Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Gm24931-201ENSMUST00000158324 107 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Gm17153-201ENSMUST00000171314 490 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Vmn1r-ps58-201ENSMUST00000174460 840 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Lipo1-202ENSMUST00000178735 1188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Gm26944-201ENSMUST00000182265 633 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Olfr1055-202ENSMUST00000188023 939 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Q3U6N9 1700027A15Rik-202ENSMUST00000188349 617 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Vmn1r82-202ENSMUST00000191002 918 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Gm6546-201ENSMUST00000192096 766 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Gm20203-201ENSMUST00000192352 332 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Gm37243-201ENSMUST00000193407 595 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Q3U6N9 1700013M08Rik-201ENSMUST00000197709 683 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Q3U6N9 4930539C22Rik-201ENSMUST00000198231 970 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Gm18100-201ENSMUST00000200897 452 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Abca15-204ENSMUST00000207220 567 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Q3U6N9 C030038I04Rik-201ENSMUST00000207840 740 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Gm32916-203ENSMUST00000208033 789 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Gm44919-201ENSMUST00000208587 1073 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Q3U6N9 RMST_1.1-205ENSMUST00000218060 997 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Gm5176-202ENSMUST00000220267 583 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Q3U6N9 AC159244.1-201ENSMUST00000220964 594 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Gm40394-201ENSMUST00000221321 633 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Q3U6N9 AC154248.2-201ENSMUST00000221964 659 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Q3U6N9 4930455B14Rik-204ENSMUST00000224776 848 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Olfr843-201ENSMUST00000061365 1107 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Mir350-201ENSMUST00000083639 99 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Hsf3-205ENSMUST00000179832 1972 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Serpini1-201ENSMUST00000029423 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Vmn2r79-201ENSMUST00000164462 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Gm45129-201ENSMUST00000208444 2224 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Q3U6N9 AC120375.2-201ENSMUST00000226532 1853 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Q3U6N9 CT009733.2-202ENSMUST00000224171 4748 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Zfp780b-204ENSMUST00000206685 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Zfp874b-201ENSMUST00000019572 3744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Fam169a-202ENSMUST00000169863 6013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Gm11674-201ENSMUST00000124855 3005 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Gm28969-205ENSMUST00000186757 1581 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Gm28990-204ENSMUST00000189255 1581 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Gm28677-209ENSMUST00000190010 1581 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Fcrl5-205ENSMUST00000194102 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Q3U6N9 AI987944-201ENSMUST00000071804 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Cntnap5b-201ENSMUST00000086738 4027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Ncoa7-202ENSMUST00000092610 2590 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Gm29048-202ENSMUST00000190399 1601 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Pof1b-201ENSMUST00000039887 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Olfr536-201ENSMUST00000064392 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Q3U6N9 A930017M01Rik-205ENSMUST00000227721 4167 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Q3U6N9 6820402A03Rik-201ENSMUST00000194648 2654 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Gm14403-201ENSMUST00000108940 774 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Fbxo48-202ENSMUST00000109635 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Gm13250-201ENSMUST00000117209 753 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Gm12039-201ENSMUST00000118219 180 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Gm12717-201ENSMUST00000118427 983 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
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Q3U6N9 Gm15168-201ENSMUST00000121057 316 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
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Q3U6N9 A230083N12Rik-201ENSMUST00000126646 572 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Hba-ps4-201ENSMUST00000128900 447 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Gm12925-203ENSMUST00000140510 665 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Q3U6N9 R3hcc1l-202ENSMUST00000160107 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
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Q3U6N9 Vdac2-208ENSMUST00000172727 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
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Q3U6N9 Tceanc-203ENSMUST00000180322 1080 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Gm8614-201ENSMUST00000182528 978 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Gm26950-201ENSMUST00000182734 498 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Gm4707-202ENSMUST00000183937 276 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
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Q3U6N9 Gm8599-201ENSMUST00000193033 457 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Gm18752-202ENSMUST00000193627 587 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
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Q3U6N9 Mirlet7e-201ENSMUST00000196737 93 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
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Q3U6N9 Gm44332-201ENSMUST00000203712 433 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
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Q3U6N9 Gm5373-201ENSMUST00000212113 1050 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Gm18585-201ENSMUST00000215197 556 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Aoah-202ENSMUST00000221982 919 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Q3U6N9 AC154623.1-201ENSMUST00000224348 805 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Q3U6N9 AC170999.2-201ENSMUST00000226223 264 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Q3U6N9 AC139758.1-201ENSMUST00000226573 930 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Olfr850-201ENSMUST00000077347 948 ntAPPRIS P2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Olfr611-201ENSMUST00000078108 972 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Gm5458-201ENSMUST00000096121 997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Fat1-206ENSMUST00000215588 13938 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Mlip-205ENSMUST00000183955 3069 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Pbrm1-201ENSMUST00000022471 5871 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Gm35256-201ENSMUST00000212780 3269 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Q3U6N9 AC153881.3-201ENSMUST00000218494 1561 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Olfr1217-202ENSMUST00000213669 3839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Cd226-201ENSMUST00000037142 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Zscan4c-201ENSMUST00000131379 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Tsga10-203ENSMUST00000114902 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Prr11-201ENSMUST00000051395 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Vmn1r175-202ENSMUST00000228383 2878 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Q3U6N9 BC003331-204ENSMUST00000097547 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Muc15-202ENSMUST00000111016 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Olfr741-202ENSMUST00000205518 3406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
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