Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Gm18805-201ENSMUST00000206872 655 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Olfr1430-ps1-201ENSMUST00000207422 917 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gm45246-201ENSMUST00000210820 367 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 AC119892.1-201ENSMUST00000217997 384 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Fkbp1a-ps2-201ENSMUST00000219474 311 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 AC116589.7-201ENSMUST00000221061 239 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 AC174082.1-201ENSMUST00000221106 307 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gm17890-201ENSMUST00000221419 757 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 AC164117.1-201ENSMUST00000221726 239 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 AC149586.1-201ENSMUST00000222647 645 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 CT956049.1-201ENSMUST00000225671 763 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Olfr168-201ENSMUST00000078554 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Olfr8-201ENSMUST00000081571 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gm25134-201ENSMUST00000082646 160 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 AC121844.3-201ENSMUST00000219124 1785 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Vmn2r5-202ENSMUST00000177184 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gm5930-201ENSMUST00000111863 1746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Lcor-202ENSMUST00000163929 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Obox7-203ENSMUST00000183788 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gm37854-201ENSMUST00000192149 1463 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Mmp13-201ENSMUST00000015394 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Olfr362-202ENSMUST00000213817 4059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Pum2-204ENSMUST00000163569 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 B130034C11Rik-201ENSMUST00000175717 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Rbm46os-201ENSMUST00000131274 3261 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Rbm41-201ENSMUST00000033810 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gm7919-201ENSMUST00000202043 1389 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Vmn1r61-201ENSMUST00000164880 1818 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gm44220-201ENSMUST00000203784 2487 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Olfr1298-202ENSMUST00000208284 1563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Olfr1170-202ENSMUST00000214386 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Olfr183-201ENSMUST00000073320 2040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Map9-201ENSMUST00000091014 6218 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gm4973-201ENSMUST00000206925 1334 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Vmn2r-ps119-201ENSMUST00000177481 2406 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gm37226-201ENSMUST00000191644 3255 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Olfr633-202ENSMUST00000216006 3915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Olfr378-201ENSMUST00000069790 1508 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gm44027-201ENSMUST00000203419 3480 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Cep112-203ENSMUST00000106718 839 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Olfr328-202ENSMUST00000108824 1199 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gm7146-201ENSMUST00000116079 739 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Dynlt1-ps1-201ENSMUST00000117045 342 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gm15312-201ENSMUST00000118827 271 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gm9085-201ENSMUST00000119994 1072 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gm14506-201ENSMUST00000121165 536 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gm15309-201ENSMUST00000121644 240 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gm13077-201ENSMUST00000121941 484 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gm13942-201ENSMUST00000136950 325 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gm15521-201ENSMUST00000141752 835 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gm9597-201ENSMUST00000171913 602 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gm20468-201ENSMUST00000172664 452 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gm19932-201ENSMUST00000177033 313 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gm26426-201ENSMUST00000177866 123 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gm26060-201ENSMUST00000180094 123 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gm27252-201ENSMUST00000183782 689 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gm7870-201ENSMUST00000184467 616 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gm29053-201ENSMUST00000187484 370 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gm37135-201ENSMUST00000192652 534 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gm37123-201ENSMUST00000192994 1171 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gm3351-201ENSMUST00000193454 505 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 2900037B21Rik-201ENSMUST00000194352 337 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Obox4-ps5-201ENSMUST00000196368 397 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gm21006-201ENSMUST00000196930 667 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Obox4-ps10-201ENSMUST00000199376 504 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gm26691-203ENSMUST00000200444 479 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gm44818-201ENSMUST00000206608 358 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gm3690-201ENSMUST00000211341 262 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 AC153845.2-203ENSMUST00000215889 617 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gm7530-201ENSMUST00000218466 605 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 4930543I11Rik-201ENSMUST00000219006 959 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gm18704-201ENSMUST00000219736 446 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gm46332-202ENSMUST00000220320 516 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 AC140930.4-201ENSMUST00000220750 150 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 AC154733.1-201ENSMUST00000221126 679 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gm46430-203ENSMUST00000221389 1049 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 AC155314.1-201ENSMUST00000227624 508 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gm9772-201ENSMUST00000075018 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Rps26-ps1-201ENSMUST00000077208 449 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 n-R5s88-201ENSMUST00000083173 118 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Mir412-201ENSMUST00000083636 80 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gm14296-201ENSMUST00000099007 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 2210418O10Rik-201ENSMUST00000099009 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Olfr1046-201ENSMUST00000099902 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Vps41-201ENSMUST00000072961 3199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gng12-201ENSMUST00000043148 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 A530064N14Rik-201ENSMUST00000195338 1492 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gnpnat1-206ENSMUST00000227468 1490 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 AC131586.2-202ENSMUST00000227016 2705 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 1700017N19Rik-201ENSMUST00000041162 1691 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Olfr893-202ENSMUST00000211975 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Olfr690-203ENSMUST00000216230 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Catsperg1-212ENSMUST00000169143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Tbl1xr1-201ENSMUST00000063988 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Cep57l1-201ENSMUST00000019951 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Dst-215ENSMUST00000185269 16340 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Scn9a-206ENSMUST00000164384 7530 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Lrrc4c-202ENSMUST00000135431 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gm9314-201ENSMUST00000199881 1528 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Olfr385-202ENSMUST00000215689 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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