Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Xlr5b-201ENSMUST00000097221 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm10800-201ENSMUST00000099683 660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Vmn1r36-201ENSMUST00000226142 1770 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Olfr1406-202ENSMUST00000201132 2952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Aadacl3-201ENSMUST00000105749 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Chl1-203ENSMUST00000203830 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Vmn2r2-202ENSMUST00000177151 2727 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm37686-201ENSMUST00000194099 2309 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Xkr9-201ENSMUST00000088542 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm6634-201ENSMUST00000180497 1804 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm42645-201ENSMUST00000201573 1627 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Lcor-202ENSMUST00000163929 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm13575-201ENSMUST00000142353 1520 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Olfr378-201ENSMUST00000069790 1508 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm19950-204ENSMUST00000208167 4196 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Naalad2-207ENSMUST00000172171 4066 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm37509-201ENSMUST00000194867 3169 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm37959-201ENSMUST00000191700 2897 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 1700061I17Rik-201ENSMUST00000029642 1962 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 3110043O21Rik-202ENSMUST00000108126 2644 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm14412-201ENSMUST00000108959 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Olfr584-202ENSMUST00000214215 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm14677-201ENSMUST00000117866 486 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm14293-201ENSMUST00000118528 577 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm11313-201ENSMUST00000118779 432 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm15034-201ENSMUST00000120043 349 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm12293-201ENSMUST00000121898 590 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm15335-201ENSMUST00000122442 411 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm26372-201ENSMUST00000157831 236 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm22116-201ENSMUST00000158791 141 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm6808-201ENSMUST00000162341 807 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm7316-201ENSMUST00000165395 445 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm17044-201ENSMUST00000168549 828 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm20648-201ENSMUST00000175815 328 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm25598-201ENSMUST00000179031 107 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Rpl23a-ps12-201ENSMUST00000179178 468 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Snhg5-202ENSMUST00000182232 781 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm27036-201ENSMUST00000182465 980 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Mir7020-201ENSMUST00000183787 70 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm27522-201ENSMUST00000183949 230 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm20561-201ENSMUST00000188131 292 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm28066-201ENSMUST00000188657 472 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Rpl23a-ps5-201ENSMUST00000194566 466 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Obox4-ps32-201ENSMUST00000196512 537 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm8929-201ENSMUST00000197781 1132 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm31831-202ENSMUST00000198581 278 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm35037-201ENSMUST00000203144 506 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Olfr795-ps1-201ENSMUST00000205245 763 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Abca15-204ENSMUST00000207220 567 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm45400-201ENSMUST00000211603 653 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm36247-201ENSMUST00000211834 285 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm21041-201ENSMUST00000214829 823 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Olfr1115-204ENSMUST00000217196 2109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Olfr638-202ENSMUST00000218325 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm18557-201ENSMUST00000218710 433 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Zfand4-204ENSMUST00000221069 501 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 AC123705.4-203ENSMUST00000221566 380 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 AC154390.1-201ENSMUST00000225629 277 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 AC107369.1-201ENSMUST00000227373 860 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 AC154616.2-201ENSMUST00000227978 398 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Vmn1r225-201ENSMUST00000061660 897 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Olfr682-ps1-201ENSMUST00000071242 934 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Olfr871-201ENSMUST00000073122 1147 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm10717-201ENSMUST00000075573 684 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Mucl1-201ENSMUST00000078842 621 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 n-R5s168-201ENSMUST00000083948 104 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Cdk14-203ENSMUST00000115451 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Vmn1r210-203ENSMUST00000226294 3500 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Olfr224-202ENSMUST00000215322 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Psg27-201ENSMUST00000094794 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Ryr3-202ENSMUST00000091818 15410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Pik3c2g-202ENSMUST00000087657 3303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Olfr1166-201ENSMUST00000099833 1628 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Trim12a-201ENSMUST00000070943 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Rbm46os-201ENSMUST00000131274 3261 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 AC155255.1-201ENSMUST00000218751 1428 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm8979-201ENSMUST00000183386 7296 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Dcun1d1-203ENSMUST00000178098 4434 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Olfr698-204ENSMUST00000216255 4024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Olfr1080-201ENSMUST00000213185 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Clec4a1-201ENSMUST00000060484 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Impg1-201ENSMUST00000085289 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm44209-201ENSMUST00000204556 4153 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Cc2d2b-203ENSMUST00000207801 3730 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Olfr1263-202ENSMUST00000214382 4400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Nipal1-201ENSMUST00000087212 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 1700017N19Rik-204ENSMUST00000188736 1709 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Olfr970-203ENSMUST00000215922 1739 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Vmn1r10-202ENSMUST00000228270 2084 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm26582-201ENSMUST00000181481 3135 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Btf3l4-202ENSMUST00000102740 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm23133-201ENSMUST00000104255 135 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm8424-201ENSMUST00000117716 988 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm11512-201ENSMUST00000119669 663 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Vmn1r-ps107-201ENSMUST00000121458 581 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm11254-201ENSMUST00000122368 653 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm22959-201ENSMUST00000122514 303 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm23867-201ENSMUST00000122649 274 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm25290-201ENSMUST00000122796 144 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 C030037D09Rik-201ENSMUST00000125967 367 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
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