Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 AC172027.1-201ENSMUST00000217659 337 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 AC153526.4-201ENSMUST00000217713 379 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 AC174459.2-201ENSMUST00000226036 160 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Spink1-201ENSMUST00000025381 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Enkur-201ENSMUST00000027992 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Vmn1r89-201ENSMUST00000053008 951 ntAPPRIS P2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Krtap31-2-201ENSMUST00000058761 935 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Olfr955-201ENSMUST00000073946 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Gm16442-201ENSMUST00000079099 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Gm22971-201ENSMUST00000083305 97 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Olfr1140-201ENSMUST00000214723 1421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Gm15170-201ENSMUST00000121593 2023 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Gm8104-201ENSMUST00000168165 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Gm37498-201ENSMUST00000193524 4002 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Olfr706-202ENSMUST00000213918 4828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Frmpd3-201ENSMUST00000044702 3141 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Arrdc3-201ENSMUST00000099356 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm24117-201ENSMUST00000103973 133 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm12520-201ENSMUST00000117493 316 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 1700034E13Rik-202ENSMUST00000118724 490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm15168-201ENSMUST00000121057 316 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm23902-201ENSMUST00000157571 134 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm26310-201ENSMUST00000157766 117 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Vmn2r-ps59-201ENSMUST00000174596 135 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm21971-201ENSMUST00000180187 337 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm28503-201ENSMUST00000185966 147 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm29563-201ENSMUST00000187249 496 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm29011-201ENSMUST00000191059 712 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm37300-201ENSMUST00000193327 280 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm37223-202ENSMUST00000193592 490 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Rpl18a-ps2-201ENSMUST00000197158 174 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm36259-201ENSMUST00000197340 392 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm4734-201ENSMUST00000200117 777 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm40323-201ENSMUST00000200649 645 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Olfr1492-ps1-201ENSMUST00000207071 865 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Vmn2r-ps61-201ENSMUST00000207286 889 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm45458-201ENSMUST00000209900 522 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 AC127581.1-201ENSMUST00000214084 771 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm40271-201ENSMUST00000221752 422 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 AC211878.2-201ENSMUST00000222486 488 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 CT025552.2-201ENSMUST00000225497 317 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 AC131747.1-201ENSMUST00000226159 793 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 AC154738.4-201ENSMUST00000228310 414 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Olfr123-201ENSMUST00000054748 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Olfr437-201ENSMUST00000060243 1018 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Olfr699-201ENSMUST00000065024 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Csn1s2b-201ENSMUST00000072539 810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm24207-201ENSMUST00000082781 108 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm6361-201ENSMUST00000091031 435 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Olfr1061-201ENSMUST00000099889 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 AC134596.1-201ENSMUST00000222016 1922 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm38126-201ENSMUST00000195297 4003 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Tfpi-205ENSMUST00000111717 2962 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 AC152414.1-201ENSMUST00000218784 2287 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 4930402F11Rik-204ENSMUST00000208612 1405 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Cdr1-201ENSMUST00000166381 2313 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Polk-205ENSMUST00000221899 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm42905-201ENSMUST00000196237 1611 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm13664-201ENSMUST00000117304 345 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm24380-201ENSMUST00000122696 324 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm15962-201ENSMUST00000124184 750 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Nr6a1os-201ENSMUST00000129089 645 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm13874-201ENSMUST00000130680 809 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 4930441J16Rik-201ENSMUST00000153743 516 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm25278-201ENSMUST00000157267 120 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm22536-201ENSMUST00000158171 134 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 C130026I21Rik-207ENSMUST00000162421 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm3077-201ENSMUST00000165903 627 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm8362-202ENSMUST00000170673 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
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Ccl20O89093 Gm26763-201ENSMUST00000180968 1093 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
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Ccl20O89093 Gm45651-201ENSMUST00000210857 335 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm35326-201ENSMUST00000218234 1041 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm7045-201ENSMUST00000221466 605 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 AC114573.1-201ENSMUST00000224120 1210 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Olfr938-201ENSMUST00000056499 1190 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Olfr830-201ENSMUST00000078861 948 ntAPPRIS P2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Olfr740-201ENSMUST00000089838 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Olfr1100-201ENSMUST00000094913 969 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Tas2r115-201ENSMUST00000095394 1033 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Olfr993-201ENSMUST00000099926 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 6720464F23Rik-201ENSMUST00000193946 3496 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Olfr1196-203ENSMUST00000216977 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Vmn1r171-206ENSMUST00000227386 2570 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Vmn2r19-201ENSMUST00000073948 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Muc15-202ENSMUST00000111016 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Olfr1205-202ENSMUST00000215929 6149 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gabrg2-203ENSMUST00000109290 2868 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 AC126673.1-201ENSMUST00000223208 3856 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm29260-201ENSMUST00000186391 2759 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Vmn1r34-204ENSMUST00000226999 3048 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Olfr826-203ENSMUST00000216661 2858 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Cep295-208ENSMUST00000161132 7605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
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