Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Gm19739-201ENSMUST00000195941 153 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 4921527H02Rik-202ENSMUST00000196005 947 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 Gm43470-201ENSMUST00000196175 454 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 Olfr1364-202ENSMUST00000206526 2938 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 Gm38590-202ENSMUST00000210654 1803 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 AC131677.1-201ENSMUST00000218721 535 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 AC134528.1-201ENSMUST00000219156 387 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 AC091764.3-201ENSMUST00000219646 300 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 Cd96-201ENSMUST00000023336 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 Ifi205-201ENSMUST00000059226 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 Olfr371-201ENSMUST00000070849 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 Tas2r123-201ENSMUST00000071696 1002 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 Zfhx4-203ENSMUST00000175866 11287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 Gm7903-202ENSMUST00000179953 3519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 Slco1a6-201ENSMUST00000111827 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 Ppp1r1c-202ENSMUST00000090760 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 Vmn1r196-205ENSMUST00000228557 5790 ntAPPRIS P2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 Vmn2r44-201ENSMUST00000166499 3660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 Rabgap1-203ENSMUST00000112920 4847 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 Gm26994-201ENSMUST00000182027 1571 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 Gm28969-205ENSMUST00000186757 1581 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 Zfp932-207ENSMUST00000187241 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 Gm28990-204ENSMUST00000189255 1581 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 Gm28677-209ENSMUST00000190010 1581 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 Pou2f1-205ENSMUST00000111427 13050 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 Gm12057-201ENSMUST00000117244 1427 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 Hrh2-202ENSMUST00000209846 4074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 Gm15175-201ENSMUST00000117629 132 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 Zfp389-201ENSMUST00000118425 675 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 Gm11843-201ENSMUST00000118984 425 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 Gm12891-201ENSMUST00000119358 240 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 Gm12074-201ENSMUST00000120189 219 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 4930448K20Rik-201ENSMUST00000120570 998 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 Gm14808-201ENSMUST00000129259 361 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 Gm24767-201ENSMUST00000158509 95 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 A730017C20Rik-206ENSMUST00000175830 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 Gm19932-201ENSMUST00000177033 313 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 Gm26824-201ENSMUST00000180506 1164 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 Gm28179-202ENSMUST00000189029 327 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 Gm29341-201ENSMUST00000190179 370 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 Gm28532-201ENSMUST00000190408 572 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 Gm44316-201ENSMUST00000199274 97 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 Gm44040-201ENSMUST00000203360 545 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 Gm30928-201ENSMUST00000205858 459 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 Gm45082-201ENSMUST00000206082 601 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 Gm2628-201ENSMUST00000218019 426 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 AC124445.1-201ENSMUST00000218613 452 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 AC153943.1-201ENSMUST00000219312 256 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 AC160120.1-201ENSMUST00000227446 663 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 Magea1-201ENSMUST00000078193 1108 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 Skint11-201ENSMUST00000079915 820 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 Klk1b9-201ENSMUST00000081399 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 Vmn1r218-205ENSMUST00000227741 9624 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 Olfr204-202ENSMUST00000216261 5371 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 Zbed6-201ENSMUST00000190574 5007 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 Gm10220-201ENSMUST00000088236 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 Gm45426-201ENSMUST00000209393 3672 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 Oog4-202ENSMUST00000073641 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 Asxl3-202ENSMUST00000120223 11485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 AC158605.3-201ENSMUST00000218999 2538 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 Olfr1065-201ENSMUST00000213789 2154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 Zfp426-203ENSMUST00000163348 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 Rsrc2-203ENSMUST00000111515 4223 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 Olfr822-202ENSMUST00000216879 2663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 A330087D11Rik-201ENSMUST00000187265 1334 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 Wap-201ENSMUST00000102910 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 Igkv8-18-201ENSMUST00000103390 395 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 Iglv2-201ENSMUST00000103752 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 Nectin3-204ENSMUST00000119941 529 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 Gm14883-201ENSMUST00000120179 157 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 Gm7071-201ENSMUST00000120458 462 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 2810403D21Rik-203ENSMUST00000131640 546 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 Olfr296-ps1-201ENSMUST00000173904 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 Gm20545-201ENSMUST00000174739 210 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 Gm26318-201ENSMUST00000176507 96 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 Mir6539-201ENSMUST00000183732 110 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 Gm43142-201ENSMUST00000198670 361 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 Gm36017-201ENSMUST00000199005 923 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 Gm42896-201ENSMUST00000201249 1113 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 Gm44048-201ENSMUST00000204531 361 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 Gm45427-201ENSMUST00000209572 1253 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 Gm3565-201ENSMUST00000222670 609 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 AC113269.1-201ENSMUST00000227185 674 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 Bcl2a1c-201ENSMUST00000066460 444 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 Gm10064-201ENSMUST00000071235 399 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 Gm25079-201ENSMUST00000082529 203 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 Gm18757-201ENSMUST00000207938 3141 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 AC163731.1-201ENSMUST00000225696 3118 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 Slc12a6-203ENSMUST00000110987 3722 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 Fancd2-201ENSMUST00000036340 5512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 9830132P13Rik-201ENSMUST00000198240 4187 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 Gm3115-201ENSMUST00000166928 1797 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 Gm3182-201ENSMUST00000167902 1753 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 Gm2888-201ENSMUST00000170521 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 Gm7876-202ENSMUST00000171305 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 Gm3127-202ENSMUST00000171866 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 4930532I03Rik-201ENSMUST00000218463 1724 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 C530043A13Rik-203ENSMUST00000189247 3364 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 Olfr122-204ENSMUST00000217119 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 Serpina3b-201ENSMUST00000085052 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98 ms