Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Gm13664-201ENSMUST00000117304 345 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Ctdnep1Q3TP92 Gm14539-201ENSMUST00000117527 174 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Ctdnep1Q3TP92 Gm15403-201ENSMUST00000119343 1227 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Ctdnep1Q3TP92 Gm14410-202ENSMUST00000133301 1113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Ctdnep1Q3TP92 Gm14135-201ENSMUST00000135438 591 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Ctdnep1Q3TP92 Gm12762-201ENSMUST00000140881 483 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Ctdnep1Q3TP92 Gm11281-201ENSMUST00000141391 576 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Ctdnep1Q3TP92 Gm20389-201ENSMUST00000174217 1006 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Ctdnep1Q3TP92 Gm23617-201ENSMUST00000175410 95 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Ctdnep1Q3TP92 Gm11007-201ENSMUST00000177700 195 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Ctdnep1Q3TP92 Gm2007-201ENSMUST00000177981 195 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Ctdnep1Q3TP92 Gm2004-203ENSMUST00000179349 195 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Ctdnep1Q3TP92 Gm29588-201ENSMUST00000185738 298 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Ctdnep1Q3TP92 2310030A07Rik-201ENSMUST00000186460 610 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Ctdnep1Q3TP92 Gm8633-201ENSMUST00000218457 558 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Ctdnep1Q3TP92 RMST_1.1-212ENSMUST00000220192 413 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Ctdnep1Q3TP92 AC168881.1-201ENSMUST00000226018 430 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Ctdnep1Q3TP92 Olfr816-201ENSMUST00000071605 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Ctdnep1Q3TP92 Olfr205-201ENSMUST00000074125 990 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Ctdnep1Q3TP92 Mir26a-2-201ENSMUST00000083496 84 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Ctdnep1Q3TP92 Mir383-201ENSMUST00000083523 70 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Ctdnep1Q3TP92 Vmn2r93-201ENSMUST00000079206 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Ctdnep1Q3TP92 Gm42949-201ENSMUST00000197054 2202 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Ctdnep1Q3TP92 Mga-203ENSMUST00000110773 13577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Ctdnep1Q3TP92 Gm7173-201ENSMUST00000101410 2832 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Ctdnep1Q3TP92 Sbno1-201ENSMUST00000065263 10071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1123-203ENSMUST00000216208 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Ctdnep1Q3TP92 CAAA01194877.1-201ENSMUST00000213137 4233 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1224-ps1-204ENSMUST00000216833 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Ctdnep1Q3TP92 Zfp708-203ENSMUST00000190566 2406 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Ctdnep1Q3TP92 AC159188.2-201ENSMUST00000224103 1301 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Ctdnep1Q3TP92 Olfr351-202ENSMUST00000213676 3426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Ctdnep1Q3TP92 Gm24469-201ENSMUST00000104487 131 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Ctdnep1Q3TP92 Gm12173-201ENSMUST00000117622 273 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Ctdnep1Q3TP92 Gm11971-201ENSMUST00000117715 288 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Ctdnep1Q3TP92 Gm15916-201ENSMUST00000118355 736 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Ctdnep1Q3TP92 Gm14688-201ENSMUST00000119169 303 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Ctdnep1Q3TP92 Gm11719-201ENSMUST00000119399 351 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Ctdnep1Q3TP92 Gm12564-201ENSMUST00000119860 321 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Ctdnep1Q3TP92 Gm9208-201ENSMUST00000120468 948 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Ctdnep1Q3TP92 Gm16158-201ENSMUST00000123509 785 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Ctdnep1Q3TP92 Mllt3-207ENSMUST00000148059 422 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Ctdnep1Q3TP92 Gm14618-201ENSMUST00000149377 740 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Ctdnep1Q3TP92 Lipo5-201ENSMUST00000156818 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Ctdnep1Q3TP92 Gm16571-201ENSMUST00000159112 291 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r94-201ENSMUST00000164526 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r142-201ENSMUST00000169697 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Ctdnep1Q3TP92 Mgat4e-202ENSMUST00000172898 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Ctdnep1Q3TP92 Ear1-202ENSMUST00000179200 