Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Gm23501-201ENSMUST00000157744 256 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r-ps32-201ENSMUST00000174389 956 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Gm13249-201ENSMUST00000177803 345 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Gm13144-201ENSMUST00000179385 345 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Gm27805-201ENSMUST00000184513 79 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Vmn2r-ps61-201ENSMUST00000207286 889 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Olfr673-ps1-201ENSMUST00000210859 411 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Olfr931-ps1-201ENSMUST00000214941 549 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Gm18891-201ENSMUST00000216734 1087 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Gm5176-201ENSMUST00000218244 1227 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 CT030170.6-201ENSMUST00000221149 550 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Gm19134-201ENSMUST00000221203 487 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Gm17177-202ENSMUST00000222007 990 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Rps24-205ENSMUST00000223999 525 ntAPPRIS ALT1 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Gtpbp8-201ENSMUST00000023348 836 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Olfr1176-201ENSMUST00000057439 949 ntAPPRIS P1 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Olfr622-201ENSMUST00000058744 1105 ntAPPRIS P1 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Olfr774-201ENSMUST00000097164 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Olfr887-202ENSMUST00000212502 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Vmn2r7-202ENSMUST00000161972 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Slfn8-201ENSMUST00000038141 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r171-203ENSMUST00000226321 3067 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Mapk8-203ENSMUST00000111943 1310 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 AC134860.3-201ENSMUST00000223564 1300 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Gm5746-201ENSMUST00000183550 2200 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Gm26523-201ENSMUST00000180713 1658 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Fgf7-202ENSMUST00000110442 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Mef2c-201ENSMUST00000005722 6217 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Lrif1-201ENSMUST00000098750 3103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Gm11432-201ENSMUST00000117334 231 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Gm13550-201ENSMUST00000118185 525 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Gm14067-201ENSMUST00000119340 314 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Clec2f-201ENSMUST00000121051 374 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Gm15141-201ENSMUST00000121860 729 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Gm11349-201ENSMUST00000122209 1116 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Gm10444-201ENSMUST00000126708 148 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Gm12224-202ENSMUST00000127107 726 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Gm12082-201ENSMUST00000138164 600 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Gm14246-201ENSMUST00000155173 680 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Gm25278-201ENSMUST00000157267 120 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Gm17109-201ENSMUST00000163985 358 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Vmn2r-ps59-201ENSMUST00000174596 135 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r-ps55-201ENSMUST00000174634 392 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Gm26983-201ENSMUST00000182051 388 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Gm2142-201ENSMUST00000197899 589 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 4930478M09Rik-201ENSMUST00000201366 1113 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Gm45356-201ENSMUST00000209274 823 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Gm45839-201ENSMUST00000209884 399 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 AC127581.1-201ENSMUST00000214084 771 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 AC163721.1-201ENSMUST00000222669 394 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 AC154335.1-201ENSMUST00000224744 395 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 AC154626.1-201ENSMUST00000226070 311 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 AC131100.2-201ENSMUST00000227701 998 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 n-R5s182-201ENSMUST00000083889 107 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Zfp850-203ENSMUST00000180502 6163 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Gm43313-201ENSMUST00000201398 2235 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Ifi208-202ENSMUST00000169857 1767 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Gm18954-201ENSMUST00000222200 1792 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Olfr716-207ENSMUST00000216871 4062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 AI987944-202ENSMUST00000205338 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Olfr970-203ENSMUST00000215922 1739 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Gm14305-202ENSMUST00000108981 1646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Olfr1472-202ENSMUST00000096201 1377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Zfp989-202ENSMUST00000146688 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Olfr665-203ENSMUST00000216257 2298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 AC122357.2-201ENSMUST00000220732 1525 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Gm26367-201ENSMUST00000104165 132 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Gm12261-201ENSMUST00000117499 645 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Gm14854-201ENSMUST00000117758 841 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r-ps132-201ENSMUST00000120434 892 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Gm5379-201ENSMUST00000120973 826 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Gm12466-201ENSMUST00000121199 620 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Gm12708-201ENSMUST00000126143 349 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Gm12205-201ENSMUST00000133940 575 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Gm24444-201ENSMUST00000157244 308 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Gm23906-201ENSMUST00000157573 128 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r113-201ENSMUST00000168794 894 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Cldn34c1-206ENSMUST00000169445 705 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Gm28967-201ENSMUST00000187351 281 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Gm43491-201ENSMUST00000197133 784 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Gm42824-201ENSMUST00000199361 247 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Gm18452-201ENSMUST00000202968 1111 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Gm43941-201ENSMUST00000203303 1073 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Gm44145-201ENSMUST00000203711 172 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Gm43892-201ENSMUST00000204373 265 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Gm44733-202ENSMUST00000209063 582 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Gm45269-201ENSMUST00000210359 282 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Gm46327-201ENSMUST00000218240 365 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Muc16-201ENSMUST00000034653 1035 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r211-201ENSMUST00000073728 985 ntAPPRIS P1 BASIC4.18□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Gm23464-201ENSMUST00000083145 147 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Olfr606-201ENSMUST00000098200 960 ntAPPRIS P1 BASIC4.18□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Kctd12b-202ENSMUST00000112572 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Gm43990-201ENSMUST00000203790 1691 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r14-204ENSMUST00000227768 7005 ntAPPRIS P2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Cp-205ENSMUST00000108329 4564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Cftr-203ENSMUST00000115406 4341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Cul4b-203ENSMUST00000115118 3344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
Cpne9Q1RLL3 Txndc9-204ENSMUST00000193832 3472 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.4 ms