Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 1700126G02Rik-201ENSMUST00000204351 725 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Abcf3Q8K268 Gm44972-201ENSMUST00000206419 406 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Abcf3Q8K268 Gm32817-201ENSMUST00000210007 689 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Abcf3Q8K268 Gm45660-201ENSMUST00000210267 151 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Abcf3Q8K268 Gm45686-202ENSMUST00000211580 1138 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Abcf3Q8K268 Olfr858-ps1-201ENSMUST00000212591 930 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Abcf3Q8K268 Gm30676-201ENSMUST00000214000 1165 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Abcf3Q8K268 Gm39363-201ENSMUST00000214251 723 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Abcf3Q8K268 2900078I11Rik-201ENSMUST00000214556 999 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Abcf3Q8K268 AC153729.2-201ENSMUST00000215166 560 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Abcf3Q8K268 Olfr91-202ENSMUST00000216376 3832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Abcf3Q8K268 Gm32281-202ENSMUST00000217220 691 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Abcf3Q8K268 AC164629.3-201ENSMUST00000219325 611 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Abcf3Q8K268 AC153840.1-201ENSMUST00000219685 313 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Abcf3Q8K268 AC101709.1-201ENSMUST00000220276 909 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Abcf3Q8K268 AC154305.3-201ENSMUST00000224661 552 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Abcf3Q8K268 AC134864.1-201ENSMUST00000226326 511 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Abcf3Q8K268 AC166574.3-201ENSMUST00000226725 367 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Abcf3Q8K268 AC192088.3-201ENSMUST00000227858 831 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Abcf3Q8K268 Olfr906-201ENSMUST00000045493 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Abcf3Q8K268 Gm4963-201ENSMUST00000072718 378 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Abcf3Q8K268 Gm23972-201ENSMUST00000083322 165 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Abcf3Q8K268 Olfr1066-201ENSMUST00000099885 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Abcf3Q8K268 Acsm3-202ENSMUST00000106526 2704 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Abcf3Q8K268 AC153959.1-201ENSMUST00000213617 1694 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Abcf3Q8K268 Olfr205-202ENSMUST00000213910 1650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Abcf3Q8K268 Gm45321-201ENSMUST00000209286 2863 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Abcf3Q8K268 9330132A10Rik-201ENSMUST00000059118 3727 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Abcf3Q8K268 Gm37407-201ENSMUST00000194793 1316 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Abcf3Q8K268 Scel-201ENSMUST00000095576 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Abcf3Q8K268 Cdh19-201ENSMUST00000094626 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Abcf3Q8K268 AC156025.1-201ENSMUST00000223597 3551 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Abcf3Q8K268 Gm37412-201ENSMUST00000194866 4321 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Abcf3Q8K268 Ccnb3-202ENSMUST00000115752 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Abcf3Q8K268 Vmn2r4-201ENSMUST00000170280 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Abcf3Q8K268 Gm35191-201ENSMUST00000200925 2475 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Abcf3Q8K268 Prame-201ENSMUST00000033786 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Abcf3Q8K268 Cd226-201ENSMUST00000037142 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Abcf3Q8K268 Zfp300-201ENSMUST00000040667 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Abcf3Q8K268 Gm13582-201ENSMUST00000146034 2655 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Abcf3Q8K268 n-R5s16-201ENSMUST00000104555 119 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Abcf3Q8K268 Ssxb9-201ENSMUST00000115584 879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Abcf3Q8K268 Vmn1r-ps108-201ENSMUST00000117059 365 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Abcf3Q8K268 Gm13890-201ENSMUST00000117578 390 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Abcf3Q8K268 Klra14-ps-201ENSMUST00000119532 802 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Abcf3Q8K268 Gm15745-201ENSMUST00000119807 115 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Abcf3Q8K268 Gm15390-201ENSMUST00000120323 738 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Abcf3Q8K268 Gm14623-201ENSMUST00000121398 603 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Abcf3Q8K268 Gm13508-201ENSMUST00000121639 775 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Abcf3Q8K268 Olfr343-ps1-201ENSMUST00000121883 303 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Abcf3Q8K268 Gm25150-201ENSMUST00000157121 60 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Abcf3Q8K268 Gm16285-201ENSMUST00000162999 347 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Abcf3Q8K268 Gm3173-203ENSMUST00000166848 396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Abcf3Q8K268 Ipcef1-209ENSMUST00000170680 1174 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Abcf3Q8K268 Gm20795-201ENSMUST00000178528 699 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Abcf3Q8K268 Gm26944-201ENSMUST00000182265 633 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Abcf3Q8K268 Snhg14-202ENSMUST00000185693 734 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Abcf3Q8K268 Gm28873-201ENSMUST00000186130 667 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Abcf3Q8K268 Hmgn3-205ENSMUST00000187193 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Abcf3Q8K268 Gm18036-201ENSMUST00000195256 272 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Abcf3Q8K268 BX530055.1-201ENSMUST00000197285 122 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Abcf3Q8K268 Gm43136-201ENSMUST00000200403 636 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Abcf3Q8K268 Gm32453-201ENSMUST00000204183 456 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Abcf3Q8K268 Klk1b23-ps-201ENSMUST00000206347 345 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Abcf3Q8K268 Gm39197-201ENSMUST00000212069 457 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Abcf3Q8K268 AC123835.1-201ENSMUST00000214362 670 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Abcf3Q8K268 Olfr790-204ENSMUST00000218901 1070 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Abcf3Q8K268 1700011B04Rik-211ENSMUST00000222690 394 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Abcf3Q8K268 AC164315.1-201ENSMUST00000226452 708 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Abcf3Q8K268 Vmn1r39-202ENSMUST00000226783 918 ntAPPRIS P2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Abcf3Q8K268 Olfr790-201ENSMUST00000056002 1070 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Abcf3Q8K268 Olfr469-201ENSMUST00000075704 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Abcf3Q8K268 Olfr99-201ENSMUST00000077585 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Abcf3Q8K268 Spink12-201ENSMUST00000081271 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Abcf3Q8K268 Gm8724-201ENSMUST00000081668 483 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Abcf3Q8K268 Mir215-201ENSMUST00000083628 112 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Abcf3Q8K268 n-R5s170-201ENSMUST00000083726 113 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Abcf3Q8K268 Gm25187-201ENSMUST00000083906 133 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Abcf3Q8K268 Fam24a-201ENSMUST00000084505 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Abcf3Q8K268 Ipcef1-202ENSMUST00000086896 1196 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Abcf3Q8K268 Gm10801-201ENSMUST00000099684 504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Abcf3Q8K268 Lin28b-201ENSMUST00000079390 5402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Abcf3Q8K268 Vmn1r209-202ENSMUST00000227038 6461 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Abcf3Q8K268 Olfr1406-203ENSMUST00000215878 3149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Abcf3Q8K268 Gm44321-201ENSMUST00000204262 2855 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Abcf3Q8K268 Scaper-205ENSMUST00000217647 4370 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Abcf3Q8K268 Gm19744-204ENSMUST00000188936 4533 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Abcf3Q8K268 Pax6os1-202ENSMUST00000149133 1464 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Abcf3Q8K268 Ptprc-203ENSMUST00000182283 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Abcf3Q8K268 Mmp1a-201ENSMUST00000034492 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Abcf3Q8K268 Gm29048-202ENSMUST00000190399 1601 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Abcf3Q8K268 Olfr1242-204ENSMUST00000216001 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Abcf3Q8K268 9630002D21Rik-202ENSMUST00000222033 2345 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Abcf3Q8K268 Gm37747-201ENSMUST00000193717 4003 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Abcf3Q8K268 Elavl4-206ENSMUST00000106601 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Abcf3Q8K268 Slfn8-202ENSMUST00000092838 3529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Abcf3Q8K268 Mir706-201ENSMUST00000102262 84 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Abcf3Q8K268 Mir147-201ENSMUST00000102354 79 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Abcf3Q8K268 Gm25419-201ENSMUST00000104215 191 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Abcf3Q8K268 Znrd1-201ENSMUST00000113669 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85 ms