Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Dmxl2-202ENSMUST00000118600 9465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Mir676-201ENSMUST00000102443 89 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Rpl23a-ps14-201ENSMUST00000118777 424 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Gm15923-201ENSMUST00000119300 1169 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Gm15364-201ENSMUST00000119618 585 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Gm11325-201ENSMUST00000119967 469 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Gm9003-201ENSMUST00000121810 482 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Olfr59-201ENSMUST00000143976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 A930041C12Rik-201ENSMUST00000149156 537 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Gm4487-201ENSMUST00000150617 442 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Fnbp1l-203ENSMUST00000162947 1830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Igkv2-95-2-201ENSMUST00000166362 222 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Cst12-202ENSMUST00000168443 546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Vmn2r-ps59-201ENSMUST00000174596 135 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Gm43825-201ENSMUST00000199650 734 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Klk1b23-ps-201ENSMUST00000206347 345 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 AU023762-202ENSMUST00000209716 961 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Olfr151-201ENSMUST00000211893 1128 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Olfr879-ps1-201ENSMUST00000212455 694 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 AC127581.1-201ENSMUST00000214084 771 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Olfr965-203ENSMUST00000215164 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 AC115034.1-201ENSMUST00000215393 3846 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Olfr1252-203ENSMUST00000216203 3243 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 AC156632.1-201ENSMUST00000220626 3845 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Gm19134-201ENSMUST00000221203 487 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Dbpht2-202ENSMUST00000221311 5341 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 AC102603.1-201ENSMUST00000227481 584 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Olfr453-201ENSMUST00000053647 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Rpl21-ps14-201ENSMUST00000080279 483 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 n-R5s7-201ENSMUST00000083755 121 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Olfr714-203ENSMUST00000214429 4324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Olfr1459-202ENSMUST00000213493 8854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Gm43266-201ENSMUST00000201049 1771 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Cfhr1-201ENSMUST00000023965 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 4921515E04Rik-202ENSMUST00000226383 1738 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Nlrp4c-204ENSMUST00000208360 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Bmp15-201ENSMUST00000024049 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 AC147639.2-202ENSMUST00000224834 1545 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Fap-202ENSMUST00000102732 2751 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Gm14791-201ENSMUST00000119061 1166 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Gm1866-201ENSMUST00000120701 477 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Gm25846-201ENSMUST00000158013 135 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Gm27636-201ENSMUST00000184528 122 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Gml2-203ENSMUST00000188180 649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Gm18177-201ENSMUST00000188373 404 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Gm29552-201ENSMUST00000190548 660 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Gm29793-201ENSMUST00000202874 460 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Gm32536-201ENSMUST00000205209 445 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Gm3912-203ENSMUST00000211024 367 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 AC153729.2-201ENSMUST00000215166 560 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 CT025625.1-201ENSMUST00000217786 460 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Gm46190-201ENSMUST00000219650 427 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Gm26861-206ENSMUST00000222633 1039 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 AC140344.1-201ENSMUST00000223384 387 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Vmn1r49-201ENSMUST00000071865 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 4930512M02Rik-201ENSMUST00000081896 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Brcc3-202ENSMUST00000114074 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Uhmk1-203ENSMUST00000150821 7676 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Acsm3-205ENSMUST00000106529 3295 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Macf1-201ENSMUST00000082108 17331 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Adgrv1-201ENSMUST00000095585 19338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Rtl9-201ENSMUST00000165829 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Hoxd10P28359 Gm19666-201ENSMUST00000198176 1893 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Gm19744-204ENSMUST00000188936 4533 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 AC159476.1-201ENSMUST00000215914 1668 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Olfr1341-203ENSMUST00000215117 4700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 AC153964.1-201ENSMUST00000219677 3142 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Scn7a-201ENSMUST00000042792 7338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Olfr998-202ENSMUST00000215083 1399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Slc22a28-201ENSMUST00000065651 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Vmn1r173-202ENSMUST00000226233 9416 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Ncoa7-202ENSMUST00000092610 2590 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Mir292-201ENSMUST00000104847 82 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Gm5757-201ENSMUST00000117494 528 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Gm11631-201ENSMUST00000119220 156 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Gm6071-201ENSMUST00000119561 440 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Gm12332-201ENSMUST00000121397 922 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Mir6537-201ENSMUST00000184150 110 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Gm8939-201ENSMUST00000192577 964 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Gm37097-201ENSMUST00000193676 336 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Gm43574-201ENSMUST00000196226 809 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Gm5660-201ENSMUST00000197453 1149 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Mir129b-201ENSMUST00000197461 65 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Gm8069-201ENSMUST00000197887 154 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Gm42695-201ENSMUST00000199445 818 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Gm43710-201ENSMUST00000199583 452 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Olfr1449-204ENSMUST00000215325 1149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 RMST_1.1-205ENSMUST00000218060 997 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 AC129202.3-201ENSMUST00000224413 733 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 AC140368.1-202ENSMUST00000226131 658 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Olfr945-201ENSMUST00000076903 963 ntAPPRIS P2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Gm25099-201ENSMUST00000093716 116 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Gm9495-201ENSMUST00000200846 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Vmn1r52-202ENSMUST00000226520 3125 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 AC149588.1-201ENSMUST00000228274 3745 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Gm20342-201ENSMUST00000185480 9720 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Oxr1-202ENSMUST00000090095 4156 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Slc19a3-201ENSMUST00000045560 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Vmn1r175-202ENSMUST00000228383 2878 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms