Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Sval3-201ENSMUST00000080742 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Usp39Q3TIX9 Rpl29-ps2-201ENSMUST00000086508 478 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Usp39Q3TIX9 AW112010-201ENSMUST00000099676 770 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Usp39Q3TIX9 Olfr1162-201ENSMUST00000099837 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Usp39Q3TIX9 Sdr16c6-202ENSMUST00000108383 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Usp39Q3TIX9 Gm44751-201ENSMUST00000208302 4387 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Usp39Q3TIX9 Gm44801-201ENSMUST00000207644 2060 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Usp39Q3TIX9 Ints12-201ENSMUST00000029650 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Usp39Q3TIX9 Gm9923-201ENSMUST00000217785 1836 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Usp39Q3TIX9 Nlrp1b-202ENSMUST00000108514 3541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Usp39Q3TIX9 Gm37212-201ENSMUST00000192582 3650 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Usp39Q3TIX9 Gm28178-201ENSMUST00000188544 2943 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Usp39Q3TIX9 Atp1b4-202ENSMUST00000115134 4189 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp39Q3TIX9 Il31ra-201ENSMUST00000051756 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp39Q3TIX9 Olfr920-201ENSMUST00000074740 5711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp39Q3TIX9 Vmn1r43-204ENSMUST00000226983 12805 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp39Q3TIX9 Acer3-201ENSMUST00000033020 11340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp39Q3TIX9 Ccar1-201ENSMUST00000020268 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp39Q3TIX9 Gm13648-201ENSMUST00000138361 1536 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp39Q3TIX9 4930509J09Rik-201ENSMUST00000194514 1526 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp39Q3TIX9 Olfr826-202ENSMUST00000203720 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp39Q3TIX9 Galnt1-208ENSMUST00000178605 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp39Q3TIX9 Fbxl13-201ENSMUST00000051358 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp39Q3TIX9 Olfr1480-202ENSMUST00000207093 1819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp39Q3TIX9 Gm3636-201ENSMUST00000100904 519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp39Q3TIX9 Lipe-203ENSMUST00000105177 1251 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp39Q3TIX9 Rps15a-201ENSMUST00000106588 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp39Q3TIX9 Sult2a5-201ENSMUST00000108525 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp39Q3TIX9 Defb42-202ENSMUST00000111203 567 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp39Q3TIX9 Gm3173-201ENSMUST00000112776 519 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp39Q3TIX9 Gm15108-201ENSMUST00000116160 803 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp39Q3TIX9 Gm11913-201ENSMUST00000119094 336 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp39Q3TIX9 Gm14725-201ENSMUST00000120324 828 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp39Q3TIX9 Gm14125-202ENSMUST00000120921 756 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp39Q3TIX9 Gm12413-201ENSMUST00000121508 312 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp39Q3TIX9 Gm15367-201ENSMUST00000122398 1016 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp39Q3TIX9 St8sia3os-201ENSMUST00000123473 652 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp39Q3TIX9 Gm26350-201ENSMUST00000157531 288 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp39Q3TIX9 Gm24186-201ENSMUST00000157983 127 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp39Q3TIX9 Gm23774-201ENSMUST00000158990 131 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp39Q3TIX9 Gm3173-202ENSMUST00000164603 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp39Q3TIX9 Gstm5-202ENSMUST00000167387 599 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp39Q3TIX9 Gm26092-201ENSMUST00000179798 97 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp39Q3TIX9 Tmsb15b2-202ENSMUST00000180194 243 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp39Q3TIX9 Mir669a-1-201ENSMUST00000180238 97 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp39Q3TIX9 Pafah1b1-ps1-201ENSMUST00000181263 1046 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp39Q3TIX9 Gm27007-201ENSMUST00000183264 279 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp39Q3TIX9 Gm27754-201ENSMUST00000183340 126 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp39Q3TIX9 Gm28560-201ENSMUST00000186091 315 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp39Q3TIX9 Gm28871-201ENSMUST00000186191 687 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp39Q3TIX9 Gm28334-201ENSMUST00000186653 315 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp39Q3TIX9 Gm28526-201ENSMUST00000187731 419 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp39Q3TIX9 Gm20561-201ENSMUST00000188131 292 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp39Q3TIX9 Gm28495-201ENSMUST00000188452 315 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp39Q3TIX9 Gm28232-201ENSMUST00000188683 315 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp39Q3TIX9 Gm21803-201ENSMUST00000188897 693 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp39Q3TIX9 Gm28481-201ENSMUST00000189231 315 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp39Q3TIX9 Gm28567-201ENSMUST00000190270 693 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp39Q3TIX9 1700084F23Rik-205ENSMUST00000191362 743 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp39Q3TIX9 Gm29059-201ENSMUST00000191534 315 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp39Q3TIX9 Gm37765-201ENSMUST00000192395 315 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp39Q3TIX9 Gm37237-201ENSMUST00000192893 315 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp39Q3TIX9 Gm37044-201ENSMUST00000193531 693 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp39Q3TIX9 Gm36968-201ENSMUST00000193737 315 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp39Q3TIX9 Gm38369-201ENSMUST00000195101 693 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp39Q3TIX9 Gm38290-201ENSMUST00000195238 315 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp39Q3TIX9 Gm18036-201ENSMUST00000195256 272 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp39Q3TIX9 Obox4-ps5-201ENSMUST00000196368 397 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp39Q3TIX9 Gm43078-201ENSMUST00000197222 168 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp39Q3TIX9 Obox4-ps10-201ENSMUST00000199376 504 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp39Q3TIX9 Olfr442-ps1-201ENSMUST00000204261 316 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp39Q3TIX9 Gm33626-201ENSMUST00000206790 828 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp39Q3TIX9 AC145736.1-201ENSMUST00000214661 479 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp39Q3TIX9 AC139376.1-201ENSMUST00000220056 1250 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp39Q3TIX9 CT030238.4-203ENSMUST00000227343 836 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp39Q3TIX9 CT030238.4-201ENSMUST00000228579 801 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp39Q3TIX9 Mbd3l1-201ENSMUST00000069218 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp39Q3TIX9 Ear6-201ENSMUST00000074477 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp39Q3TIX9 Mir331-201ENSMUST00000083673 96 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp39Q3TIX9 n-R5s46-201ENSMUST00000083960 116 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp39Q3TIX9 Gria2-201ENSMUST00000075316 10371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp39Q3TIX9 Olfr1224-ps1-204ENSMUST00000216833 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp39Q3TIX9 Ttn-202ENSMUST00000099980 16891 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp39Q3TIX9 Cdh10-202ENSMUST00000166873 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp39Q3TIX9 Obscn-202ENSMUST00000047441 24175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp39Q3TIX9 Clca3a1-202ENSMUST00000059091 3524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp39Q3TIX9 AC120153.1-201ENSMUST00000226502 1311 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp39Q3TIX9 5830405F06Rik-201ENSMUST00000192753 1755 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp39Q3TIX9 Kif2a-201ENSMUST00000022204 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Usp39Q3TIX9 Nlrp5-202ENSMUST00000086341 3471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Usp39Q3TIX9 Olfr584-202ENSMUST00000214215 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Usp39Q3TIX9 Vmn2r124-201ENSMUST00000176802 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Usp39Q3TIX9 Far2-202ENSMUST00000111607 3395 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Usp39Q3TIX9 AC102847.2-201ENSMUST00000227799 2906 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Usp39Q3TIX9 Gm13961-201ENSMUST00000119282 4772 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Usp39Q3TIX9 Gm9577-201ENSMUST00000174655 2620 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Usp39Q3TIX9 Steap2-209ENSMUST00000164219 10089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Usp39Q3TIX9 Zfp763-201ENSMUST00000087654 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Usp39Q3TIX9 Gm37311-201ENSMUST00000195541 2024 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Usp39Q3TIX9 Lrrc4c-203ENSMUST00000162807 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
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