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Ctdnep1Q3TP92 Gm38032-201ENSMUST00000195052 1589 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Ctdnep1Q3TP92 Gm43895-201ENSMUST00000203219 855 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Ctdnep1Q3TP92 Olfr570-202ENSMUST00000209778 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Ctdnep1Q3TP92 Olfr724-202ENSMUST00000213390 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Ctdnep1Q3TP92 AC154765.1-201ENSMUST00000217732 439 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Ctdnep1Q3TP92 CR974592.1-201ENSMUST00000220422 574 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Ctdnep1Q3TP92 AC132121.1-201ENSMUST00000220774 332 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Ctdnep1Q3TP92 AC162183.1-202ENSMUST00000225434 904 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Ctdnep1Q3TP92 Krtap31-1-201ENSMUST00000093935 973 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Ctdnep1Q3TP92 Steap2-204ENSMUST00000115426 10408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Ctdnep1Q3TP92 Gm38010-201ENSMUST00000192592 2784 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Ctdnep1Q3TP92 Olfr118-203ENSMUST00000216551 1772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Ctdnep1Q3TP92 Zfp708-201ENSMUST00000109742 2416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Ctdnep1Q3TP92 Gm26522-201ENSMUST00000181565 1555 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Ctdnep1Q3TP92 E330016L19Rik-201ENSMUST00000140614 1959 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Ctdnep1Q3TP92 Fat2-202ENSMUST00000108864 14423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Ctdnep1Q3TP92 Gm3669-203ENSMUST00000133259 677 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Ctdnep1Q3TP92 Gm15522-201ENSMUST00000134467 785 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Ctdnep1Q3TP92 Gm16250-201ENSMUST00000148974 256 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Ctdnep1Q3TP92 Gm14974-202ENSMUST00000150003 677 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Ctdnep1Q3TP92 Gm2165-204ENSMUST00000153493 677 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Ctdnep1Q3TP92 Gm2101-205ENSMUST00000156730 677 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Ctdnep1Q3TP92 Gm25534-201ENSMUST00000175365 125 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
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Ctdnep1Q3TP92 Gm20954-201ENSMUST00000189078 644 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Ctdnep1Q3TP92 6330419E04Rik-201ENSMUST00000203087 1263 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Ctdnep1Q3TP92 9330118I20Rik-201ENSMUST00000203390 1066 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Ctdnep1Q3TP92 Gm19131-201ENSMUST00000203408 789 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Ctdnep1Q3TP92 Gm4045-201ENSMUST00000204076 310 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Ctdnep1Q3TP92 Gm5338-201ENSMUST00000209530 639 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Ctdnep1Q3TP92 AC140930.4-201ENSMUST00000220750 150 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Ctdnep1Q3TP92 AC156803.1-201ENSMUST00000224407 820 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Ctdnep1Q3TP92 U90926-201ENSMUST00000031356 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Ctdnep1Q3TP92 Tas2r110-201ENSMUST00000082014 1002 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1321-201ENSMUST00000088876 1056 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Ctdnep1Q3TP92 1700010D01Rik-201ENSMUST00000096366 507 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1341-203ENSMUST00000215117 4700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Ctdnep1Q3TP92 Olfr437-202ENSMUST00000205175 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1493-ps1-201ENSMUST00000207208 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Ctdnep1Q3TP92 Atad1-201ENSMUST00000070210 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Ctdnep1Q3TP92 Gm37628-201ENSMUST00000194644 5440 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Ctdnep1Q3TP92 Ccr9-205ENSMUST00000180093 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Ctdnep1Q3TP92 Ogt-201ENSMUST00000044475 5384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Ctdnep1Q3TP92 Gm36229-201ENSMUST00000218737 1855 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Ctdnep1Q3TP92 B3galt1-202ENSMUST00000112346 4977 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1056-202ENSMUST00000216547 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ctdnep1Q3TP92 Gm4991-201ENSMUST00000118899 1552 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ctdnep1Q3TP92 Tenm1-203ENSMUST00000115059 12879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
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