Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Olfr1336-201ENSMUST00000056120 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Stfa3-201ENSMUST00000068182 412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm22508-201ENSMUST00000082772 110 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm5168-201ENSMUST00000089165 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm5155-201ENSMUST00000072381 2841 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Zfp799-205ENSMUST00000202988 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Pramel7-201ENSMUST00000026957 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 3732407C23Rik-201ENSMUST00000222770 3540 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Ankfy1-206ENSMUST00000155998 8030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Ncl-201ENSMUST00000027438 8202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Atp13a5-201ENSMUST00000075806 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Mettl4-201ENSMUST00000171284 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 RMST_1.1-210ENSMUST00000219606 2891 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Dock7-205ENSMUST00000127417 6796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm44679-201ENSMUST00000207202 2908 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 AC130217.2-201ENSMUST00000224009 2990 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Kcnmb2-205ENSMUST00000192429 2357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Vmn1r57-204ENSMUST00000228062 2365 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 A230108P19Rik-201ENSMUST00000151782 2500 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Vmn1r188-203ENSMUST00000228243 8473 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Ift80-202ENSMUST00000107812 4063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Eaf2-202ENSMUST00000075946 1878 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Vmn1r198-204ENSMUST00000227167 5990 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm26733-201ENSMUST00000180846 2046 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Olfr1000-203ENSMUST00000216571 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 AC156636.2-201ENSMUST00000218845 4557 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Trbv12-2-201ENSMUST00000103269 385 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm13090-201ENSMUST00000105667 746 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm23653-201ENSMUST00000116751 97 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm12149-201ENSMUST00000117511 654 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm14771-201ENSMUST00000118249 203 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm12787-201ENSMUST00000119234 396 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm11976-201ENSMUST00000119236 295 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gng2-ps1-201ENSMUST00000120523 217 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm11852-201ENSMUST00000120806 222 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Scgb1b26-ps-201ENSMUST00000121845 291 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm23191-201ENSMUST00000179147 107 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm21232-201ENSMUST00000182187 1006 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm26969-201ENSMUST00000183203 648 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Mir7653-201ENSMUST00000184358 61 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm27694-201ENSMUST00000184740 86 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm4557-201ENSMUST00000185826 907 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm4526-201ENSMUST00000186039 920 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm28209-201ENSMUST00000187956 775 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm8708-201ENSMUST00000188500 906 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Ankrd17-205ENSMUST00000197021 8067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm35013-201ENSMUST00000197218 832 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Ass-ps1-201ENSMUST00000197717 761 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
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Limd1Q9QXD8 Tbcel-202ENSMUST00000066179 3893 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
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Limd1Q9QXD8 Myt1l-202ENSMUST00000049784 7202 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 Cyp2j13-201ENSMUST00000030305 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 Fbxw19-201ENSMUST00000076617 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 Slc38a6-202ENSMUST00000101313 1546 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 Olfr235-206ENSMUST00000215407 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 Olfr1410-203ENSMUST00000217316 7927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 Gm26760-201ENSMUST00000181901 1604 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 Ifi205-201ENSMUST00000059226 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
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Limd1Q9QXD8 Zfp937-201ENSMUST00000073782 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 Gm21093-201ENSMUST00000084677 1710 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.31
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Limd1Q9QXD8 Gm4994-201ENSMUST00000118379 2187 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 Ctnna3-202ENSMUST00000105440 3682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 Tmprss15-201ENSMUST00000023566 4177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 Vmn2r9-201ENSMUST00000170419 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 Cwf19l1-201ENSMUST00000026218 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 Dnah10-203ENSMUST00000141137 13862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 Gm12040-201ENSMUST00000118357 537 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 Gm14517-201ENSMUST00000119040 337 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 Xlr3d-ps-201ENSMUST00000121687 658 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 Gm15959-201ENSMUST00000121724 368 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 Gm13417-201ENSMUST00000155475 533 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 Gm23539-201ENSMUST00000157537 224 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 Gm18199-201ENSMUST00000173820 835 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 Gm27854-201ENSMUST00000175578 244 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 Vmn1r-ps11-201ENSMUST00000176097 853 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 Gm7713-201ENSMUST00000181201 1007 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 Gm27028-201ENSMUST00000182303 399 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 Gm28973-201ENSMUST00000189310 613 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 1700015G11Rik-204ENSMUST00000190307 255 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 Gm37511-201ENSMUST00000192901 294 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 Gm37272-201ENSMUST00000193401 488 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 Gm43522-202ENSMUST00000200185 442 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 Sult1c2-ps1-201ENSMUST00000200231 164 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.6 ms