Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Gm9480-201ENSMUST00000198038 616 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Gm43675-201ENSMUST00000199468 1184 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Sult1c2-ps1-201ENSMUST00000200231 164 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Gm7039-201ENSMUST00000205138 346 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Gm45427-201ENSMUST00000209572 1253 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Gm6850-201ENSMUST00000210031 530 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Sult2a7-203ENSMUST00000210034 870 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 AC159297.1-201ENSMUST00000218689 290 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 CT010498.1-201ENSMUST00000225382 546 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 S100g-201ENSMUST00000038769 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Mir412-201ENSMUST00000083636 80 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Spint3-201ENSMUST00000099097 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Ereg-201ENSMUST00000031324 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Fat4-201ENSMUST00000061260 16109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Naip3-201ENSMUST00000118082 4208 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Mug2-201ENSMUST00000081777 4579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Gm37076-201ENSMUST00000192033 2294 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Gm8267-203ENSMUST00000226900 1592 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Gm20449-201ENSMUST00000094532 3847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Rapgef6-204ENSMUST00000108894 3475 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Gm37482-201ENSMUST00000194899 2791 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Vmn2r-ps123-201ENSMUST00000176763 2410 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 4930532I03Rik-201ENSMUST00000218463 1724 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Toporsl-201ENSMUST00000029995 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Wdr17-202ENSMUST00000127511 4668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Ing3-201ENSMUST00000031680 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Ankrd34c-201ENSMUST00000060700 5457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Vmn1r44-205ENSMUST00000226345 1965 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
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ptchd1Q14B62 Cep57l1-202ENSMUST00000105505 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Izumo3-201ENSMUST00000107108 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 4930402F06Rik-201ENSMUST00000113009 1150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
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ptchd1Q14B62 Gm23867-201ENSMUST00000122649 274 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Gm25227-201ENSMUST00000158204 112 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Gm26468-201ENSMUST00000158644 106 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
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ptchd1Q14B62 Gm5527-201ENSMUST00000179821 642 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 1700063H06Rik-201ENSMUST00000183678 445 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
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ptchd1Q14B62 Gm43779-201ENSMUST00000196691 829 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Gm42539-201ENSMUST00000197009 308 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Gm43215-201ENSMUST00000199108 252 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Gm29848-201ENSMUST00000203107 295 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
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ptchd1Q14B62 Gm5735-201ENSMUST00000207053 167 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
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ptchd1Q14B62 Clec4a1-201ENSMUST00000060484 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
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ptchd1Q14B62 Slfn4-201ENSMUST00000000208 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Kcnrg-202ENSMUST00000225582 1821 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Gm43469-201ENSMUST00000196084 4634 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Gm43891-201ENSMUST00000205132 3112 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 AC115289.2-201ENSMUST00000223836 2803 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Sh2d1b1-201ENSMUST00000179976 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
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ptchd1Q14B62 Psg27-201ENSMUST00000094794 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 D830032E09Rik-202ENSMUST00000189497 1632 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
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ptchd1Q14B62 Gm2026-202ENSMUST00000109008 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Gm4724-202ENSMUST00000109046 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Gm4631-201ENSMUST00000109050 1494 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Gm14434-203ENSMUST00000122097 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Gm11007-202ENSMUST00000178120 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Gm2007-202ENSMUST00000178133 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Gm11007-203ENSMUST00000185834 1494 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Gm2007-203ENSMUST00000189494 1494 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Fbxw15-201ENSMUST00000056745 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Mcf2-201ENSMUST00000033478 3659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Mecom-204ENSMUST00000166001 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Ptprj-202ENSMUST00000111495 4197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Gm28969-205ENSMUST00000186757 1581 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
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