Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Gm37002-201ENSMUST00000194560 373 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
MttpO08601 Gm43144-201ENSMUST00000198256 485 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
MttpO08601 Gm40323-201ENSMUST00000200649 645 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
MttpO08601 AC120011.1-201ENSMUST00000202147 744 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
MttpO08601 Gm45651-201ENSMUST00000210857 335 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
MttpO08601 Gm32281-202ENSMUST00000217220 691 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
MttpO08601 AC123064.2-201ENSMUST00000217758 193 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
MttpO08601 Gm7117-201ENSMUST00000071515 387 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
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MttpO08601 Clca4c-ps-201ENSMUST00000098551 712 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
MttpO08601 Olfr1233-201ENSMUST00000099784 1042 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
MttpO08601 Olfr1200-201ENSMUST00000099811 1011 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
MttpO08601 AC102847.2-201ENSMUST00000227799 2906 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
MttpO08601 Ogt-201ENSMUST00000044475 5384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
MttpO08601 Xirp2-201ENSMUST00000028410 11955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
MttpO08601 Gm11639-203ENSMUST00000212287 17665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
MttpO08601 Zfp287-201ENSMUST00000005399 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
MttpO08601 Cd28-201ENSMUST00000027165 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
MttpO08601 Serpinb3a-201ENSMUST00000027567 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
MttpO08601 Ankrd28-204ENSMUST00000227089 3522 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
MttpO08601 Zfp300-201ENSMUST00000040667 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
MttpO08601 Vmn1r214-203ENSMUST00000227652 3906 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
MttpO08601 Gm27008-201ENSMUST00000182400 1360 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
MttpO08601 Olfr491-202ENSMUST00000209545 1944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
MttpO08601 Gm37527-201ENSMUST00000192406 3547 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
MttpO08601 Gm42729-201ENSMUST00000201770 2930 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
MttpO08601 BB019430-202ENSMUST00000218015 1320 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
MttpO08601 Gm23594-201ENSMUST00000104307 134 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
MttpO08601 Gm14393-202ENSMUST00000109066 564 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
MttpO08601 Smpx-202ENSMUST00000112520 503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
MttpO08601 Fam107b-205ENSMUST00000115055 515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
MttpO08601 Gm16106-201ENSMUST00000119187 294 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
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MttpO08601 Gm13745-201ENSMUST00000121994 527 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
MttpO08601 Gm13632-201ENSMUST00000150119 384 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
MttpO08601 D6Ertd474e-203ENSMUST00000160188 683 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
MttpO08601 Gm16430-202ENSMUST00000178145 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
MttpO08601 Gm16405-202ENSMUST00000180150 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
MttpO08601 Gm27875-201ENSMUST00000184425 123 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
MttpO08601 Gm27690-201ENSMUST00000184596 126 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
MttpO08601 1700007K09Rik-202ENSMUST00000188899 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
MttpO08601 Gm36983-201ENSMUST00000192280 1102 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
MttpO08601 Gm42610-201ENSMUST00000196557 650 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
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MttpO08601 1700124M09Rik-201ENSMUST00000217047 305 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
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MttpO08601 AC132324.1-201ENSMUST00000221855 584 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
MttpO08601 AC165283.1-201ENSMUST00000223390 307 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
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MttpO08601 Olfr273-201ENSMUST00000051520 1059 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
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MttpO08601 Gm2824-202ENSMUST00000180955 3522 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
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MttpO08601 AC174797.3-203ENSMUST00000225749 2078 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
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MttpO08601 Angptl3-201ENSMUST00000030280 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
MttpO08601 1700080O16Rik-201ENSMUST00000033449 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
MttpO08601 Evi2-202ENSMUST00000170422 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
MttpO08601 Olfr1196-202ENSMUST00000216928 4270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
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MttpO08601 Elavl2-202ENSMUST00000102799 3840 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
MttpO08601 Fat3-201ENSMUST00000082170 18456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
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MttpO08601 Tgif1-202ENSMUST00000118283 1388 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
MttpO08601 Btbd35f13-201ENSMUST00000177912 1701 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
MttpO08601 Akap4-201ENSMUST00000057101 2851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
MttpO08601 Brcc3-202ENSMUST00000114074 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
MttpO08601 AC151904.4-201ENSMUST00000219868 1319 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
MttpO08601 Gm2123-201ENSMUST00000221476 2836 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
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MttpO08601 Gm14575-201ENSMUST00000117210 560 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
MttpO08601 Gm2288-201ENSMUST00000118560 638 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
MttpO08601 Olfr1050-ps1-201ENSMUST00000119802 947 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
MttpO08601 Gm15120-201ENSMUST00000120602 301 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
MttpO08601 Gm13132-201ENSMUST00000121194 472 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
MttpO08601 Gm11274-201ENSMUST00000146857 481 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
MttpO08601 Gm13219-202ENSMUST00000152599 685 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
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