Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 Gm25982-201ENSMUST00000157920 101 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
LmnaP48678 Gm22085-201ENSMUST00000158344 110 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
LmnaP48678 Gm17081-201ENSMUST00000167363 478 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
LmnaP48678 Gm1979-202ENSMUST00000170224 666 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
LmnaP48678 Obox3-ps2-201ENSMUST00000177243 1004 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
LmnaP48678 Gm22911-201ENSMUST00000177920 107 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
LmnaP48678 Gm26177-201ENSMUST00000178683 107 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
LmnaP48678 Gm26969-201ENSMUST00000183203 648 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
LmnaP48678 Gm29376-201ENSMUST00000189357 835 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
LmnaP48678 Ighv12-1-201ENSMUST00000195542 329 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
LmnaP48678 2900002M20Rik-201ENSMUST00000195754 330 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
LmnaP48678 Gm36448-201ENSMUST00000199916 438 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
LmnaP48678 Gm44984-201ENSMUST00000207802 394 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
LmnaP48678 Gm45883-201ENSMUST00000210131 853 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
LmnaP48678 Gm17990-201ENSMUST00000211728 553 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
LmnaP48678 Gm18488-201ENSMUST00000215082 364 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
LmnaP48678 AC126554.1-201ENSMUST00000222161 271 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
LmnaP48678 AC139197.1-201ENSMUST00000228332 813 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
LmnaP48678 1700007K09Rik-201ENSMUST00000033146 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
LmnaP48678 Olfr123-201ENSMUST00000054748 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
LmnaP48678 Olfr1126-201ENSMUST00000071355 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
LmnaP48678 Olfr830-201ENSMUST00000078861 948 ntAPPRIS P2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
LmnaP48678 Gm23406-201ENSMUST00000082537 122 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
LmnaP48678 Gm24610-201ENSMUST00000083270 109 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
LmnaP48678 Olfr461-201ENSMUST00000089490 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
LmnaP48678 AC167013.5-201ENSMUST00000227597 2947 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
LmnaP48678 Gm44956-201ENSMUST00000208277 2887 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
LmnaP48678 Olfr1242-203ENSMUST00000143935 2406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
LmnaP48678 Scel-201ENSMUST00000095576 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
LmnaP48678 Kcnc2-202ENSMUST00000218445 4033 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
LmnaP48678 Cyb5r2-201ENSMUST00000052438 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
LmnaP48678 Mybpc1-202ENSMUST00000121629 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
LmnaP48678 Synj2bp-203ENSMUST00000163402 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
LmnaP48678 Vmn1r39-201ENSMUST00000226217 2258 ntAPPRIS P2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
LmnaP48678 Vmn1r39-204ENSMUST00000227555 2297 ntAPPRIS P2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
LmnaP48678 Vmn1r39-205ENSMUST00000228008 2283 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
LmnaP48678 Olfr1279-203ENSMUST00000216697 3385 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
LmnaP48678 Agl-201ENSMUST00000040603 9625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
LmnaP48678 Vmn1r6-206ENSMUST00000227847 8073 ntAPPRIS P2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
LmnaP48678 Gm38128-201ENSMUST00000192085 3250 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
LmnaP48678 Oas2-202ENSMUST00000081491 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
LmnaP48678 Ttll6-202ENSMUST00000167258 3205 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
LmnaP48678 Nlrc4-201ENSMUST00000052124 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
LmnaP48678 AC159308.1-201ENSMUST00000216615 1351 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
LmnaP48678 Rnf180-202ENSMUST00000224011 3785 ntAPPRIS P2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
LmnaP48678 B020004J07Rik-201ENSMUST00000084386 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
LmnaP48678 Tmprss11a-201ENSMUST00000101073 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
LmnaP48678 Tdrkh-207ENSMUST00000197901 2652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
LmnaP48678 Itih4-201ENSMUST00000006703 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
LmnaP48678 Itih4-202ENSMUST00000078490 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
LmnaP48678 D830026I12Rik-203ENSMUST00000151170 1607 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
LmnaP48678 Gm44675-201ENSMUST00000208188 2927 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
LmnaP48678 Gm10603-202ENSMUST00000184420 4520 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
LmnaP48678 AC151530.1-203ENSMUST00000223343 2591 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
LmnaP48678 Mfap1a-201ENSMUST00000089926 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
LmnaP48678 Hmgb1-rs18-201ENSMUST00000117940 627 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
LmnaP48678 Gm15149-201ENSMUST00000119370 360 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
LmnaP48678 Olfr405-ps1-201ENSMUST00000120649 936 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
LmnaP48678 Gm13009-201ENSMUST00000121307 267 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
LmnaP48678 Gm3810-201ENSMUST00000122413 476 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
LmnaP48678 Gm15700-201ENSMUST00000139791 821 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
LmnaP48678 Gm11940-201ENSMUST00000153599 417 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
LmnaP48678 5330429C05Rik-201ENSMUST00000154615 487 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
LmnaP48678 Mir1960-201ENSMUST00000157488 78 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
LmnaP48678 Gm25717-201ENSMUST00000158631 353 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
LmnaP48678 Gm22116-201ENSMUST00000158791 141 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
LmnaP48678 Hspe1-ps3-201ENSMUST00000172726 277 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
LmnaP48678 Gm45844-201ENSMUST00000173842 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
LmnaP48678 1700120O09Rik-201ENSMUST00000177127 977 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
LmnaP48678 Gm4617-201ENSMUST00000178993 331 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
LmnaP48678 Prl3c1-201ENSMUST00000018066 823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
LmnaP48678 Gm27161-201ENSMUST00000183960 562 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
LmnaP48678 Gm27694-201ENSMUST00000184740 86 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
LmnaP48678 4930553J12Rik-202ENSMUST00000187823 851 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
LmnaP48678 Gm28985-201ENSMUST00000189261 356 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
LmnaP48678 1700025B11Rik-201ENSMUST00000190233 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
LmnaP48678 Gm28951-201ENSMUST00000190742 313 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
LmnaP48678 Gm6631-201ENSMUST00000193699 559 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
LmnaP48678 Olfr496-ps1-201ENSMUST00000208862 915 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
LmnaP48678 Gm9685-201ENSMUST00000211275 538 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
LmnaP48678 Gm45911-201ENSMUST00000211844 601 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
LmnaP48678 AC159244.1-201ENSMUST00000220964 594 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
LmnaP48678 CT025616.1-201ENSMUST00000221158 412 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
LmnaP48678 Gm5457-201ENSMUST00000022260 333 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
LmnaP48678 AC125399.1-201ENSMUST00000224236 595 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
LmnaP48678 Cst9-201ENSMUST00000028935 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
LmnaP48678 Olfr881-201ENSMUST00000074611 948 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
LmnaP48678 Olfr746-201ENSMUST00000080616 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
LmnaP48678 Gm23238-201ENSMUST00000083007 164 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
LmnaP48678 Gm24695-201ENSMUST00000083877 83 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
LmnaP48678 Olfr1314-201ENSMUST00000099598 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
LmnaP48678 Wars2-201ENSMUST00000004343 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
LmnaP48678 Gm42680-201ENSMUST00000196238 2500 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
LmnaP48678 Gm15475-201ENSMUST00000137673 3757 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
LmnaP48678 Gm40518-202ENSMUST00000214538 4080 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
LmnaP48678 Olfr527-202ENSMUST00000214143 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
LmnaP48678 Zfp27-202ENSMUST00000159920 3381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
LmnaP48678 Sgip1-205ENSMUST00000106882 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
LmnaP48678 Ckap5-203ENSMUST00000111337 6384 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
LmnaP48678 Gm42513-201ENSMUST00000197831 2119 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
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