Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Gm28990-204ENSMUST00000189255 1581 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Gm28677-209ENSMUST00000190010 1581 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Stk38l-201ENSMUST00000001675 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Trav6-1-201ENSMUST00000103571 338 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Gm14575-201ENSMUST00000117210 560 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Gm15175-201ENSMUST00000117629 132 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Gm11908-201ENSMUST00000117755 347 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Gm14677-201ENSMUST00000117866 486 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Eif3s6-ps1-201ENSMUST00000117907 470 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Gm11911-201ENSMUST00000117938 1023 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Gm4989-201ENSMUST00000118711 749 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Gm12878-201ENSMUST00000118744 332 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Gm11798-201ENSMUST00000119150 421 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Gm5287-201ENSMUST00000120666 598 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 3110067C02Rik-201ENSMUST00000120793 2117 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Rpl36a-ps4-201ENSMUST00000121019 296 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Rhox11-ps1-201ENSMUST00000121945 387 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Gm14366-201ENSMUST00000121970 730 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Gm14951-201ENSMUST00000143622 570 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Gm25489-201ENSMUST00000158727 141 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Gm23028-201ENSMUST00000158773 265 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Ear-ps9-201ENSMUST00000161963 460 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Obox3-ps8-201ENSMUST00000177182 960 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Gm8221-201ENSMUST00000178052 564 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Lipo1-202ENSMUST00000178735 1188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Gm21171-201ENSMUST00000180048 673 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Gm25873-201ENSMUST00000180317 107 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Mir6238-201ENSMUST00000184140 129 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Mir7653-201ENSMUST00000184358 61 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Trav6-4-202ENSMUST00000184650 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Ms4a4a-201ENSMUST00000188995 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Gm29552-201ENSMUST00000190548 660 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Gm38015-201ENSMUST00000193048 188 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Gm18427-201ENSMUST00000195422 515 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Gm43070-201ENSMUST00000196938 415 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Mir219c-201ENSMUST00000199860 60 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 1700110I07Rik-201ENSMUST00000205487 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Gm34811-201ENSMUST00000206580 445 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Olfr490-202ENSMUST00000211345 1275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Gm29521-203ENSMUST00000216148 805 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Gm2628-201ENSMUST00000218019 426 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 AC102575.1-201ENSMUST00000225348 547 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 AC141884.1-201ENSMUST00000226327 636 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 AC154283.1-201ENSMUST00000228417 389 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Bglap-201ENSMUST00000076048 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Olfr1348-201ENSMUST00000086319 957 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Cav1-201ENSMUST00000007799 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Gm16270-201ENSMUST00000160327 3238 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 5930409G06Rik-201ENSMUST00000192347 1544 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Gm45562-201ENSMUST00000210015 1537 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Zfp9-201ENSMUST00000161170 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Gm43437-201ENSMUST00000198535 3955 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Olfr1392-206ENSMUST00000215861 3670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 AC154682.1-201ENSMUST00000225871 3124 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Gm43302-201ENSMUST00000050011 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Lgi1-207ENSMUST00000198518 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Gm43745-201ENSMUST00000198085 1883 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Cnga1-204ENSMUST00000169997 2251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Olfr1204-202ENSMUST00000213283 6935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Gm43886-201ENSMUST00000205039 2386 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Csn3-203ENSMUST00000113271 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Slc38a4-201ENSMUST00000023101 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 CT009696.4-201ENSMUST00000213487 1801 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Serpina3b-201ENSMUST00000085052 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Gm37775-201ENSMUST00000194120 2313 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Vmn2r113-201ENSMUST00000170322 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Anapc10-201ENSMUST00000048147 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Iglv2-201ENSMUST00000103752 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Gm22499-201ENSMUST00000104501 135 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Gm15073-201ENSMUST00000117432 634 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Mup12-201ENSMUST00000117932 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
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ptchd1Q14B62 2810403D21Rik-203ENSMUST00000131640 546 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Gm11659-201ENSMUST00000137561 466 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Gm25048-201ENSMUST00000158598 91 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Gm3084-201ENSMUST00000169967 598 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Olfr296-ps1-201ENSMUST00000173904 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 1110046J04Rik-203ENSMUST00000181800 777 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 4930519F16Rik-206ENSMUST00000183292 800 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Olfr1391-201ENSMUST00000187509 938 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Mrgpra18-ps-201ENSMUST00000188059 907 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Gm43856-201ENSMUST00000197004 369 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Rhox7-ps2-201ENSMUST00000197804 322 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Csn2-209ENSMUST00000199624 890 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Gm43945-201ENSMUST00000203595 754 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Gm7990-201ENSMUST00000212126 593 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Olfr897-ps1-201ENSMUST00000213589 935 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Gm31432-201ENSMUST00000214727 538 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Olfr936-202ENSMUST00000216912 937 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Gm18409-202ENSMUST00000220105 529 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Il9-201ENSMUST00000022019 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 AC154636.1-201ENSMUST00000223226 126 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 AC123665.4-201ENSMUST00000228790 249 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Cox7b-201ENSMUST00000033582 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Defb8-201ENSMUST00000033854 287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
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