Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 AC139750.2-201ENSMUST00000224424 386 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Olfr502-201ENSMUST00000078933 1059 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Olfr1505-201ENSMUST00000081520 1103 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Gm23927-201ENSMUST00000082466 215 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Ang6-201ENSMUST00000096869 444 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Gm12888-201ENSMUST00000097905 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Gm15292-201ENSMUST00000098895 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Olfr1107-201ENSMUST00000099865 1109 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Gvin1-202ENSMUST00000183409 9005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Olfr934-203ENSMUST00000216823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Gm37045-201ENSMUST00000192016 2463 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Xiap-202ENSMUST00000055483 6374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Gm43317-201ENSMUST00000197924 2544 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Gm25764-201ENSMUST00000104092 134 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Gm12173-201ENSMUST00000117622 273 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 AI847159-202ENSMUST00000138431 952 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Gm22314-201ENSMUST00000158007 281 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Ppp1r2-ps9-201ENSMUST00000173100 549 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Gm8296-201ENSMUST00000185597 524 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Trdv1-202ENSMUST00000187163 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Gm43304-201ENSMUST00000196803 326 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Gm7468-201ENSMUST00000203900 652 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Gm7786-201ENSMUST00000210494 436 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 AC156803.1-201ENSMUST00000224407 820 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 AC154738.1-201ENSMUST00000227054 368 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Olfr873-202ENSMUST00000075717 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 4930512M02Rik-201ENSMUST00000081896 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Ndst4-205ENSMUST00000174648 4996 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Gm6853-202ENSMUST00000211360 4375 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Fbxw21-201ENSMUST00000054925 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Gm13230-201ENSMUST00000120870 1575 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Pcdh15-222ENSMUST00000147189 6806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Olfr1382-203ENSMUST00000213707 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Olfr1382-204ENSMUST00000213899 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Olfr1382-205ENSMUST00000217564 4287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r-ps5-201ENSMUST00000175971 2730 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Gm38253-201ENSMUST00000194058 4678 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 4930525G20Rik-201ENSMUST00000181912 2987 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r71-209ENSMUST00000228526 5137 ntAPPRIS P2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Gm37655-201ENSMUST00000193968 4123 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Dnah5-201ENSMUST00000067048 15637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 2210407C18Rik-202ENSMUST00000108821 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Gm11372-201ENSMUST00000117348 570 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 n-R5s201-201ENSMUST00000122622 116 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Gm43015-201ENSMUST00000199087 565 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Gm45659-201ENSMUST00000209295 564 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Gm45796-201ENSMUST00000212483 114 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 AC166343.1-201ENSMUST00000213261 577 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 AC156504.1-201ENSMUST00000214608 157 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 CU024892.1-201ENSMUST00000224869 515 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 AC154727.1-201ENSMUST00000226537 499 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Olfr846-201ENSMUST00000078774 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Gtpbp4-204ENSMUST00000222098 8783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Zbtb38-212ENSMUST00000152594 7406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Cdh6-201ENSMUST00000036439 8167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Gm32647-201ENSMUST00000206116 3288 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Gm8297-202ENSMUST00000171964 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 9330132A10Rik-201ENSMUST00000059118 3727 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Rag2-202ENSMUST00000111227 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Sspo-202ENSMUST00000169350 15571 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 St18-210ENSMUST00000150761 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Olfr145-201ENSMUST00000086062 6796 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Ryr3-210ENSMUST00000208151 15370 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Olfr406-203ENSMUST00000217016 2651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Vcan-203ENSMUST00000109546 12427 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Olfr112-204ENSMUST00000208832 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Dnhd1-203ENSMUST00000145988 14536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Brwd3-205ENSMUST00000150434 11619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Ubr4-212ENSMUST00000165860 15798 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Gm28445-201ENSMUST00000187686 1498 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Slco1b2-201ENSMUST00000042812 3307 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Igkv4-69-201ENSMUST00000103349 348 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Cyp4b1-ps2-201ENSMUST00000119563 333 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Gm22718-201ENSMUST00000122701 315 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Gm15534-201ENSMUST00000137642 562 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Gm24314-201ENSMUST00000158274 123 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Gm17416-201ENSMUST00000163724 201 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Mir1251-201ENSMUST00000175486 84 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Gm43586-201ENSMUST00000195948 310 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Olfr1366-203ENSMUST00000205976 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Gm8745-201ENSMUST00000207846 782 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 5430402P08Rik-201ENSMUST00000211799 1143 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Olfr410-203ENSMUST00000214490 5075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Olfr32-205ENSMUST00000215659 2998 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 AC168059.1-201ENSMUST00000225846 841 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Atad1-201ENSMUST00000070210 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Olfr1143-201ENSMUST00000090708 945 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Myo3b-201ENSMUST00000060208 6256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Tlr13-201ENSMUST00000040065 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Tbl1xr1-202ENSMUST00000192328 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Olfr1243-202ENSMUST00000144885 3148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Olfr577-203ENSMUST00000215237 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Gm37320-201ENSMUST00000192781 4953 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Gm45093-201ENSMUST00000206859 2463 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 4930444F02Rik-201ENSMUST00000215429 6871 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Olfr270-201ENSMUST00000095084 2204 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Gm8104-201ENSMUST00000168165 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Gm44027-201ENSMUST00000203419 3480 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 Olfr1082-201ENSMUST00000215600 1620 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Col5a3Q9JLI2 1700097M23Rik-201ENSMUST00000204079 1522 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
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