfr548-ps1-202ENSMUST00000210064 4287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Cdh12-203ENSMUST00000227496 6004 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm38375-201ENSMUST00000194610 2227 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm38106-201ENSMUST00000194107 2534 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Olfr1469-202ENSMUST00000216910 4106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Vmn1r217-203ENSMUST00000228656 9767 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Chek1-205ENSMUST00000173963 1509 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Lrp1b-208ENSMUST00000167270 10071 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Ighv9-4-201ENSMUST00000103482 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm24789-201ENSMUST00000104282 131 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Mir1192-201ENSMUST00000116976 121 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Rpl23a-ps4-201ENSMUST00000121008 455 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm12001-201ENSMUST00000121727 913 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 n-R5s21-201ENSMUST00000122692 117 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm12224-202ENSMUST00000127107 726 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Bloc1s1-202ENSMUST00000131271 475 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Nr6a1os-202ENSMUST00000151229 525 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm16147-201ENSMUST00000162143 373 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm3486-201ENSMUST00000169361 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm4181-201ENSMUST00000170249 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm19200-201ENSMUST00000182579 1001 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Mir6344-201ENSMUST00000183462 104 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm38180-201ENSMUST00000192381 395 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm43774-201ENSMUST00000196327 878 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm43507-201ENSMUST00000196411 675 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm36548-201ENSMUST00000197473 685 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 C030015E24Rik-201ENSMUST00000198148 828 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm4321-201ENSMUST00000200520 442 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm19065-202ENSMUST00000203910 1165 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm18850-201ENSMUST00000211578 388 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 AC142273.1-201ENSMUST00000213723 673 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 CT025616.1-201ENSMUST00000221158 412 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 AC165283.1-201ENSMUST00000223390 307 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Olfr739-201ENSMUST00000075261 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Dynlrb2-201ENSMUST00000078170 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Olfr347-201ENSMUST00000078761 943 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm8724-201ENSMUST00000081668 483 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Mir134-201ENSMUST00000083492 71 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Olfr1105-201ENSMUST00000099868 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Olfr330-202ENSMUST00000213188 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Erbin-204ENSMUST00000169083 5435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gpr21-201ENSMUST00000065441 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm6545-201ENSMUST00000217186 1786 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Olfr987-203ENSMUST00000216347 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Fndc3c1-201ENSMUST00000039447 4859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm43886-201ENSMUST00000205039 2386 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm15737-201ENSMUST00000113434 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm38243-201ENSMUST00000194737 1567 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Hormad1-204ENSMUST00000171191 1437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm15828-201ENSMUST00000119911 522 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm13676-201ENSMUST00000122185 591 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm23587-201ENSMUST00000157658 84 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm22804-201ENSMUST00000158052 101 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm25865-201ENSMUST00000158247 104 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm6245-201ENSMUST00000164699 768 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm21232-201ENSMUST00000182187 1006 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Mir7012-201ENSMUST00000183900 64 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm5252-201ENSMUST00000189030 909 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm28189-201ENSMUST00000190085 571 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm29478-201ENSMUST00000191272 688 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm17953-201ENSMUST00000192061 667 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Csn2-204ENSMUST00000196869 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 BC037156-201ENSMUST00000196993 430 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm43308-201ENSMUST00000197236 373 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 AC123835.1-201ENSMUST00000214362 670 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 AC126043.1-201ENSMUST00000221304 1141 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 AC122465.3-201ENSMUST00000221644 355 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 CT030166.1-201ENSMUST00000222654 357 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 AC154576.2-203ENSMUST00000224736 253 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Pik3c2g-201ENSMUST00000032353 1206 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 2900092C05Rik-201ENSMUST00000032541 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Olfr827-201ENSMUST00000058123 1058 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Olfr134-201ENSMUST00000074883 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm24706-201ENSMUST00000082806 137 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 n-R5s167-201ENSMUST00000083227 121 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm156-201ENSMUST00000095409 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm14399-201ENSMUST00000099029 192 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Olfr1501-203ENSMUST00000215350 4395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Vmn1r89-204ENSMUST00000227239 1992 ntAPPRIS P2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm7416-201ENSMUST00000117448 1487 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm42615-201ENSMUST00000197704 1820 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Fign-203ENSMUST00000131615 9734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Cnot1-201ENSMUST00000068452 8152 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Polk-202ENSMUST00000091387 2382 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Vmn1r209-202ENSMUST00000227038 6461 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm9921-201ENSMUST00000173293 4399 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm17791-201ENSMUST00000185660 1501 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Cep290-201ENSMUST00000164751 8006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm19335-201ENSMUST00000195836 2069 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.5 ms