Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Cyp2j12-201ENSMUST00000097972 1675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Polk-202ENSMUST00000091387 2382 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm38243-201ENSMUST00000194737 1567 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Slco6d1-201ENSMUST00000027575 2328 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 B930086L07Rik-201ENSMUST00000209529 3738 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Olfr1300-ps1-201ENSMUST00000208175 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 2700016F22Rik-201ENSMUST00000181556 3605 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm37115-201ENSMUST00000193750 2849 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gulp1-206ENSMUST00000162600 2798 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm26655-203ENSMUST00000181095 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm26680-203ENSMUST00000181701 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm26630-204ENSMUST00000181759 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm26650-204ENSMUST00000181881 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 AC174797.3-203ENSMUST00000225749 2078 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Mmp1a-201ENSMUST00000034492 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Olfr1191-ps1-201ENSMUST00000120598 4677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Rif1-201ENSMUST00000112693 8509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm15206-201ENSMUST00000119143 454 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm12092-201ENSMUST00000125194 600 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 1700061F12Rik-201ENSMUST00000132414 876 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm12082-201ENSMUST00000138164 600 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm22819-201ENSMUST00000157445 303 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm25923-201ENSMUST00000158312 138 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Skint1-205ENSMUST00000162885 603 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Vmn1r-ps56-201ENSMUST00000172769 965 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm16430-202ENSMUST00000178145 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm16405-202ENSMUST00000180150 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm18828-202ENSMUST00000181035 310 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Mrgprb13-201ENSMUST00000188191 985 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm17953-201ENSMUST00000192061 667 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm38180-201ENSMUST00000192381 395 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm38214-201ENSMUST00000192581 988 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm37993-201ENSMUST00000195301 988 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm42610-201ENSMUST00000196557 650 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Csn2-209ENSMUST00000199624 890 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm44077-201ENSMUST00000203453 435 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm40394-201ENSMUST00000221321 633 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Csn2-201ENSMUST00000082370 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm23300-201ENSMUST00000082712 125 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm26072-201ENSMUST00000083135 107 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Med14-203ENSMUST00000115481 3729 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Zscan4-ps3-201ENSMUST00000210559 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm43920-201ENSMUST00000204953 2159 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Rab30-201ENSMUST00000032879 9456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Mid2-203ENSMUST00000112993 5916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Olfr1493-ps1-201ENSMUST00000207208 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm12586-201ENSMUST00000117328 1316 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Esp31-201ENSMUST00000174742 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm25647-201ENSMUST00000101832 78 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm25823-201ENSMUST00000101995 78 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Zfp965-201ENSMUST00000109002 957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Prl2c1-202ENSMUST00000110335 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm13195-201ENSMUST00000117229 261 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm15333-201ENSMUST00000118825 364 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm12820-201ENSMUST00000119233 342 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm13815-201ENSMUST00000119963 412 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm12587-201ENSMUST00000120180 427 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm14229-201ENSMUST00000121178 850 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm13220-201ENSMUST00000121535 508 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm14713-201ENSMUST00000122362 686 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Olfr405-ps1-202ENSMUST00000127098 711 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm12711-201ENSMUST00000131249 340 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm12259-201ENSMUST00000138391 328 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm23171-201ENSMUST00000157159 264 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm22726-201ENSMUST00000158089 179 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm24773-201ENSMUST00000158513 99 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm8356-202ENSMUST00000164917 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm17152-201ENSMUST00000172430 535 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm25037-201ENSMUST00000175418 110 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm24220-201ENSMUST00000177753 79 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm25988-201ENSMUST00000177759 79 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm23471-201ENSMUST00000177886 79 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm26488-201ENSMUST00000178225 79 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Cldn34b4-202ENSMUST00000178974 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm23449-201ENSMUST00000179208 79 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm25221-201ENSMUST00000180051 79 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 4930519F16Rik-206ENSMUST00000183292 800 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm28835-202ENSMUST00000189206 543 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm40293-201ENSMUST00000202596 485 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm44088-201ENSMUST00000204595 237 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm45007-201ENSMUST00000206237 366 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm44972-201ENSMUST00000206419 406 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm19170-201ENSMUST00000212440 1084 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm46327-201ENSMUST00000218240 365 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 AC113204.1-202ENSMUST00000219846 578 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm46369-201ENSMUST00000221577 401 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 AC154510.1-201ENSMUST00000223925 737 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm15421-201ENSMUST00000051985 443 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Mir350-201ENSMUST00000083639 99 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Mcmdc2-202ENSMUST00000118098 2072 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Zfp984-202ENSMUST00000122309 2405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Vmn1r13-202ENSMUST00000226892 5156 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Mysm1-201ENSMUST00000075872 7420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Spp1-204ENSMUST00000112747 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm42949-201ENSMUST00000197054 2202 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Olfr1097-202ENSMUST00000217403 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Olfr270-203ENSMUST00000215010 2502 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Klri2-201ENSMUST00000050385 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm18300-201ENSMUST00000192792 1406 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm37099-201ENSMUST00000191902 3451 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.6 ms