Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Mir466b-1-201ENSMUST00000177988 82 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 n-R5s109-201ENSMUST00000179195 119 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Gm20812-201ENSMUST00000179220 684 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Gm22756-201ENSMUST00000180118 107 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Gm8883-201ENSMUST00000187594 454 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Gm37272-201ENSMUST00000193401 488 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Fbxw23-201ENSMUST00000198015 425 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Gm43116-201ENSMUST00000199789 195 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Gm42673-201ENSMUST00000202676 337 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Gm44287-201ENSMUST00000203069 290 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Gm44730-201ENSMUST00000205902 716 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Gm2774-201ENSMUST00000213650 1165 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 AC153557.1-201ENSMUST00000217697 403 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Gm26054-201ENSMUST00000083037 107 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Gm24492-201ENSMUST00000083798 107 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Gm24817-201ENSMUST00000093672 105 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Mylk3-203ENSMUST00000122452 3036 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Phc3-206ENSMUST00000129817 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Cldn2-201ENSMUST00000054889 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Sirpb1c-201ENSMUST00000050623 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Tcf20-201ENSMUST00000048966 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Spag9-204ENSMUST00000092777 6913 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Far1-201ENSMUST00000033018 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 AC156163.1-201ENSMUST00000215598 3369 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Nxt2-203ENSMUST00000112914 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Srcap-214ENSMUST00000190390 9633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Gm6866-201ENSMUST00000188559 2549 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Gm43099-201ENSMUST00000198943 5241 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Erc1-201ENSMUST00000032279 8356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Sel1l2-202ENSMUST00000122367 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Gm38105-201ENSMUST00000192112 2621 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Tcf4-202ENSMUST00000078486 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Mir674-201ENSMUST00000102421 100 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Igkv6-32-201ENSMUST00000103377 366 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Ighv12-3-201ENSMUST00000103485 353 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Gm24709-201ENSMUST00000104123 132 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 3110004A20Rik-201ENSMUST00000123904 385 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Gm14376-201ENSMUST00000145297 297 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Gm18953-201ENSMUST00000175694 300 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 4931403E22Rik-201ENSMUST00000177048 668 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Gm28846-201ENSMUST00000189161 368 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Mrln-201ENSMUST00000020090 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Gm44533-201ENSMUST00000207782 268 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 AC138329.1-201ENSMUST00000225040 471 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Snora2b-201ENSMUST00000084005 137 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Grin2a-206ENSMUST00000199708 14634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Fryl-202ENSMUST00000101127 11340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Cyp2j12-201ENSMUST00000097972 1675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Zhx3-201ENSMUST00000103111 9563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Olfr675-202ENSMUST00000210113 3671 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Gm5182-201ENSMUST00000217708 6092 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 A130012E19Rik-201ENSMUST00000218674 3135 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Ice2-201ENSMUST00000034761 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Slc7a14-201ENSMUST00000091259 8897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Olfr370-202ENSMUST00000209408 4600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Elp2-201ENSMUST00000025120 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 AY512931-201ENSMUST00000139751 2395 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Zfp180-205ENSMUST00000207002 3690 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Tank-205ENSMUST00000112502 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Itgam-202ENSMUST00000106240 3325 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Efcab5-201ENSMUST00000108400 4654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Mbnl2-202ENSMUST00000167459 4534 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Asap1-215ENSMUST00000177035 3228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Slc7a2-204ENSMUST00000118432 3681 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Dock2-201ENSMUST00000093193 6409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Mast4-201ENSMUST00000099202 7709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Igkv4-68-201ENSMUST00000103350 394 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Igkv4-59-201ENSMUST00000103354 368 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Snord88a-201ENSMUST00000116723 90 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Gm14163-201ENSMUST00000117342 217 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Gm6897-201ENSMUST00000117714 138 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Gm14566-201ENSMUST00000118915 321 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Gm14758-201ENSMUST00000119104 138 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Gm7219-201ENSMUST00000119619 297 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Olfr626-ps1-201ENSMUST00000121147 318 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Gm15335-201ENSMUST00000122442 411 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Gm16084-201ENSMUST00000148122 620 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Gm24435-201ENSMUST00000157886 110 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Dynlt1a-201ENSMUST00000169415 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Gm5329-201ENSMUST00000186898 463 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Gm43561-201ENSMUST00000199866 448 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Gm45296-201ENSMUST00000209625 205 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Olfr337-ps1-202ENSMUST00000213375 526 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Gm18487-201ENSMUST00000215826 878 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 1700007K09Rik-201ENSMUST00000033146 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Gm20302-201ENSMUST00000080671 275 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Mov10l1-201ENSMUST00000015509 4052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Ugt1a6b-201ENSMUST00000113137 2249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Vwa3a-201ENSMUST00000033180 4575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Sulf1-201ENSMUST00000088585 4630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Gm37786-201ENSMUST00000191714 3225 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Slfn4-202ENSMUST00000167596 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Gm45805-201ENSMUST00000212695 2066 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Virma-202ENSMUST00000059914 6506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 8030451A03Rik-203ENSMUST00000141428 2618 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Cd36-204ENSMUST00000170051 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Gm42523-201ENSMUST00000199378 2872 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Ppp1r9a-201ENSMUST00000035813 9547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Syn3-202ENSMUST00000121789 4006 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Ap2b1-202ENSMUST00000065692 3269 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.2 ms