Protein–RNA interactions for Protein: Q3USL1

Klhdc9, Kelch domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc9Q3USL1 Csn1s2a-202ENSMUST00000196585 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Klhdc9Q3USL1 1700016F12Rik-201ENSMUST00000198159 655 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Klhdc9Q3USL1 Gm44463-201ENSMUST00000198895 137 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Klhdc9Q3USL1 Klrb1b-204ENSMUST00000205130 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Klhdc9Q3USL1 Gm3189-201ENSMUST00000205595 832 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Klhdc9Q3USL1 Gm44615-201ENSMUST00000206548 358 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Klhdc9Q3USL1 RMST_1.1-204ENSMUST00000217871 699 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Klhdc9Q3USL1 Olfr1496-203ENSMUST00000219412 1067 ntAPPRIS P2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Klhdc9Q3USL1 Gm30893-201ENSMUST00000220479 903 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Klhdc9Q3USL1 AC122448.1-201ENSMUST00000226317 772 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Klhdc9Q3USL1 AC160756.1-201ENSMUST00000227266 235 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Klhdc9Q3USL1 AC134335.1-201ENSMUST00000227626 329 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Klhdc9Q3USL1 Olfr1496-201ENSMUST00000057390 1067 ntAPPRIS ALT1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Klhdc9Q3USL1 Olfr851-201ENSMUST00000064582 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Klhdc9Q3USL1 Sprr2e-201ENSMUST00000068399 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Klhdc9Q3USL1 Csn1s2a-201ENSMUST00000076379 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Klhdc9Q3USL1 Olfr1090-201ENSMUST00000099875 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Klhdc9Q3USL1 Olfr396-ps1-201ENSMUST00000143750 1675 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Klhdc9Q3USL1 AC153964.1-201ENSMUST00000219677 3142 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Klhdc9Q3USL1 Gm38253-201ENSMUST00000194058 4678 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Klhdc9Q3USL1 Olfr1196-202ENSMUST00000216928 4270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Klhdc9Q3USL1 Btbd35f12-201ENSMUST00000178827 1908 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Klhdc9Q3USL1 Olfr470-203ENSMUST00000220193 3080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Klhdc9Q3USL1 Gm20449-201ENSMUST00000094532 3847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Klhdc9Q3USL1 Abcg3-202ENSMUST00000130644 2668 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Klhdc9Q3USL1 Rnf128-202ENSMUST00000113027 2641 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Klhdc9Q3USL1 Dnah8-201ENSMUST00000170651 14583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Klhdc9Q3USL1 Vmn1r6-205ENSMUST00000227631 7805 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Klhdc9Q3USL1 Gm42946-201ENSMUST00000196108 2570 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Klhdc9Q3USL1 Olfr1273-ps-201ENSMUST00000214356 4698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Klhdc9Q3USL1 Mga-201ENSMUST00000046717 11982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Klhdc9Q3USL1 Gm44587-201ENSMUST00000207399 1685 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Klhdc9Q3USL1 Pbrm1-201ENSMUST00000022471 5871 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Klhdc9Q3USL1 Zfp935-201ENSMUST00000076195 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Klhdc9Q3USL1 Gm38057-201ENSMUST00000195551 3203 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Klhdc9Q3USL1 Gm8660-201ENSMUST00000105187 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Klhdc9Q3USL1 Gm4177-201ENSMUST00000105196 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Klhdc9Q3USL1 Vmn1r127-201ENSMUST00000105199 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Klhdc9Q3USL1 Gm5728-201ENSMUST00000105209 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Klhdc9Q3USL1 Gm13567-201ENSMUST00000118026 247 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Klhdc9Q3USL1 Gm13550-201ENSMUST00000118185 525 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Klhdc9Q3USL1 Gm14599-201ENSMUST00000120469 474 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Klhdc9Q3USL1 Gm11233-201ENSMUST00000122357 634 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Klhdc9Q3USL1 Gm8200-201ENSMUST00000122390 222 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Klhdc9Q3USL1 Gm22204-201ENSMUST00000122654 327 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Klhdc9Q3USL1 Vmn1r94-201ENSMUST00000164526 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Klhdc9Q3USL1 Gm4216-201ENSMUST00000168926 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Klhdc9Q3USL1 Cep41-210ENSMUST00000169422 438 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Klhdc9Q3USL1 Vmn1r142-201ENSMUST00000169697 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Klhdc9Q3USL1 Olfr772-201ENSMUST00000169800 1004 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Klhdc9Q3USL1 Vmn2r-ps10-201ENSMUST00000176836 898 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Klhdc9Q3USL1 Vmn2r-ps8-201ENSMUST00000177088 898 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Klhdc9Q3USL1 Gm8890-202ENSMUST00000177727 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Klhdc9Q3USL1 Gm28149-201ENSMUST00000187102 378 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Klhdc9Q3USL1 Galntl6-205ENSMUST00000188531 1056 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Klhdc9Q3USL1 Gm28768-201ENSMUST00000189034 378 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Klhdc9Q3USL1 Gm29133-201ENSMUST00000189155 885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Klhdc9Q3USL1 Gm4035-201ENSMUST00000189445 399 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Klhdc9Q3USL1 Ikzf2-209ENSMUST00000191262 1146 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Klhdc9Q3USL1 Gm37708-201ENSMUST00000192337 895 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Klhdc9Q3USL1 Gm37501-201ENSMUST00000192830 691 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Klhdc9Q3USL1 Fasl-202ENSMUST00000193648 406 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Klhdc9Q3USL1 Gm38326-201ENSMUST00000194030 686 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Klhdc9Q3USL1 Gm37577-203ENSMUST00000194712 991 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Klhdc9Q3USL1 Gm3143-201ENSMUST00000196308 580 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Klhdc9Q3USL1 Gm9245-201ENSMUST00000200528 983 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Klhdc9Q3USL1 Klra14-ps-202ENSMUST00000203601 1104 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Klhdc9Q3USL1 Gm44023-201ENSMUST00000203710 469 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Klhdc9Q3USL1 Gm44002-201ENSMUST00000205134 594 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Klhdc9Q3USL1 4930470O06Rik-201ENSMUST00000209438 662 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Klhdc9Q3USL1 Gm36445-205ENSMUST00000211729 1100 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Klhdc9Q3USL1 Il6-201ENSMUST00000026845 1141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Klhdc9Q3USL1 Elavl4-205ENSMUST00000106600 3799 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Klhdc9Q3USL1 Gm43921-201ENSMUST00000204296 1792 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Klhdc9Q3USL1 Ptprq-201ENSMUST00000050702 7393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Klhdc9Q3USL1 Olfr1311-202ENSMUST00000213602 2631 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Klhdc9Q3USL1 Hspd1-ps2-201ENSMUST00000210003 1697 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Klhdc9Q3USL1 Olfr348-203ENSMUST00000214909 3634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Klhdc9Q3USL1 Vmn1r90-202ENSMUST00000226264 7796 ntAPPRIS P2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Klhdc9Q3USL1 Gm42842-201ENSMUST00000197736 3004 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Klhdc9Q3USL1 Gm7451-201ENSMUST00000208382 1392 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Klhdc9Q3USL1 Gm43282-201ENSMUST00000201848 2157 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Klhdc9Q3USL1 Ptprd-203ENSMUST00000098005 4542 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Klhdc9Q3USL1 Gm43164-201ENSMUST00000202529 2128 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Klhdc9Q3USL1 Prune2-201ENSMUST00000087689 12512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Klhdc9Q3USL1 2210418O10Rik-203ENSMUST00000136719 2314 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Klhdc9Q3USL1 Nlrp4f-204ENSMUST00000221659 3551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Klhdc9Q3USL1 Gm26474-201ENSMUST00000116762 122 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Klhdc9Q3USL1 Gm11350-201ENSMUST00000121436 870 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Klhdc9Q3USL1 Gm25292-201ENSMUST00000122797 322 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Klhdc9Q3USL1 4930441J16Rik-201ENSMUST00000153743 516 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Klhdc9Q3USL1 Gm26000-201ENSMUST00000157991 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Klhdc9Q3USL1 Gm16545-201ENSMUST00000161968 463 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Klhdc9Q3USL1 Gm17555-201ENSMUST00000164042 1113 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Klhdc9Q3USL1 Gm25999-201ENSMUST00000175398 133 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Klhdc9Q3USL1 Mrps36-ps3-201ENSMUST00000183899 305 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Klhdc9Q3USL1 Gm27695-201ENSMUST00000184301 91 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Klhdc9Q3USL1 Gm8498-201ENSMUST00000188227 974 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Klhdc9Q3USL1 Gm8790-201ENSMUST00000194108 322 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Klhdc9Q3USL1 Gm7449-201ENSMUST00000194393 663 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.9 ms