Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Gm37802-201ENSMUST00000194998 2643 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Smarca2Q6DIC0 Unc13c-201ENSMUST00000075245 6633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Smarca2Q6DIC0 Plcb4-201ENSMUST00000035646 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Smarca2Q6DIC0 Vmn2r-ps5-201ENSMUST00000175971 2730 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Smarca2Q6DIC0 Gm42727-201ENSMUST00000202446 2823 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Smarca2Q6DIC0 Gm16421-201ENSMUST00000117616 1557 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Smarca2Q6DIC0 Gm4177-201ENSMUST00000105196 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Smarca2Q6DIC0 Gm15057-201ENSMUST00000121516 534 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Smarca2Q6DIC0 Gm17416-201ENSMUST00000163724 201 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Smarca2Q6DIC0 Iltifb-201ENSMUST00000163808 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Smarca2Q6DIC0 Vmn1r94-201ENSMUST00000164526 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Smarca2Q6DIC0 Gm4216-201ENSMUST00000168926 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Smarca2Q6DIC0 Vmn1r142-201ENSMUST00000169697 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Smarca2Q6DIC0 Vmn1r139-201ENSMUST00000169730 894 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Smarca2Q6DIC0 Vmn1r112-201ENSMUST00000174538 894 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Smarca2Q6DIC0 Vmn1r157-201ENSMUST00000178215 894 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Smarca2Q6DIC0 Gm20795-201ENSMUST00000178528 699 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Smarca2Q6DIC0 Gm21425-201ENSMUST00000180318 699 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Smarca2Q6DIC0 Stk-ps2-204ENSMUST00000187808 616 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Smarca2Q6DIC0 Gm20268-201ENSMUST00000187932 845 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Smarca2Q6DIC0 Gm37898-201ENSMUST00000193781 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Smarca2Q6DIC0 AC166263.1-201ENSMUST00000218586 238 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Smarca2Q6DIC0 Vmn1r80-201ENSMUST00000075053 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Smarca2Q6DIC0 Clca4c-ps-201ENSMUST00000098551 712 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Smarca2Q6DIC0 Vmn1r132-201ENSMUST00000098736 894 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Smarca2Q6DIC0 Flrt2-201ENSMUST00000057324 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Smarca2Q6DIC0 Olfr911-ps1-202ENSMUST00000216496 3576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Smarca2Q6DIC0 E330013P04Rik-201ENSMUST00000065383 2070 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Smarca2Q6DIC0 Asxl3-202ENSMUST00000120223 11485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Smarca2Q6DIC0 Olfr1336-202ENSMUST00000214301 6882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Smarca2Q6DIC0 Cul4b-203ENSMUST00000115118 3344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Smarca2Q6DIC0 Lrrc39-201ENSMUST00000029573 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Smarca2Q6DIC0 Slc24a2-204ENSMUST00000107158 10499 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Smarca2Q6DIC0 Gm21638-201ENSMUST00000179473 836 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Smarca2Q6DIC0 Gm5974-201ENSMUST00000181607 986 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Smarca2Q6DIC0 Gm20736-203ENSMUST00000190282 836 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Smarca2Q6DIC0 AC155167.1-201ENSMUST00000228931 614 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Smarca2Q6DIC0 Olfr1249-201ENSMUST00000099769 957 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Smarca2Q6DIC0 Larp4-201ENSMUST00000057632 6527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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Smarca2Q6DIC0 Acaca-202ENSMUST00000103201 9513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Smarca2Q6DIC0 Olfr194-202ENSMUST00000213228 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Smarca2Q6DIC0 Gm43317-201ENSMUST00000197924 2544 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Smarca2Q6DIC0 Ctps2-203ENSMUST00000112300 741 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Smarca2Q6DIC0 Gm7219-201ENSMUST00000119619 297 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Smarca2Q6DIC0 Gm13266-201ENSMUST00000141869 579 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Smarca2Q6DIC0 Gm22398-201ENSMUST00000174941 125 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Smarca2Q6DIC0 Gm25731-201ENSMUST00000175167 125 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Smarca2Q6DIC0 Gm18350-201ENSMUST00000187395 955 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Smarca2Q6DIC0 AC159244.1-201ENSMUST00000220964 594 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Smarca2Q6DIC0 Zfp825-201ENSMUST00000074369 822 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Smarca2Q6DIC0 4932438A13Rik-201ENSMUST00000057272 15883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Smarca2Q6DIC0 Zfp788-202ENSMUST00000098508 3775 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Smarca2Q6DIC0 Kif2a-201ENSMUST00000022204 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Smarca2Q6DIC0 Myo3a-201ENSMUST00000044749 5082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Smarca2Q6DIC0 Gm16794-201ENSMUST00000180727 2100 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Smarca2Q6DIC0 Igkv7-33-201ENSMUST00000103376 362 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
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Smarca2Q6DIC0 Cldn34c4-201ENSMUST00000052500 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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Smarca2Q6DIC0 Vps50-202ENSMUST00000164052 4824 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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Smarca2Q6DIC0 AI838599-201ENSMUST00000133960 2953 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Smarca2Q6DIC0 Tnfrsf26-202ENSMUST00000208124 3062 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
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Smarca2Q6DIC0 Rag2-202ENSMUST00000111227 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Smarca2Q6DIC0 Gm14365-201ENSMUST00000117535 587 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
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Smarca2Q6DIC0 Gm15268-201ENSMUST00000118845 352 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Smarca2Q6DIC0 Gm11718-201ENSMUST00000119942 537 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Smarca2Q6DIC0 Gm14605-201ENSMUST00000120599 268 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Smarca2Q6DIC0 Gm25667-201ENSMUST00000157701 275 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Smarca2Q6DIC0 Gm22857-201ENSMUST00000174969 134 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Smarca2Q6DIC0 Gm6900-201ENSMUST00000178971 342 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Smarca2Q6DIC0 2700016F22Rik-201ENSMUST00000181556 3605 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Smarca2Q6DIC0 Gm27457-201ENSMUST00000184771 156 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Smarca2Q6DIC0 Gm31693-201ENSMUST00000200150 909 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Smarca2Q6DIC0 Gm45245-201ENSMUST00000210082 376 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Smarca2Q6DIC0 Olfr1226-205ENSMUST00000216445 7046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Smarca2Q6DIC0 AC159252.1-201ENSMUST00000224450 553 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Smarca2Q6DIC0 Nlrp14-201ENSMUST00000084763 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Smarca2Q6DIC0 Slc22a30-202ENSMUST00000096269 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Smarca2Q6DIC0 Olfr593-201ENSMUST00000098206 984 ntAPPRIS P2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Smarca2Q6DIC0 Gm10704-201ENSMUST00000098952 730 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Smarca2Q6DIC0 Olfr1217-204ENSMUST00000216592 3992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Smarca2Q6DIC0 Olfr1211-204ENSMUST00000215205 4220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Smarca2Q6DIC0 Gm37244-201ENSMUST00000191748 1981 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Smarca2Q6DIC0 Olfr91-202ENSMUST00000216376 3832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Smarca2Q6DIC0 Olfr91-203ENSMUST00000217372 3809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Smarca2Q6DIC0 Gm37140-201ENSMUST00000192914 1684 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
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