Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Prl2c5-202ENSMUST00000126540 971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11583-201ENSMUST00000132296 466 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccndbp1Q3TVC7 1700036O09Rik-201ENSMUST00000136834 349 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15687-201ENSMUST00000141440 269 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccndbp1Q3TVC7 Snrpe-201ENSMUST00000164096 669 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccndbp1Q3TVC7 Gm3221-201ENSMUST00000164869 440 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccndbp1Q3TVC7 Vmn2r-ps80-201ENSMUST00000173697 914 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccndbp1Q3TVC7 Vmn1r-ps142-201ENSMUST00000175707 852 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccndbp1Q3TVC7 Vmn1r-ps24-201ENSMUST00000175772 900 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccndbp1Q3TVC7 Gm22991-201ENSMUST00000178126 121 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccndbp1Q3TVC7 Gm25754-201ENSMUST00000178653 121 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccndbp1Q3TVC7 Gm22419-201ENSMUST00000178780 121 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccndbp1Q3TVC7 Gm24802-201ENSMUST00000178897 121 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccndbp1Q3TVC7 Gm23145-201ENSMUST00000178912 79 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccndbp1Q3TVC7 Gm25208-201ENSMUST00000178964 121 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccndbp1Q3TVC7 Gm24567-201ENSMUST00000179294 121 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccndbp1Q3TVC7 Gm23943-201ENSMUST00000179712 121 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccndbp1Q3TVC7 Gm25228-201ENSMUST00000180121 121 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccndbp1Q3TVC7 Gm23304-201ENSMUST00000180209 121 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccndbp1Q3TVC7 Gm27976-201ENSMUST00000183635 162 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccndbp1Q3TVC7 Mir7687-201ENSMUST00000184722 59 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccndbp1Q3TVC7 4930598F16Rik-201ENSMUST00000187352 761 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28468-201ENSMUST00000188536 615 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccndbp1Q3TVC7 Gm38149-201ENSMUST00000191943 339 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7496-201ENSMUST00000192573 1034 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccndbp1Q3TVC7 4933438B17Rik-202ENSMUST00000196374 576 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccndbp1Q3TVC7 Gm42459-201ENSMUST00000199679 742 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccndbp1Q3TVC7 Gm36520-201ENSMUST00000200449 400 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccndbp1Q3TVC7 Bc1-ps1-201ENSMUST00000208471 318 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44622-201ENSMUST00000209128 1033 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccndbp1Q3TVC7 AC137127.3-201ENSMUST00000213340 349 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccndbp1Q3TVC7 AC122332.1-201ENSMUST00000214384 285 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccndbp1Q3TVC7 1700025K04Rik-201ENSMUST00000218075 1174 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccndbp1Q3TVC7 AC125484.1-201ENSMUST00000223218 234 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccndbp1Q3TVC7 AC113031.2-201ENSMUST00000226132 579 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccndbp1Q3TVC7 AC140209.1-204ENSMUST00000226736 739 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7257-201ENSMUST00000041537 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccndbp1Q3TVC7 Tmed11-201ENSMUST00000004943 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccndbp1Q3TVC7 Mir218-2-201ENSMUST00000083649 110 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccndbp1Q3TVC7 H2-M9-201ENSMUST00000087165 1125 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccndbp1Q3TVC7 Vmn2r112-201ENSMUST00000097381 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr1131-203ENSMUST00000216756 1459 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26522-201ENSMUST00000181565 1555 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13961-201ENSMUST00000119282 4772 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccndbp1Q3TVC7 Vmn1r87-203ENSMUST00000227443 5319 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccndbp1Q3TVC7 Platr21-201ENSMUST00000126339 3511 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccndbp1Q3TVC7 Lrrtm4-202ENSMUST00000126005 3733 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccndbp1Q3TVC7 Phf11d-201ENSMUST00000095157 2666 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr1163-202ENSMUST00000215268 1611 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccndbp1Q3TVC7 Scn9a-207ENSMUST00000169900 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccndbp1Q3TVC7 Cdh10-202ENSMUST00000166873 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr874-202ENSMUST00000216982 2632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr984-202ENSMUST00000213858 5186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccndbp1Q3TVC7 Prune2-201ENSMUST00000087689 12512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccndbp1Q3TVC7 Traj7-201ENSMUST00000103733 59 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccndbp1Q3TVC7 Gm25919-201ENSMUST00000104271 132 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccndbp1Q3TVC7 Hikeshi-203ENSMUST00000117354 297 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11984-201ENSMUST00000118142 766 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12717-201ENSMUST00000118427 983 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12820-201ENSMUST00000119233 342 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11357-201ENSMUST00000119758 954 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16463-201ENSMUST00000120527 721 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13533-201ENSMUST00000121104 177 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccndbp1Q3TVC7 Defa-ps14-201ENSMUST00000121373 418 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccndbp1Q3TVC7 Gm24371-201ENSMUST00000122662 267 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
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Ccndbp1Q3TVC7 Ear-ps9-201ENSMUST00000161963 460 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
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Ccndbp1Q3TVC7 Trav7-3-201ENSMUST00000177622 402 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5473-201ENSMUST00000179326 642 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26731-201ENSMUST00000180683 543 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccndbp1Q3TVC7 Gm18828-202ENSMUST00000181035 310 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccndbp1Q3TVC7 Gm4258-201ENSMUST00000182127 506 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
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Ccndbp1Q3TVC7 D530049I02Rik-201ENSMUST00000186582 562 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37421-201ENSMUST00000193088 132 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43301-201ENSMUST00000198918 778 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccndbp1Q3TVC7 Gm2623-201ENSMUST00000199229 286 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccndbp1Q3TVC7 Gm19708-201ENSMUST00000199386 543 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43554-201ENSMUST00000199987 186 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccndbp1Q3TVC7 4930528H21Rik-201ENSMUST00000204264 495 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccndbp1Q3TVC7 Gm18468-201ENSMUST00000207321 369 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccndbp1Q3TVC7 Gm18470-201ENSMUST00000207467 420 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccndbp1Q3TVC7 Gm18465-201ENSMUST00000207468 369 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccndbp1Q3TVC7 Gm18464-201ENSMUST00000207803 420 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccndbp1Q3TVC7 Gm18458-201ENSMUST00000207908 369 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccndbp1Q3TVC7 Gm18461-201ENSMUST00000208421 420 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44919-201ENSMUST00000208587 1073 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr654-202ENSMUST00000210457 1156 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccndbp1Q3TVC7 AL603630.1-201ENSMUST00000214781 147 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccndbp1Q3TVC7 Gm19181-201ENSMUST00000218891 940 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccndbp1Q3TVC7 Fam228b-208ENSMUST00000219898 288 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccndbp1Q3TVC7 AC154552.2-201ENSMUST00000223117 794 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccndbp1Q3TVC7 AC154576.2-203ENSMUST00000224736 253 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccndbp1Q3TVC7 AC154727.1-201ENSMUST00000226537 499 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 196.1 ms