Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 1700014L14Rik-201ENSMUST00000211704 481 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc6D3YZP9 Gm45701-201ENSMUST00000212049 235 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc6D3YZP9 AC131720.3-201ENSMUST00000219113 275 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc6D3YZP9 AC160756.1-201ENSMUST00000227266 235 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc6D3YZP9 Gm44518-201ENSMUST00000208080 4370 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc6D3YZP9 Slc6a15-202ENSMUST00000179636 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc6D3YZP9 Ctsq-201ENSMUST00000021888 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc6D3YZP9 AC154481.2-201ENSMUST00000222526 3175 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc6D3YZP9 Cxcl15-201ENSMUST00000031322 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc6D3YZP9 Ms4a7-201ENSMUST00000025574 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc6D3YZP9 Zfp353-ps-201ENSMUST00000107130 1650 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc6D3YZP9 Gm37834-201ENSMUST00000194517 3035 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc6D3YZP9 Olfr685-202ENSMUST00000209409 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc6D3YZP9 Olfr1184-202ENSMUST00000216675 3164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc6D3YZP9 Sgcd-202ENSMUST00000109220 2450 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc6D3YZP9 Gm7792-201ENSMUST00000201555 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc6D3YZP9 Pcsk2os2-201ENSMUST00000153878 3370 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc6D3YZP9 Btbd35f7-201ENSMUST00000105007 1960 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc6D3YZP9 Taok1-201ENSMUST00000017435 11813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc6D3YZP9 Gm8660-201ENSMUST00000105187 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc6D3YZP9 Gm4177-201ENSMUST00000105196 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc6D3YZP9 Gm5728-201ENSMUST00000105209 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc6D3YZP9 Gm13162-201ENSMUST00000121481 454 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc6D3YZP9 Gm5392-201ENSMUST00000122189 789 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc6D3YZP9 Gm15962-201ENSMUST00000124184 750 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r94-201ENSMUST00000164526 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc6D3YZP9 Ccdc152-201ENSMUST00000165386 798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc6D3YZP9 Gm4216-201ENSMUST00000168926 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r142-201ENSMUST00000169697 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r139-201ENSMUST00000169730 894 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc6D3YZP9 Obox2-202ENSMUST00000172478 818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r112-201ENSMUST00000174538 894 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r157-201ENSMUST00000178215 894 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc6D3YZP9 Gm26692-201ENSMUST00000180428 688 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc6D3YZP9 Mir7578-201ENSMUST00000183455 82 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc6D3YZP9 Gm7634-201ENSMUST00000185778 553 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc6D3YZP9 Gm29045-201ENSMUST00000187278 698 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc6D3YZP9 Gm21654-201ENSMUST00000188086 691 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc6D3YZP9 Gm36983-201ENSMUST00000192280 1102 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc6D3YZP9 Gm38185-201ENSMUST00000193195 694 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc6D3YZP9 Gm9317-201ENSMUST00000197055 862 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc6D3YZP9 AC153912.1-201ENSMUST00000217011 724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc6D3YZP9 Olfr964-ps1-201ENSMUST00000217577 914 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc6D3YZP9 AL589696.1-201ENSMUST00000225711 330 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc6D3YZP9 Gm25005-201ENSMUST00000083812 156 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r132-201ENSMUST00000098736 894 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc6D3YZP9 AC116797.1-201ENSMUST00000223988 3955 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc6D3YZP9 Gm19131-202ENSMUST00000203464 3208 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc6D3YZP9 Ptprd-217ENSMUST00000174023 4530 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc6D3YZP9 Ptprd-203ENSMUST00000098005 4542 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc6D3YZP9 Vmn2r43-201ENSMUST00000066317 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc6D3YZP9 Olfr353-203ENSMUST00000217215 4173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc6D3YZP9 Gm37668-201ENSMUST00000193745 1944 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc6D3YZP9 Cnot4-203ENSMUST00000114993 3473 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc6D3YZP9 Far1-202ENSMUST00000067929 4935 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc6D3YZP9 Gm43374-201ENSMUST00000202498 2391 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc6D3YZP9 Gm9577-201ENSMUST00000174655 2620 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc6D3YZP9 Vmn2r3-201ENSMUST00000170244 2670 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc6D3YZP9 Trav14d-3-dv8-201ENSMUST00000103608 456 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc6D3YZP9 Gm15076-201ENSMUST00000117076 474 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc6D3YZP9 Gm14831-201ENSMUST00000120253 409 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc6D3YZP9 Gm14383-201ENSMUST00000121637 386 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc6D3YZP9 Gm15848-202ENSMUST00000125056 832 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc6D3YZP9 Serf1-202ENSMUST00000129014 543 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r5-201ENSMUST00000164307 1056 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc6D3YZP9 Gm20417-201ENSMUST00000174784 425 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc6D3YZP9 Gm6223-201ENSMUST00000178436 871 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc6D3YZP9 Gm38326-201ENSMUST00000194030 686 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc6D3YZP9 2510017J16Rik-201ENSMUST00000198718 1263 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc6D3YZP9 Gm44200-201ENSMUST00000204883 662 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc6D3YZP9 Clec2f-202ENSMUST00000204981 657 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc6D3YZP9 Gm44865-201ENSMUST00000207240 531 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc6D3YZP9 Gm9616-201ENSMUST00000221154 781 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc6D3YZP9 Gm8672-201ENSMUST00000221200 332 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc6D3YZP9 AC151730.2-201ENSMUST00000224027 475 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc6D3YZP9 CT030662.3-201ENSMUST00000228751 476 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc6D3YZP9 AC154838.1-201ENSMUST00000228944 911 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc6D3YZP9 Gm24207-201ENSMUST00000082781 108 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc6D3YZP9 Olfr1242-201ENSMUST00000099777 1053 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc6D3YZP9 Olfr1180-201ENSMUST00000099824 1063 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc6D3YZP9 Olfr1353-203ENSMUST00000205193 1924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc6D3YZP9 Lipo5-201ENSMUST00000156818 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc6D3YZP9 Olfr720-203ENSMUST00000216079 4692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc6D3YZP9 Lingo2-210ENSMUST00000164772 3562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc6D3YZP9 Cul4b-203ENSMUST00000115118 3344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc6D3YZP9 Vmn2r-ps56-201ENSMUST00000174814 2596 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc6D3YZP9 Gm37569-201ENSMUST00000192111 1722 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc6D3YZP9 Gm13118-201ENSMUST00000120402 549 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc6D3YZP9 Gm25104-201ENSMUST00000122476 163 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc6D3YZP9 Gm4725-201ENSMUST00000151048 587 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc6D3YZP9 Gm25438-201ENSMUST00000158281 110 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc6D3YZP9 Gm22160-201ENSMUST00000158405 328 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc6D3YZP9 Vmn2r-ps58-201ENSMUST00000173044 242 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r-ps17-201ENSMUST00000175797 894 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc6D3YZP9 Gm26916-201ENSMUST00000183304 352 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc6D3YZP9 Tprkb-208ENSMUST00000200680 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc6D3YZP9 Olfr200-ps1-201ENSMUST00000207964 874 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc6D3YZP9 Gm7380-201ENSMUST00000211599 466 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc6D3YZP9 Gm45796-201ENSMUST00000212483 114 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc6D3YZP9 Gm18043-201ENSMUST00000216741 739 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.4 ms