Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27805-201ENSMUST00000184513 79 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28514-201ENSMUST00000187488 450 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38046-201ENSMUST00000192733 550 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43001-202ENSMUST00000199076 192 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45081-201ENSMUST00000206281 572 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6303-201ENSMUST00000210123 471 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm39302-201ENSMUST00000215184 636 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC131747.1-201ENSMUST00000226159 793 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ms4a2-201ENSMUST00000025583 1211 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr924-201ENSMUST00000072977 927 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl21-ps14-201ENSMUST00000080279 483 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 n-R5s162-201ENSMUST00000082581 119 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Has2-201ENSMUST00000050544 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cfap97-206ENSMUST00000164504 4521 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1472-202ENSMUST00000096201 1377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pds5b-203ENSMUST00000110486 2900 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tdo2-201ENSMUST00000029645 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44847-201ENSMUST00000207104 1991 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm35755-201ENSMUST00000222392 2077 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 2210418O10Rik-203ENSMUST00000136719 2314 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930528J11Rik-201ENSMUST00000201689 3611 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cfhr1-201ENSMUST00000023965 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Scimp-202ENSMUST00000108534 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14365-201ENSMUST00000117535 587 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13007-201ENSMUST00000121866 365 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13617-201ENSMUST00000155350 675 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17421-201ENSMUST00000167845 674 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r-ps25-201ENSMUST00000173545 799 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27899-201ENSMUST00000184715 64 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43491-201ENSMUST00000197133 784 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm40293-201ENSMUST00000202596 485 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44009-201ENSMUST00000203539 521 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC126554.4-201ENSMUST00000221055 409 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 CT030170.6-201ENSMUST00000221149 550 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC119241.1-201ENSMUST00000223651 534 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ap3m1-208ENSMUST00000224016 764 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 U90926-201ENSMUST00000031356 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr186-201ENSMUST00000062380 1005 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 BC048502-201ENSMUST00000065978 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir28a-201ENSMUST00000083560 86 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22826-201ENSMUST00000083774 165 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Btbd35f10-201ENSMUST00000178621 1952 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Erbb4-201ENSMUST00000119142 11782 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC168056.3-201ENSMUST00000225395 2540 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13630-201ENSMUST00000127849 3650 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38269-201ENSMUST00000194549 3298 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8402-201ENSMUST00000118183 1770 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8383-201ENSMUST00000121179 1770 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9921-201ENSMUST00000173293 4399 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1026-202ENSMUST00000217615 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42681-201ENSMUST00000197999 1611 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43705-201ENSMUST00000195958 3717 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23322-201ENSMUST00000104464 167 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmco2-201ENSMUST00000106268 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11633-201ENSMUST00000118176 444 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15385-201ENSMUST00000118725 667 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r-ps132-201ENSMUST00000120434 892 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16179-201ENSMUST00000120685 373 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12103-201ENSMUST00000121892 362 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zakit-201ENSMUST00000157677 308 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24685-201ENSMUST00000157764 285 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42936-201ENSMUST00000174019 652 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r-ps52-201ENSMUST00000177426 862 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 C030032O16Rik-201ENSMUST00000196427 716 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl18a-ps2-201ENSMUST00000197158 174 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8132-201ENSMUST00000204938 640 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20586-201ENSMUST00000210122 547 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm35326-201ENSMUST00000218234 1041 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC156803.1-201ENSMUST00000224407 820 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC154738.2-201ENSMUST00000227403 1110 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr266-201ENSMUST00000059486 1027 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 n-R5s182-201ENSMUST00000083889 107 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 AL589737.1-201ENSMUST00000221163 2763 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45176-201ENSMUST00000207696 4096 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC159476.1-201ENSMUST00000215914 1668 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm2888-201ENSMUST00000170521 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44567-201ENSMUST00000205645 2631 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42645-201ENSMUST00000201573 1627 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37569-201ENSMUST00000192111 1722 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp433-201ENSMUST00000085664 1800 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr642-202ENSMUST00000214299 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7452-202ENSMUST00000202891 3039 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1356-202ENSMUST00000205100 3023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cldn34b4-201ENSMUST00000101419 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22472-201ENSMUST00000104115 134 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr800-201ENSMUST00000104903 940 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10241-201ENSMUST00000117664 286 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15603-201ENSMUST00000119252 492 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Llph-ps2-201ENSMUST00000122000 393 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27883-201ENSMUST00000183941 102 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9320-201ENSMUST00000184151 473 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr416-ps1-201ENSMUST00000192734 804 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37720-201ENSMUST00000195497 1241 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbxw27-201ENSMUST00000197125 810 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm4410-201ENSMUST00000199349 686 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm33626-201ENSMUST00000206790 828 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1291-ps1-202ENSMUST00000219064 897 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5457-201ENSMUST00000022260 333 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC174459.2-201ENSMUST00000226036 160 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC134864.1-201ENSMUST00000226326 511 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms