Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

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Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r43-201ENSMUST00000066317 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Gm11212-201ENSMUST00000118337 618 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Gm25177-201ENSMUST00000122634 117 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Gm24850-201ENSMUST00000158029 119 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Gm16545-201ENSMUST00000161968 463 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Otx2os1-201ENSMUST00000183522 866 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Mir7050-201ENSMUST00000184636 60 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Mir6993-201ENSMUST00000184912 65 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Gm36259-201ENSMUST00000197340 392 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Gm44320-201ENSMUST00000199276 86 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Gm43084-201ENSMUST00000200696 947 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Olfr200-ps1-201ENSMUST00000207964 874 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 AC161256.1-201ENSMUST00000217312 213 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Olfr273-201ENSMUST00000051520 1059 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Olfr482-201ENSMUST00000081184 972 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Olfr713-201ENSMUST00000098139 975 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Nckap5-204ENSMUST00000112583 7212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Usp29-203ENSMUST00000198068 4420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Olfr947-ps1-201ENSMUST00000214075 2165 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Olfr711-201ENSMUST00000051715 3035 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Mybpc1-201ENSMUST00000119185 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Gm19176-201ENSMUST00000222149 1831 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Gm43376-202ENSMUST00000199747 1743 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Pign-205ENSMUST00000186485 6759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r218-203ENSMUST00000227050 10364 ntAPPRIS P2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Olfr635-202ENSMUST00000209473 8565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r169-203ENSMUST00000227547 2322 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Gm14569-204ENSMUST00000169499 5181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Gm16794-203ENSMUST00000185324 1490 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Olfr1131-203ENSMUST00000216756 1459 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Gm45304-201ENSMUST00000210303 2828 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Rasgrp3-201ENSMUST00000095204 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Btbd35f7-201ENSMUST00000105007 1960 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Sult2a1-201ENSMUST00000108522 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Gm12931-201ENSMUST00000117046 324 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Gm15916-201ENSMUST00000118355 736 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Gm13785-201ENSMUST00000119099 690 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Gm13174-201ENSMUST00000126141 220 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 1700092C17Rik-201ENSMUST00000135792 424 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Gm23667-201ENSMUST00000157466 120 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Gm16026-202ENSMUST00000159695 772 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Gm29329-201ENSMUST00000189053 621 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Gm28331-201ENSMUST00000191102 621 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Gm28655-201ENSMUST00000191538 692 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Gm17887-201ENSMUST00000200194 547 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Gm44523-201ENSMUST00000205616 417 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Tpt1-ps4-201ENSMUST00000210908 503 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Olfr967-202ENSMUST00000213358 1210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Cdrt4-201ENSMUST00000035854 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Gm22154-201ENSMUST00000083844 131 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Taar4-201ENSMUST00000092660 1044 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Clca4c-ps-201ENSMUST00000098551 712 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r9-202ENSMUST00000227399 6778 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Alkbh8-204ENSMUST00000211933 7674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Fam126b-207ENSMUST00000161600 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Zfp120-203ENSMUST00000109931 4033 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Creb5-212ENSMUST00000205120 7482 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Gm37964-201ENSMUST00000192459 4905 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r6-204ENSMUST00000227188 8185 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Tmem45a-201ENSMUST00000023435 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r5-203ENSMUST00000228276 3188 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Pramel6-201ENSMUST00000026956 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Olfr281-202ENSMUST00000217517 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Gm8267-201ENSMUST00000165003 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Olfr1097-201ENSMUST00000111576 4705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Olfr351-201ENSMUST00000100150 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 4930503E14Rik-201ENSMUST00000100688 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Defa-ps5-201ENSMUST00000121541 279 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Gm22514-201ENSMUST00000122547 308 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Gm11861-201ENSMUST00000141571 382 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Crem-222ENSMUST00000144496 978 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Crem-231ENSMUST00000152108 654 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Gm23964-201ENSMUST00000157966 107 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Gm20476-201ENSMUST00000172644 492 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Gm22857-201ENSMUST00000174969 134 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Gm5974-201ENSMUST00000181607 986 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 2010005H15Rik-202ENSMUST00000187183 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Olfr720-203ENSMUST00000216079 4692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 AC154576.1-201ENSMUST00000225864 563 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Dnajc13-203ENSMUST00000186788 6747 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Gm42910-201ENSMUST00000198917 2921 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Unc13c-201ENSMUST00000075245 6633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Il2ra-201ENSMUST00000028111 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Ptprd-203ENSMUST00000098005 4542 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Clec5a-202ENSMUST00000101491 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Gm45540-201ENSMUST00000209271 3606 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Gm37397-201ENSMUST00000194579 2842 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Zfp184-205ENSMUST00000176511 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Gm9921-201ENSMUST00000173293 4399 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Cp-205ENSMUST00000108329 4564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 AC154462.1-201ENSMUST00000228897 2260 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r-ps47-201ENSMUST00000174515 2557 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Cd59b-204ENSMUST00000111132 436 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Gm10059-201ENSMUST00000131139 171 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Gm26036-201ENSMUST00000158149 144 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Gm37577-203ENSMUST00000194712 991 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Gm37791-201ENSMUST00000195081 286 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 AI506816-203ENSMUST00000198461 503 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Gm35371-201ENSMUST00000216204 579 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
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