Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Btf3l4-204ENSMUST00000102742 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm44678-201ENSMUST00000207828 2775 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Nebl-207ENSMUST00000132418 1734 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm44689-201ENSMUST00000208786 1372 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Vmn2r116-201ENSMUST00000164856 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Vmn2r90-201ENSMUST00000169805 2592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Olfr699-203ENSMUST00000216307 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Ssxb9-201ENSMUST00000115584 879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm13250-201ENSMUST00000117209 753 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm12704-201ENSMUST00000119789 464 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm11446-201ENSMUST00000121319 866 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gtsf1-202ENSMUST00000123724 747 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Tnfaip8-203ENSMUST00000126666 906 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm16220-201ENSMUST00000131874 405 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gtsf1-204ENSMUST00000136480 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 A630023P12Rik-204ENSMUST00000142879 524 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm16129-201ENSMUST00000152628 486 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm25520-201ENSMUST00000158389 118 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm23354-201ENSMUST00000158426 104 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Spink10-206ENSMUST00000162511 684 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm7316-201ENSMUST00000165395 445 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Mir3062-201ENSMUST00000174986 105 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Vmn2r-ps10-201ENSMUST00000176836 898 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Vmn2r-ps8-201ENSMUST00000177088 898 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm20826-201ENSMUST00000179256 758 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Cox6b2-202ENSMUST00000182048 465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Cox6b2-206ENSMUST00000182738 423 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Rian-214ENSMUST00000183026 596 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Mir6238-201ENSMUST00000184140 129 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Lockd-204ENSMUST00000184991 243 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm27427-201ENSMUST00000185134 193 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 1700041C23Rik-201ENSMUST00000185243 395 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm37231-201ENSMUST00000191716 621 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm37026-201ENSMUST00000191917 535 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm5285-201ENSMUST00000193089 666 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm38159-202ENSMUST00000194145 621 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm37734-201ENSMUST00000194294 621 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm36941-202ENSMUST00000194799 621 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm37378-202ENSMUST00000195795 621 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm37130-202ENSMUST00000195874 621 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm9173-201ENSMUST00000198054 400 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm5288-201ENSMUST00000198323 1119 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm2011-203ENSMUST00000203750 435 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm7825-201ENSMUST00000204046 416 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm5581-202ENSMUST00000204992 714 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm29154-234ENSMUST00000215272 750 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 AC153961.2-201ENSMUST00000218877 164 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 CT009733.1-203ENSMUST00000224033 451 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 AC154738.5-201ENSMUST00000227397 310 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 AC163646.1-201ENSMUST00000227704 397 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 BC049715-201ENSMUST00000052702 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Spink12-201ENSMUST00000081271 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Defb25-201ENSMUST00000099203 293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm10801-201ENSMUST00000099684 504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 A530083M17Rik-201ENSMUST00000199877 3376 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 CT025710.1-201ENSMUST00000222949 2533 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 AC124586.1-201ENSMUST00000221673 2795 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Olfr1112-202ENSMUST00000216772 1443 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Olfr843-203ENSMUST00000214267 7071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Obox5-201ENSMUST00000098802 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Olfr147-202ENSMUST00000214648 5356 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm7529-201ENSMUST00000213753 1897 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Zfp955a-201ENSMUST00000008830 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Olfr118-203ENSMUST00000216551 1772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Vmn2r110-201ENSMUST00000169559 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Lair1-201ENSMUST00000068865 6828 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Zfp353-ps-201ENSMUST00000107130 1650 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Trbv12-1-201ENSMUST00000103267 389 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm23274-201ENSMUST00000104056 130 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm24170-201ENSMUST00000104124 133 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Vmn1r-ps108-201ENSMUST00000117059 365 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm12717-201ENSMUST00000118427 983 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm14541-201ENSMUST00000118985 157 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm12820-201ENSMUST00000119233 342 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Vmn1r-ps109-201ENSMUST00000119308 725 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Olfr1050-ps1-201ENSMUST00000119802 947 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm17014-201ENSMUST00000120765 168 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm12685-201ENSMUST00000121702 214 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm12162-201ENSMUST00000123422 154 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm5924-201ENSMUST00000132554 871 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm24175-201ENSMUST00000158931 129 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm15716-201ENSMUST00000162457 404 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm16563-201ENSMUST00000162673 423 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm3173-203ENSMUST00000166848 396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Vmn1r-ps56-201ENSMUST00000172769 965 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm13147-202ENSMUST00000177526 1173 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Mrps36-ps3-201ENSMUST00000183899 305 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm28353-201ENSMUST00000186482 570 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm28533-201ENSMUST00000186741 570 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Hmgn3-205ENSMUST00000187193 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm43494-201ENSMUST00000197672 388 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 4930434O05Rik-201ENSMUST00000203259 387 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Minpp1-ps-201ENSMUST00000203344 946 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Olfr588-ps1-202ENSMUST00000210115 912 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Olfr840-ps1-201ENSMUST00000211827 917 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 AL772397.1-201ENSMUST00000216707 606 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm35615-201ENSMUST00000221255 719 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 AC117202.1-201ENSMUST00000227007 445 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 CT030238.1-201ENSMUST00000228393 442 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Mrgprb8-201ENSMUST00000056676 1123 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.8 ms