Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Olfr1488-ps1-201ENSMUST00000207436 136 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Gm45458-201ENSMUST00000209900 522 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Gm20586-201ENSMUST00000210122 547 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Gm45651-201ENSMUST00000210857 335 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 AC153526.4-201ENSMUST00000217713 379 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Gm46327-201ENSMUST00000218240 365 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 AC165283.1-201ENSMUST00000223390 307 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Stap1-201ENSMUST00000031171 909 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 A530021J07Rik-201ENSMUST00000066005 414 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Olfr740-201ENSMUST00000089838 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Cd300ld2-201ENSMUST00000092463 381 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Gm28445-201ENSMUST00000187686 1498 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Zfp300-201ENSMUST00000040667 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Rgs21-202ENSMUST00000184189 1674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Gm38091-201ENSMUST00000192418 3871 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Igsf10-202ENSMUST00000193455 8484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Jpx-201ENSMUST00000181020 3802 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Cnot1-201ENSMUST00000068452 8152 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Stk38l-201ENSMUST00000001675 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Kif2a-201ENSMUST00000022204 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Gm19744-204ENSMUST00000188936 4533 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Cxcl15-201ENSMUST00000031322 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Olfr1440-205ENSMUST00000216145 7542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Olfr350-203ENSMUST00000215100 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Gm44542-201ENSMUST00000208677 4314 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 BB287469-201ENSMUST00000110149 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Gm4027-201ENSMUST00000164838 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Cmah-202ENSMUST00000110391 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Ceacam13-202ENSMUST00000108488 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Nectin3-204ENSMUST00000119941 529 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Gm11398-201ENSMUST00000120330 320 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Gm12708-201ENSMUST00000126143 349 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 2610001J05Rik-202ENSMUST00000155856 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Gm23501-201ENSMUST00000157744 256 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Gm3191-201ENSMUST00000167139 346 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Gm27564-201ENSMUST00000185196 96 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Gm18181-201ENSMUST00000190670 736 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Gm2979-201ENSMUST00000193442 463 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Ighv10-4-201ENSMUST00000193702 299 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Gm18660-201ENSMUST00000199542 629 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Gm43710-201ENSMUST00000199583 452 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Gm42579-201ENSMUST00000200512 734 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Gm29815-201ENSMUST00000202418 178 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 4930598N05Rik-204ENSMUST00000207733 675 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 1700014L14Rik-201ENSMUST00000211704 481 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 AC150560.2-201ENSMUST00000227208 171 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Gm6195-201ENSMUST00000063059 357 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Tas2r102-201ENSMUST00000069268 1044 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Olfr220-202ENSMUST00000194229 3286 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Gm45378-201ENSMUST00000211063 2711 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 2900092N22Rik-201ENSMUST00000193601 1409 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Huwe1-202ENSMUST00000112622 14168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Gm26996-201ENSMUST00000204418 1359 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Olfr980-202ENSMUST00000216463 3050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Vmn1r84-202ENSMUST00000226408 2898 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Pkp1P97350 Vmn1r217-203ENSMUST00000228656 9767 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Pkp1P97350 Mapk8-203ENSMUST00000111943 1310 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Pkp1P97350 AC134860.3-201ENSMUST00000223564 1300 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Pkp1P97350 Zfp738-203ENSMUST00000137496 13215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Pkp1P97350 Gm13712-201ENSMUST00000117484 2295 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Pkp1P97350 Serpina6-201ENSMUST00000044159 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Pkp1P97350 Gm28362-201ENSMUST00000189430 2420 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Pkp1P97350 4930562D21Rik-201ENSMUST00000123894 1750 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Pkp1P97350 Abca5-201ENSMUST00000043961 8231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Pkp1P97350 Gm37668-201ENSMUST00000193745 1944 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Pkp1P97350 Olfr657-202ENSMUST00000213297 1948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Pkp1P97350 Olfr639-202ENSMUST00000215653 6570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Pkp1P97350 Igkv1-132-201ENSMUST00000103305 362 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Pkp1P97350 Gm9208-201ENSMUST00000120468 948 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Pkp1P97350 Gm15780-201ENSMUST00000121283 935 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Pkp1P97350 Mup-ps15-201ENSMUST00000121741 539 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Pkp1P97350 Gm6938-201ENSMUST00000123014 771 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Pkp1P97350 6030471H07Rik-201ENSMUST00000125884 492 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Pkp1P97350 Gm22529-201ENSMUST00000158817 123 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Pkp1P97350 Gm17109-201ENSMUST00000163985 358 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Pkp1P97350 Gm23162-201ENSMUST00000175081 121 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Pkp1P97350 Gm24561-201ENSMUST00000175182 95 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Pkp1P97350 Mir3090-201ENSMUST00000175597 87 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Pkp1P97350 Prl3c1-203ENSMUST00000178072 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Pkp1P97350 Gm21959-201ENSMUST00000178439 452 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Pkp1P97350 Gm27036-201ENSMUST00000182465 980 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Pkp1P97350 Gm27044-201ENSMUST00000183033 796 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Pkp1P97350 Gm37577-203ENSMUST00000194712 991 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Pkp1P97350 Gm43531-201ENSMUST00000200676 1114 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Pkp1P97350 Gm32817-201ENSMUST00000210007 689 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Pkp1P97350 Gm17737-201ENSMUST00000210183 1147 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Pkp1P97350 Gm45498-201ENSMUST00000210346 283 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Pkp1P97350 Trdn-202ENSMUST00000217779 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Pkp1P97350 AC159293.2-201ENSMUST00000222289 424 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Pkp1P97350 CT030194.1-201ENSMUST00000225507 532 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Pkp1P97350 AC154371.1-201ENSMUST00000226600 412 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Pkp1P97350 Gm5689-201ENSMUST00000041389 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Pkp1P97350 Olfr803-201ENSMUST00000056736 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Pkp1P97350 Olfr855-201ENSMUST00000061693 992 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Pkp1P97350 Gm9958-201ENSMUST00000068250 1284 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Pkp1P97350 Gm23464-201ENSMUST00000083145 147 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Pkp1P97350 Vmn1r217-202ENSMUST00000227110 9888 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Pkp1P97350 Olfr698-204ENSMUST00000216255 4024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Pkp1P97350 Vps13d-202ENSMUST00000036579 15849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Pkp1P97350 Vmn1r39-206ENSMUST00000228651 2144 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
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