Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Gm18180-201ENSMUST00000187562 1484 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PtprkP35822 Serf1-202ENSMUST00000129014 543 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PtprkP35822 Mir6917-201ENSMUST00000184111 61 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PtprkP35822 Gm29045-201ENSMUST00000187278 698 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PtprkP35822 Gm43774-201ENSMUST00000196327 878 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PtprkP35822 Olfr724-202ENSMUST00000213390 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PtprkP35822 AC122188.1-201ENSMUST00000217534 312 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PtprkP35822 AC134528.1-201ENSMUST00000219156 387 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PtprkP35822 AC159244.1-201ENSMUST00000220964 594 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PtprkP35822 AC159622.1-201ENSMUST00000221004 554 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PtprkP35822 Gm45884-201ENSMUST00000209540 3416 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PtprkP35822 Vmn1r90-209ENSMUST00000227855 7362 ntAPPRIS P2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Nlrp4f-204ENSMUST00000221659 3551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Gm35439-201ENSMUST00000200051 4809 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Pcdh15-201ENSMUST00000064562 8830 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Gm43065-201ENSMUST00000198971 2092 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Olfr1501-203ENSMUST00000215350 4395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Kcnj1-202ENSMUST00000172015 3075 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Vmn1r195-202ENSMUST00000228711 3056 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Olfr578-202ENSMUST00000215606 3665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Gm11393-201ENSMUST00000118019 288 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Gm23755-201ENSMUST00000157578 343 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Gm22398-201ENSMUST00000174941 125 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Gm25731-201ENSMUST00000175167 125 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Obox8-201ENSMUST00000184356 1167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Traj57-202ENSMUST00000196977 63 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PtprkP35822 AC154335.1-201ENSMUST00000224744 395 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Olfr1484-201ENSMUST00000074180 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Olfr1487-201ENSMUST00000076856 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Mup21-201ENSMUST00000077719 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Gm25818-201ENSMUST00000083282 164 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Cntnap5a-201ENSMUST00000043725 10945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Gm3772-201ENSMUST00000221404 1887 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
PtprkP35822 AC153532.2-201ENSMUST00000219753 3844 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Gm37611-201ENSMUST00000195250 2028 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Nptn-205ENSMUST00000176250 4531 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Gm37639-201ENSMUST00000191623 2785 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Zfp935-201ENSMUST00000076195 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PtprkP35822 AC149588.1-201ENSMUST00000228274 3745 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Igkv7-33-201ENSMUST00000103376 362 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Gm23319-201ENSMUST00000104467 131 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Gm23666-201ENSMUST00000158053 116 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Iltifb-201ENSMUST00000163808 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Gm4567-202ENSMUST00000190554 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Gm10668-202ENSMUST00000191073 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Gm4322-201ENSMUST00000191094 336 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Gm38326-201ENSMUST00000194030 686 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PtprkP35822 AL772397.1-201ENSMUST00000216707 606 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Gm35615-201ENSMUST00000221255 719 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Gm10037-202ENSMUST00000221266 549 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PtprkP35822 AC168059.1-201ENSMUST00000225846 841 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Fhl5-201ENSMUST00000029922 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Cldn34c4-201ENSMUST00000052500 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PtprkP35822 n-R5s54-201ENSMUST00000083837 112 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Olfr199-201ENSMUST00000099657 931 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Vmn1r34-204ENSMUST00000226999 3048 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Gm19176-201ENSMUST00000222149 1831 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Vmn1r71-203ENSMUST00000227003 5048 ntAPPRIS P2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PtprkP35822 1700097M23Rik-201ENSMUST00000204079 1522 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Serpini1-201ENSMUST00000029423 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Ryr3-204ENSMUST00000134358 14958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Pot1a-203ENSMUST00000115330 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Wnk3-206ENSMUST00000184730 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Slfn8-202ENSMUST00000092838 3529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Olfr895-202ENSMUST00000212156 1558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Gm15268-201ENSMUST00000118845 352 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Gm5974-201ENSMUST00000181607 986 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Gm39197-201ENSMUST00000212069 457 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Gm44587-201ENSMUST00000207399 1685 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Pign-201ENSMUST00000070699 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Olfr1171-ps1-202ENSMUST00000150178 1398 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Olfr38-202ENSMUST00000215796 2782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Oxr1-202ENSMUST00000090095 4156 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Pcdh15-203ENSMUST00000105424 6932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Gm15313-201ENSMUST00000119179 282 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Gm14246-201ENSMUST00000155173 680 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Gm22156-201ENSMUST00000158409 141 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Gm23215-201ENSMUST00000178153 121 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Gm27457-201ENSMUST00000184771 156 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PtprkP35822 AC163354.1-207ENSMUST00000221270 1243 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtprkP35822 AC154467.1-201ENSMUST00000227527 449 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Olfr1242-201ENSMUST00000099777 1053 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Fbxw16-201ENSMUST00000084984 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Slc22a30-202ENSMUST00000096269 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Vmn1r214-202ENSMUST00000227236 3892 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Lifr-203ENSMUST00000171588 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Ubr4-201ENSMUST00000097822 15928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Rag2-202ENSMUST00000111227 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Gm42996-201ENSMUST00000196116 1636 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Vmn2r88-202ENSMUST00000159674 3098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Tet1-206ENSMUST00000174189 14369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Gm25272-201ENSMUST00000104293 128 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Ifna-ps1-201ENSMUST00000119856 555 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Gm11398-201ENSMUST00000120330 320 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Olfr1118-201ENSMUST00000121296 996 ntAPPRIS P2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Gm14637-201ENSMUST00000156516 444 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Gm22011-201ENSMUST00000158790 123 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Gm17416-201ENSMUST00000163724 201 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PtprkP35822 1700126H18Rik-201ENSMUST00000201903 405 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Gm7587-201ENSMUST00000207618 1021 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms