Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm8693-201ENSMUST00000178871 921 ntAPPRIS P1 BASIC3.68□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Vmn1r138-201ENSMUST00000179206 921 ntAPPRIS P1 BASIC3.68□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Vmn1r131-201ENSMUST00000179390 921 ntAPPRIS P1 BASIC3.68□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Vmn1r111-201ENSMUST00000179511 921 ntAPPRIS P1 BASIC3.68□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 BE692007-201ENSMUST00000186054 954 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Gm28709-201ENSMUST00000186967 456 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Gm5368-201ENSMUST00000189012 589 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Gm28612-201ENSMUST00000189214 416 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 4930440C22Rik-202ENSMUST00000190754 512 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Gm36638-201ENSMUST00000193295 400 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Gm8861-201ENSMUST00000196346 832 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Gm42610-201ENSMUST00000196557 650 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Gm43724-201ENSMUST00000197516 226 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Gm18452-201ENSMUST00000202968 1111 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Gm44023-201ENSMUST00000203710 469 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Gm38832-201ENSMUST00000205674 400 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Gm45006-201ENSMUST00000206078 690 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 4930405G09Rik-201ENSMUST00000207912 1060 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Gm19096-201ENSMUST00000209705 766 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Gm45305-201ENSMUST00000209799 815 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Gm40608-201ENSMUST00000213692 654 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Gm19936-201ENSMUST00000216414 838 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 AC138290.1-201ENSMUST00000219242 820 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Gm18363-201ENSMUST00000221671 730 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 AC132324.1-201ENSMUST00000221855 584 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 AC154816.2-201ENSMUST00000221918 372 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 CT954323.2-201ENSMUST00000222056 213 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Rps24-205ENSMUST00000223999 525 ntAPPRIS ALT1 BASIC3.68□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 AC102542.1-201ENSMUST00000225204 1138 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Olfr1451-201ENSMUST00000063144 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.68□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 BC048502-201ENSMUST00000065978 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Olfr924-201ENSMUST00000072977 927 ntAPPRIS P1 BASIC3.68□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 n-R5s162-201ENSMUST00000082581 119 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Gm23464-201ENSMUST00000083145 147 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Clca4c-ps-202ENSMUST00000200595 2779 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Vmn1r184-202ENSMUST00000227230 7999 ntAPPRIS P1 BASIC3.68□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Gm43913-201ENSMUST00000203924 3029 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Scel-201ENSMUST00000095576 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Olfr178-202ENSMUST00000206523 2095 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Olfr919-202ENSMUST00000215612 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Olfr870-202ENSMUST00000215984 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Olfr933-202ENSMUST00000216238 4475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Gnat3-201ENSMUST00000030561 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Hdx-201ENSMUST00000038472 9385 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Olfr729-202ENSMUST00000213163 4283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Gm29325-201ENSMUST00000190705 2528 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Gm5798-201ENSMUST00000164613 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Gm43327-201ENSMUST00000199285 4055 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Traj7-201ENSMUST00000103733 59 ntAPPRIS P1 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Gm23014-201ENSMUST00000104144 130 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Gm23608-201ENSMUST00000104545 128 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Cldn34d-201ENSMUST00000114054 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Cask-202ENSMUST00000115435 726 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Gm23226-201ENSMUST00000116927 103 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Gm15752-201ENSMUST00000117427 394 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Gm15403-201ENSMUST00000119343 1227 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Rps10-ps3-201ENSMUST00000122317 500 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Gm24113-201ENSMUST00000157477 276 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Gm25264-201ENSMUST00000158519 117 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Gm17109-201ENSMUST00000163985 358 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Gm22177-201ENSMUST00000175002 158 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Obox4-ps9-201ENSMUST00000176927 1136 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Vmn2r-ps23-201ENSMUST00000178719 571 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 1700010I02Rik-201ENSMUST00000187729 438 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Gm37632-201ENSMUST00000191811 1142 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 1700011C11Rik-201ENSMUST00000205268 365 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Gm6303-201ENSMUST00000210123 471 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Gm45462-201ENSMUST00000211267 792 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Gm7333-201ENSMUST00000213449 1060 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 AC160962.1-203ENSMUST00000225167 1105 ntAPPRIS P5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
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Ccl20O89093 Vmn2r35-201ENSMUST00000169683 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Gm26717-201ENSMUST00000181713 1418 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Gm7754-201ENSMUST00000223075 2064 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 AC152981.1-201ENSMUST00000218320 2480 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Syne2-201ENSMUST00000044217 21690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 5830444F18Rik-201ENSMUST00000194009 1992 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Gm42486-201ENSMUST00000200369 3486 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Cwf19l2-201ENSMUST00000027027 4446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 2210418O10Rik-203ENSMUST00000136719 2314 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Gm38091-201ENSMUST00000192418 3871 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Mga-204ENSMUST00000110774 13931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Gm23879-201ENSMUST00000116874 126 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Vmn1r-ps99-201ENSMUST00000120067 766 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Gm13745-201ENSMUST00000121994 527 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Gm10444-201ENSMUST00000126708 148 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Cldn34-ps-201ENSMUST00000145498 600 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Gm4181-201ENSMUST00000170249 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Gm16451-201ENSMUST00000173484 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Mir5103-201ENSMUST00000175111 79 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Tex50-202ENSMUST00000178511 954 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Mir7037-201ENSMUST00000184414 65 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Mrgprc1-ps-201ENSMUST00000185552 952 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Hmgn3-205ENSMUST00000187193 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Gm28924-201ENSMUST00000190012 241 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Mir6994-201ENSMUST00000198985 73 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Gm44330-201ENSMUST00000200106 143 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Gm8132-201ENSMUST00000204938 640 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Gm45032-201ENSMUST00000205375 520 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 AC123944.2-201ENSMUST00000215290 382 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.4 ms