Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 AL670757.1-201ENSMUST00000223668 1959 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 A830019P07Rik-201ENSMUST00000178904 1777 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Gm36388-201ENSMUST00000191663 1675 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Gm5949-201ENSMUST00000213468 1421 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Olfr1278-205ENSMUST00000215210 6901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Gm22714-201ENSMUST00000116894 78 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Gm22276-201ENSMUST00000122469 129 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Gm23213-201ENSMUST00000122715 313 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Gm12122-201ENSMUST00000124503 454 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Gm14216-201ENSMUST00000136046 409 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Gm13291-201ENSMUST00000143527 655 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Gm25454-201ENSMUST00000157947 315 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Gm17062-201ENSMUST00000166987 461 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Tspy-ps-202ENSMUST00000172304 321 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Lgals1-ps1-201ENSMUST00000173500 368 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Vmn1r-ps51-201ENSMUST00000175667 320 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Gm22307-201ENSMUST00000180019 107 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Gm27210-201ENSMUST00000184263 402 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Mir6361-201ENSMUST00000185079 101 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Gm29193-201ENSMUST00000187129 830 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Gm28358-201ENSMUST00000187860 636 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 1700025B11Rik-201ENSMUST00000190233 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Gm43717-201ENSMUST00000198684 310 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 4930596I21Rik-201ENSMUST00000200494 461 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Gm18467-201ENSMUST00000208805 434 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 1700061N14Rik-201ENSMUST00000212295 463 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 1700030L22Rik-201ENSMUST00000221214 567 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Gm7822-201ENSMUST00000222433 581 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 AC154623.1-201ENSMUST00000224348 805 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 AC126275.2-201ENSMUST00000225224 253 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 AC159205.4-201ENSMUST00000225964 704 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 AC166105.1-201ENSMUST00000227512 482 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 AC120375.2-202ENSMUST00000228722 397 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Defb7-201ENSMUST00000047851 306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Olfr1031-201ENSMUST00000050942 1011 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Mir19a-201ENSMUST00000083482 82 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Zfp607a-202ENSMUST00000205534 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 9830144P21Rik-202ENSMUST00000127525 3362 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Kif2a-201ENSMUST00000022204 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Cd44-207ENSMUST00000111194 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Tceal1-201ENSMUST00000055104 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Vmn2r14-201ENSMUST00000170341 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Gm29461-201ENSMUST00000189232 4176 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Vmn2r96-201ENSMUST00000165692 2343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Mgam-206ENSMUST00000202779 3821 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Dzank1-204ENSMUST00000163701 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Tcf7l2-213ENSMUST00000111662 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Kif2a-204ENSMUST00000122233 3533 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Cd200r4-202ENSMUST00000176321 2005 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Gm17308-201ENSMUST00000181749 1997 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 5830444F18Rik-201ENSMUST00000194009 1992 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Gm42544-201ENSMUST00000197868 3242 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Huwe1-201ENSMUST00000026292 14579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Gm43961-201ENSMUST00000203289 1872 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Baz2b-201ENSMUST00000090925 7576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Vmn1r84-202ENSMUST00000226408 2898 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Vmn1r84-204ENSMUST00000227427 2880 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Eps15-207ENSMUST00000175776 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Gm44586-201ENSMUST00000207166 2737 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Lmo3-204ENSMUST00000162772 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Fam227b-204ENSMUST00000178118 1599 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Vmn2r35-201ENSMUST00000169683 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Olfr1386-202ENSMUST00000204518 2553 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Cfap70-202ENSMUST00000022349 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 AC155255.1-201ENSMUST00000218751 1428 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Gk-208ENSMUST00000156390 4245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Gm43395-201ENSMUST00000198717 2240 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 A730017L22Rik-201ENSMUST00000128176 3055 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Zfp27-204ENSMUST00000161904 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Igkv9-129-201ENSMUST00000103308 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Tcrg-V5-201ENSMUST00000103556 293 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Gm22952-201ENSMUST00000116720 120 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Gm12805-201ENSMUST00000117305 1048 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Gm12040-201ENSMUST00000118357 537 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Gm11556-201ENSMUST00000120751 288 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Gm13009-201ENSMUST00000121307 267 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 9030622O22Rik-201ENSMUST00000129082 1245 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Gm6956-201ENSMUST00000134724 546 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Gm17148-201ENSMUST00000164702 249 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Gm13040-202ENSMUST00000169056 2104 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Gm17430-201ENSMUST00000171339 474 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Trav7d-4-201ENSMUST00000178768 451 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Trav7-4-201ENSMUST00000181728 451 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Gm28781-201ENSMUST00000185760 696 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Gm29307-201ENSMUST00000187367 696 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Gm17847-201ENSMUST00000188261 1127 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Gm29339-201ENSMUST00000189613 696 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Gm29407-201ENSMUST00000191468 696 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Gm23011-202ENSMUST00000197855 275 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Gm42828-201ENSMUST00000199669 469 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Gm29778-201ENSMUST00000201667 466 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Gm45738-201ENSMUST00000203645 233 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Gm45105-201ENSMUST00000207824 397 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 BC024386-204ENSMUST00000209842 688 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Gm43154-210ENSMUST00000210190 1051 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 AC154627.3-201ENSMUST00000228441 334 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Il18-201ENSMUST00000059081 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Olfr1204-201ENSMUST00000078631 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Gml-201ENSMUST00000096400 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Olfr678-201ENSMUST00000098160 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms