Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

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Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Gm3543-202ENSMUST00000179947 231 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Gm26954-201ENSMUST00000182106 622 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Gm27242-201ENSMUST00000184211 1151 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Ranbp2-ps2-201ENSMUST00000184379 370 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Gm37828-201ENSMUST00000192496 432 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 7420461P10Rik-203ENSMUST00000193898 545 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Gm43574-201ENSMUST00000196226 809 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Gm43035-201ENSMUST00000197626 517 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Gm8774-201ENSMUST00000203621 692 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Gm45368-201ENSMUST00000209323 703 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Olfr588-ps1-202ENSMUST00000210115 912 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Gm45673-201ENSMUST00000210293 358 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Gm7495-201ENSMUST00000215099 426 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Gm46146-201ENSMUST00000217483 346 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Gm18247-201ENSMUST00000222937 601 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 4930559C10Rik-201ENSMUST00000223202 649 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Olfr1018-201ENSMUST00000054201 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Defb37-201ENSMUST00000066282 352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Gm19074-201ENSMUST00000218915 1429 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Gm45872-201ENSMUST00000209804 1584 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Atp13a5-203ENSMUST00000143373 3789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Speer4a-201ENSMUST00000079447 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 St18-208ENSMUST00000140079 5892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 1700091H14Rik-202ENSMUST00000185725 1388 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Il13ra2-202ENSMUST00000112827 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Trim12a-201ENSMUST00000070943 1531 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Gm45633-201ENSMUST00000210669 3253 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Lrrc9-206ENSMUST00000162159 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Btbd35f6-201ENSMUST00000179466 1497 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Adgrg2-202ENSMUST00000112400 4682 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Gm13919-202ENSMUST00000140238 1552 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Pum2-201ENSMUST00000020915 3587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Olfr553-202ENSMUST00000216776 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
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Hdac6Q9Z2V5 Gm15312-201ENSMUST00000118827 271 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Gm11410-201ENSMUST00000120053 1143 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
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Hdac6Q9Z2V5 4933411O13Rik-203ENSMUST00000146849 607 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
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Hdac6Q9Z2V5 Gm44893-201ENSMUST00000207259 443 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
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Hdac6Q9Z2V5 Anks4b-201ENSMUST00000033201 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Tenm4-203ENSMUST00000107166 13172 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
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Hdac6Q9Z2V5 Ms4a1-201ENSMUST00000169159 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Mmp12-201ENSMUST00000005950 3607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Ccdc186-201ENSMUST00000076085 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
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Hdac6Q9Z2V5 C920009B18Rik-202ENSMUST00000181223 4535 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Il18r1-206ENSMUST00000195684 2850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Dlg2-204ENSMUST00000107196 7490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Gm37553-201ENSMUST00000194135 1602 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Abcd2-201ENSMUST00000069511 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Gm45516-201ENSMUST00000211588 4182 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Olfr537-ps1-202ENSMUST00000210949 2821 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Mmp12-203ENSMUST00000120655 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
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Hdac6Q9Z2V5 Iqch-203ENSMUST00000163624 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 AC129085.3-201ENSMUST00000225686 1705 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Gm44527-202ENSMUST00000204519 1314 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Gm45548-201ENSMUST00000210076 3167 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Ktn1-202ENSMUST00000185343 3846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Ktn1-205ENSMUST00000186627 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Ktn1-214ENSMUST00000188553 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 AC121942.1-201ENSMUST00000224459 2891 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Cdh8-201ENSMUST00000093249 3790 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Olfr770-202ENSMUST00000203887 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Prl2b1-202ENSMUST00000102954 870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Gm22771-201ENSMUST00000104449 91 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Rpl35-ps1-201ENSMUST00000118070 372 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.2 ms