Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm37010-201ENSMUST00000194539 1704 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RxraP28700 Rnf213-201ENSMUST00000093902 16716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
RxraP28700 Fbxw15-201ENSMUST00000056745 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RxraP28700 Cfap54-207ENSMUST00000168110 9903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm3604-202ENSMUST00000187656 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RxraP28700 Olfr741-202ENSMUST00000205518 3406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
RxraP28700 Macc1-205ENSMUST00000222784 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RxraP28700 A330087D11Rik-201ENSMUST00000187265 1334 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm43121-201ENSMUST00000199065 1305 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm28183-201ENSMUST00000191321 1406 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RxraP28700 4931412I15Rik-201ENSMUST00000207844 1448 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RxraP28700 Vmn1r39-207ENSMUST00000228862 2398 ntAPPRIS P2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RxraP28700 Olfr620-201ENSMUST00000052152 3157 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RxraP28700 Brip1-201ENSMUST00000044423 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm38104-201ENSMUST00000195121 1895 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RxraP28700 Vmn2r29-201ENSMUST00000170922 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm3962-201ENSMUST00000173027 2587 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RxraP28700 Igkv4-70-201ENSMUST00000103348 379 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm8202-201ENSMUST00000117682 310 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm5384-201ENSMUST00000120313 463 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm13484-201ENSMUST00000120738 412 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RxraP28700 4930563I02Rik-202ENSMUST00000154835 971 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm22817-201ENSMUST00000157448 356 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm16236-201ENSMUST00000159588 379 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm5929-201ENSMUST00000166883 487 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RxraP28700 Rpl9-ps5-201ENSMUST00000174221 571 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RxraP28700 Vmn1r-ps22-201ENSMUST00000176017 900 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm25944-201ENSMUST00000178758 94 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm28017-201ENSMUST00000183434 126 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm27942-201ENSMUST00000184669 101 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm28873-201ENSMUST00000186130 667 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm28840-203ENSMUST00000187128 975 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm6137-201ENSMUST00000187552 578 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm8498-201ENSMUST00000188227 974 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm37231-201ENSMUST00000191716 621 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm38281-201ENSMUST00000192301 315 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm37340-201ENSMUST00000193124 759 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm38159-202ENSMUST00000194145 621 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm37734-201ENSMUST00000194294 621 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm36941-202ENSMUST00000194799 621 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm37378-202ENSMUST00000195795 621 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm37130-202ENSMUST00000195874 621 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RxraP28700 1700013M08Rik-201ENSMUST00000197709 683 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RxraP28700 Mir1892-201ENSMUST00000197752 80 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm43276-201ENSMUST00000199712 364 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm44261-201ENSMUST00000203337 209 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm32453-201ENSMUST00000204183 456 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm19709-201ENSMUST00000215403 482 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RxraP28700 AC192088.3-201ENSMUST00000227858 831 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RxraP28700 CT030238.1-201ENSMUST00000228393 442 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RxraP28700 Clec2j-201ENSMUST00000032517 515 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm4963-201ENSMUST00000072718 378 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm24525-201ENSMUST00000082917 151 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RxraP28700 Olfr1407-ps1-201ENSMUST00000085885 797 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RxraP28700 Pnpla8-201ENSMUST00000043082 13507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm36931-201ENSMUST00000192997 4801 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RxraP28700 AI481877-201ENSMUST00000107547 4664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RxraP28700 Mdn1-201ENSMUST00000071642 17970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RxraP28700 Vmn1r43-204ENSMUST00000226983 12805 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm14308-203ENSMUST00000119149 1458 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm14434-202ENSMUST00000120959 1458 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm29084-201ENSMUST00000185587 1452 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RxraP28700 Usf3-204ENSMUST00000169582 12604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RxraP28700 Vmn2r89-201ENSMUST00000159611 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
RxraP28700 AC164102.1-201ENSMUST00000220524 1553 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RxraP28700 mt-Rnr2-201ENSMUST00000082390 1582 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm44587-201ENSMUST00000207399 1685 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RxraP28700 Cnot4-206ENSMUST00000202143 3202 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
RxraP28700 Zfp65-201ENSMUST00000073157 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
RxraP28700 Ankar-202ENSMUST00000211837 4543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
RxraP28700 Vmn1r219-203ENSMUST00000227388 7948 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
RxraP28700 Btbd35f1-201ENSMUST00000178070 1955 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
RxraP28700 Zfp78-201ENSMUST00000086323 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
RxraP28700 Dach2-202ENSMUST00000113378 2089 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
RxraP28700 Ccr2-204ENSMUST00000171719 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm46430-206ENSMUST00000222064 1647 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
RxraP28700 Plcz1-201ENSMUST00000032356 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
RxraP28700 Fat1-206ENSMUST00000215588 13938 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
RxraP28700 Vmn1r210-202ENSMUST00000226180 3116 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm43201-201ENSMUST00000195925 3416 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RxraP28700 Igkv10-94-201ENSMUST00000103330 347 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
RxraP28700 Ighv9-4-201ENSMUST00000103482 294 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
RxraP28700 Traj25-201ENSMUST00000103716 57 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm25418-201ENSMUST00000104214 129 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm12887-201ENSMUST00000106265 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm14221-201ENSMUST00000109473 340 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
RxraP28700 Fam107b-205ENSMUST00000115055 515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm13195-201ENSMUST00000117229 261 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RxraP28700 Rpl38-ps1-201ENSMUST00000117723 215 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm15357-201ENSMUST00000119160 285 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm14861-201ENSMUST00000119451 455 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm13537-201ENSMUST00000120467 267 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RxraP28700 Smt3h2-ps-201ENSMUST00000121084 285 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm14162-201ENSMUST00000121985 601 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RxraP28700 4933411O13Rik-202ENSMUST00000140815 370 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm11197-201ENSMUST00000145158 839 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm22818-201ENSMUST00000157446 104 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm22895-201ENSMUST00000157508 308 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm15657-203ENSMUST00000163077 779 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
RxraP28700 Sult3a2-201ENSMUST00000165904 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
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